家兔前體脂肪細胞分化不同時期基因表達譜分析

杜坤，毛初陽，任安勇，吳雪梅，李慶玲，陳婷婷，陳仕毅，賴松家

研究報告

家兔前體脂肪細胞分化不同時期基因表達譜分析

杜坤，毛初陽，任安勇，吳雪梅，李慶玲，陳婷婷，陳仕毅，賴松家

四川農業大學，畜禽遺傳資源發掘與創新利用四川省重點實驗室，成都 611130

脂肪的過度積累嚴重危害人類健康。前體脂肪細胞分化是脂肪發育的關鍵過程，研究前體脂肪細胞分化相關基因的表達有助于認識脂肪沉積的機理。盡管家兔是一種理想的研究脂肪發育的動物模型，但是針對其前體脂肪細胞分化不同時期基因表達譜的研究鮮見報道。本研究通過誘導家兔前體脂肪細胞分化，在分化第0 d、3 d和9 d收集脂肪細胞，利用轉錄組測序(RNA-seq)，在分化第3 d樣本與第0 d樣本的比較中篩選出1352個差異表達基因(differentially expressed genes, DEGs)，在分化第9 d樣本與第3 d樣本的比較中篩選出888個DEGs。GO (gene ontology)功能富集和KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析發現，0~3 d分化期上調的DEGs顯著富集在信號通路和信號通路上，3~9 d分化期上調的DEGs顯著富集到與細胞周期調控有關的GO條目和KEGG信號通路，0~3 d和3~9 d階段特異上調的DEGs可能分別作用于細胞質和細胞核。通過DEGs的蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)網絡分析發現，篩選出的核心節點(hub node)基因可能通過調控細胞周期而影響家兔前體脂肪細胞分化。

脂肪細胞；分化；家兔；前體脂肪細胞；RNA-seq

人體脂肪的過度積累與2型糖尿病和心腦血管疾病的形成密切相關[1,2]，嚴重威脅人類健康。脂肪組織結構復雜，具有高度的活性和內分泌功能，其發育過程在細胞水平上主要體現為前體脂肪細胞分化為成熟脂肪細胞[3]，該過程伴隨著脂肪細胞體積的增大和脂質的逐漸累積[4]，是脂肪發育的關鍵過程。……