王濤濤,楊勇,魏唯,林辰濤,馬留銀
研究報告
互花米草NAC轉錄因子家族的鑒定與表達分析
王濤濤1,2,楊勇1,2,魏唯2,林辰濤2,馬留銀2
1. 福建農林大學林學院,福州 350002 2. 福建農林大學基礎林學與蛋白質組學研究中心,福州 350002
互花米草()作為一種海岸帶鹽生植物,高度耐鹽脅迫,但因為缺少參考基因組,其耐鹽的分子機制卻尚未見報道。NAC家族蛋白是植物特有的轉錄因子,調控植物的生長發育和脅迫應答。為了鑒定互花米草NAC蛋白(SaNAC)并探究它們與互花米草生長發育及脅迫響應之間的關系,本研究以互花米草三代全長轉錄組數據為參考,通過與水稻()、擬南芥()和玉米()NAC蛋白序列進行比對,并結合保守功能域進一步篩選,最終找到62個SaNAC蛋白。從蛋白序列比對、進化、motif預測、同源性比較、亞細胞定位、組織表達以及非生物脅迫下的基因差異表達等方面分別對互花米草NAC家族成員進行分析,結果發現SaNAC蛋白均含有保守的NAM結構域,且在進化上與水稻NAC家族具有一定的相似性;SaNAC家族中的兩個蛋白SaNAC9和SaNAC49在細胞核表達;另外,本研究還發現互花米草基因表達具有高度組織和脅迫應答差異性。這些結果表明互花米草NAC轉錄因子家族不僅具有保守的功能域,而且在調控互花米草的生長發育和非生物脅迫響應過程中具有重要的作用。
互花米草;NAC;轉錄因子;基因家族;基因表達
由于固定生長的特點,植物極度依賴其所在的生存環境,因此環境因素對植物生長發育有著深遠的影響[1]。……