嚴 宏,嚴 華
(武漢市第三醫院光谷院區:1.檢驗科;2急診科,湖北武漢 430073)
肺炎克雷伯菌(KP)是臨床主要的條件致病菌之一,主要引起醫院獲得性肺炎及血流感染性疾病,尤其在新生兒、老年人、腫瘤患者等免疫力低下人群,或長期使用抗菌藥物人群中易感[1-2]。碳青霉烯類抗菌藥物因其抗菌譜廣,穩定性較好等優點而被用為治療臨床感染的首選藥物[3]。但隨著該類抗菌藥物頻繁使用,碳青霉烯類耐藥肺炎克雷伯菌(CRKP)逐漸增多。研究發現部分KP可產生莢膜,形成高黏液表型,具有高毒力,高耐藥率等特點[4]。莢膜是KP重要的毒力因子,其種類多變,主要由酸性脂多糖組成,與病原菌的毒力有關。薛娟等[5]研究結果顯示,感染CRKP患者較其他病原菌感染患者病死率顯著增加。因此,對本院分離的CRKP菌株血清莢膜進行分型,研究其具體耐藥機制,有利于對CRKP感染患者進行針對性用藥,減少患者病死率。
1.1菌株來源 收集2016年2月至2018年2月本院各種臨床標本(血液、尿液、痰液、腹腔引流液等),排除同一患者同一部位重復標本,共獲取KP 316例,其中CRKP 126株,男性患者80例(5例患者從不同部位分離到菌株),女性患者38例(3例患者從不同部位分離到菌株);痰液中分離菌株82株,血液中分離24株,尿液中分離7株,腹腔引流液中分離13株。質控菌包括大腸埃希菌ATCC 25922、肺炎克雷伯菌ATCC BAA-1705、肺炎克雷伯菌ATCC BAA-1706。本研究所有菌株均采用Vitek2-Compact全自動微生物鑒定儀進行鑒定。本研究經醫院倫理委員會批準。
1.2儀器與試劑 主要包括Vitek-2 Compact全自動微生物鑒定儀及配套藥敏卡、細菌濁度儀、凝膠成像系統、PCR儀、ABI-PRISM 3730測序儀、DYC-6C電泳儀。PCR反應試劑盒購自日本TaKaRa公司。
1.3方法
1.3.1菌株鑒定及藥敏試驗 本研究采用Vitek-2 Compact全自動微生物鑒定儀對分離菌株進行體外藥物敏感試驗,參照美國臨床和實驗室標準協會(CLSI)規定標準[6],美國食品藥品監督管理局(FDA)標準[7]判讀替加環素敏感性,進一步確定CRKP和不耐藥的KPN(non-CRKP)。
1.3.2黏液絲試驗 將菌種接種于血瓊脂平板,35 ℃培養過夜,以接種環輕輕挑起菌落后,黏液絲長度≥5 mm為試驗陽性,重復三次以上均陽性者為黏液菌株。
1.3.3碳青霉烯酶表型檢測 (1)改良Hodge試驗:將配制好的0.5麥氏濁度的大腸埃希菌ATCC 25922菌液稀釋,將菌液均勻涂布于MH平板,3~5 min后,在培養基中央放置美羅培南紙片,挑選3~5個待測菌種純菌落垂直于紙片,自紙片外緣向平板邊緣劃線接種,以ATCC BAA-1705為陽性對照,ATCC BAA-1706為陰性對照,35 ℃培養孵育16~18 h。評價標準:待測菌株與大腸埃希菌ATCC 25922抑菌圈交界處出現向內增強生長,抑菌圈不規則,表明該待測菌種為碳青霉烯酶菌株。(2)碳青霉烯酶抑制試驗(CIM):以ATCC BAA-1705為陽性對照,ATCC BAA-1706為陰性對照,將待測菌種混入1.5 mL無菌雙蒸水內,加入亞胺培南紙片(10 μg),35 ℃培養孵育4 h,將配制好的0.5麥氏濁度的大腸埃希菌ATCC 25922菌液稀釋,將菌液均勻涂布于MH平板培養基,取出孵育好的紙片貼于MH平板,35 ℃培養過夜,觀察結果。結果評價標準:大腸埃希菌ATCC 25922生長不受抑制,為產碳青霉烯酶菌株;大腸埃希菌ATCC 25922生長受抑制,為不產碳青霉烯酶菌株。
1.3.4PCR檢測血清莢膜、耐藥基因及高毒力基因 利用PCR法檢測擴增菌株K1、K2、K5、K20、K54、K57等常見莢膜基因型,常見碳青霉烯酶耐藥基因KPC、NDM、VIM、IMP、OXA-48,β-內酰胺酶基因TEM、SHV、CTX-M,膜孔蛋白基因Ompk35、Ompk36,AmpC酶基因DHA,常見毒力基因magA、rmpA、rmpA2、aerobactin、wcaG、mrkD、iroN、allS,引物、反應體系及反應條件參考文獻[8],序列見表1。

續表1 擴增基因的引物序列
注:F代表上游引物;R代表下游引物。
2.1藥敏檢測結果 本研究共分離出CRKP 126株,占39.87%。126株CRKP菌株中,對頭孢菌素類、酶抑制劑類、碳青霉烯類、單環類藥物耐藥率最高,顯著高于non-CRKP菌株(P<0.05),替加環素類耐藥率最低,與non-CRKP菌株差異無統計學意義(P>0.05)。見表2。
2.2碳青霉烯酶表型檢測結果 改良Hodge試驗陽性106株,陽性率33.54%;CIM試驗陽性117株,陽性率37.03%。見圖1。
2.3血清莢膜分型及毒力基因 12株CRKP為黏液絲試驗陽性,均未檢測到K1、K2、K5、K20、K54、K57血清型。所有CRKP中,檢測出K1血清型10株,均攜帶黏液表型調控基因rmpA基因,K2、K5、K20、K54、K57血清型均未檢測到,尚未分型116株。126株CRKP均檢測到毒力基因fimH基因,比例最高(100%),見表3。

表2 藥敏試驗結果的比較[n(%)]

續表2 藥敏試驗結果的比較[n(%)]

注:A表示改良Hode試驗,B表示CIM試陽。圖A中,1為ATCC1705,2為ATCC1706,3為陽性菌株;圖B中,1為ATCC1706,2為陽性菌株,3為ATCC1705。
圖1碳青霉烯酶表型檢測

表3 毒力基因的分布
2.4耐藥基因及膜孔蛋白檢測結果 126株CRKP中,檢測出A類碳青霉烯酶KPC基因117株,NDM基因6株,IMP基因3株;β-內酰胺酶基因TEM基因53株,SHV基因100株,CTX-M基因112株,膜孔蛋白Ompk35基因缺失50株,Ompk36基因缺失94株,其中,缺失Ompk35膜孔蛋白基因的菌種均同時缺失Ompk36基因。見表4。
2.5CRKP攜帶耐藥基因情況 CRKP中攜帶4種不同耐藥基因的菌株數目最多,共64株,攜帶6種及不攜帶耐藥基因的菌株數目最少,僅有1株。見表5。

表4 耐藥基因及膜孔蛋白檢測結果

表5 CRKP攜帶耐藥基因情況
KP作為臨床重要的條件致病菌之一,近年來,研究顯示,其對主要的抗菌碳青霉烯類藥物耐藥率不斷上升,CRKP比例不斷上升,部分地區有暴發流行趨勢。已有研究表明,CRKP感染患者病死率顯著增加[5]。CRKP引起患者死亡主要與其多重耐藥、毒力表達有關[9]。目前研究結果顯示,CRKP主要耐藥機制為菌體產生碳青霉烯酶,可水解抗菌藥物[10]。此外,還有研究報道,其耐藥性可能與AmpC酶合并外膜孔蛋白通透性改變有關[11]。本研究從本院患者臨床標本中分離出CRKP 126株,占39.87%,其中對頭孢菌素類、酶抑制劑類、碳青霉烯類、單環類藥物耐藥率最高,顯著高于non-CRKP菌株,替加環素類耐藥率最低,與non-CRKP菌株差異無統計學意義,表明CRKP對多類抗菌藥物耐藥,本研究結果提示,臨床可對CRKP使用替加環素治療。
莢膜作為KP重要的毒力因子,主要由酸性脂多糖組成,其中甘露糖與莢膜毒力有關,研究顯示,高毒力KP可產生大量莢膜多糖,莢膜呈高黏液表型,是重要的致病因素[12]。本研究通過黏液絲試驗表明,分離得到的126株CRKP中,共有12株為高黏液絲菌株。根據K抗原分型,目前莢膜有80多種血清分型,常見的主要是K1、K2、K5、K20、K54、K57。以往研究表明,K抗原在高黏液性毒力KP上檢出率高達85%[13],在本研究檢出的12株高黏液菌株中,均未檢測到K抗原,與馮曉靜等[12]研究結果不符,推測原因可能為該12株菌株表達為其他未檢測莢膜分型,或是獲得耐藥性后莢膜基因表達減弱。126株 CRKP中,檢測出K1血清型10株,均攜帶黏液表型調控基因rmpA基因,但均未表現出高黏液表型,目前關于rmpA基因與高黏液表型的關系仍未得到闡明,具體原因有待進一步研究分析。在本研究中,各種毒力基因均有不同程度表達,毒力基因fimH基因比例最高。陳妍妍等[14]報道發現,菌毛黏附在細菌感染中發揮重要作用,fimH基因是介導Ⅰ型菌毛的基因,與王歡歡等[15]報道KP中普遍存在Ⅰ型菌毛一致,提示fimH基因是CRKP中重要的毒力基因。
碳青霉烯酶主要分為A、B、D類,A類酶主要包括KPC、SME、NMC、IMI、GES等基因,B類酶又稱為β-內酰胺酶,包括IMP、VIM、NDM、SIM、GIM等基因。KPC作為我國目前流行的A類碳青霉烯酶,可水解大多數青霉素類、頭孢素類抗菌藥物。本研究采用改良Hodge試驗及CIM試驗檢測菌株碳青霉烯酶表型,結果顯示改良Hodge試驗陽性106株,CIM試驗陽性117株,其中CIM試驗檢測結果與PCR結果一致,推測可能是由于部分菌株產碳青霉烯酶量較少,致使結果判斷出現假陰性。PCR結果表明,檢測出A類碳青霉烯酶KPC基因117株,NDM基因6株,IMP基因3株;β-內酰胺酶基因TEM基因53株,SHV基因100株,CTX-M基因112株,膜孔蛋白Ompk35基因缺失50株,Ompk36基因缺失94株,其中,缺失Ompk35膜孔蛋白基因的菌種均同時缺失Ompk36基因,提示本院分離到的126株CRKP中,主要耐藥機制為產碳青霉烯酶,同時合并有部分菌株膜孔蛋白通透性改變。本研究統計分析發現,分離獲得的126株CRKP中,以攜帶4種不同耐藥基因的菌株數目最多,提示在臨床工作中要采用不同方法對菌株的耐藥機制進行檢測,選擇合適藥物進行治療。
本研究分離獲得的CRKP主要耐藥機制為產碳青霉烯酶,部分菌株合并有膜孔蛋白基因缺失,但關于CRKP莢膜血清分型尚不清楚,將進一步進行探究。