大熊貓源致病大腸桿菌CCHTP全基因組測序及耐藥和毒力基因分析

鄧雯文，李才武，趙思越，李仁貴，何永果，吳代福，楊盛智，黃炎，張和民，鄒立扣

大熊貓源致病大腸桿菌CCHTP全基因組測序及耐藥和毒力基因分析

鄧雯文1，李才武1，趙思越2，李仁貴1，何永果1，吳代福1，楊盛智2，黃炎1，張和民1，鄒立扣2

1. 中國大熊貓保護研究中心，大熊貓國家公園珍稀動物保護生物學國家林業和草原局重點實驗室，都江堰 611830 2. 四川農業大學資源學院，成都 611130

致病性大腸桿菌是引起動物泌尿系統感染的重要病原菌，本研究對泌尿生殖道感染出現潛血的大熊貓尿液中分離的一株致病性大腸桿菌(CCHTP)進行全基因組測序，檢測其中耐藥基因和毒力因子的情況，同時對基因島上耐藥和毒力基因及其基因環境進行研究。研究發現，大腸桿菌CCHTP中存在多種類型的耐藥基因，其中外排泵系統基因數量最多，包括A、E和N等介導多重耐藥外排泵的基因。此外，該菌還攜帶166種毒力因子及563個相關毒力基因，其中屬于黏附與侵襲類的毒力因子及相關基因數量最多。對19個基因島分析發現，基因島GIs011和GIs017中各有一段包含耐藥和毒力基因的序列，兩側與可移動遺傳元件(轉座酶和插入序列)相連，這些結構可能介導耐藥及毒力基因水平轉移。本研究通過全基因組測序分析了大熊貓源致病性大腸桿菌中存在的耐藥及毒力基因情況，對大熊貓相關疾病的科學治療、合理用藥有重要意義。

大熊貓；大腸桿菌；全基因組測序；耐藥基因；毒力因子

大腸桿菌()通常存在于人和動物的胃腸道，屬于條件性致病菌，在宿主健康的情況下，可起到保護宿主、防止病原菌定植的作用，但在特定情況下會產生致病性[1]。……