陳 照 李培征 劉惠芳 李秀芳 劉文波③ 秦春秀③
(1海口市秀英區農林局 海南海口570100;2海南大學植物保護學院/熱帶農林生物災害綠色防控教育部重點實驗室 海南海口570228)
芽孢桿菌(Baci l lussp.)是人們熟知的一類重要的生防微生物,在自然界分布廣泛,具有生長速度快、營養需求簡單、較強的耐熱性和抗逆性、在植物表面易于存活與繁殖等特性[1]。芽孢桿菌代謝產物較為豐富,如脂肽類、多糖、磷脂類、聚酮類、多烯類物質等[2],部分菌株還可以分解土壤中的不溶性磷酸鹽;對人畜無害,不污染環境,作為生防菌,具有施用方便,能為農業可持續發展提供幫助[3];一些種類的芽孢桿菌不僅有防病作用,還能促進植物增產,也可以改善植物根際周圍環境,刺激和調控植物生長,抑制植物的病害發生[4],包括根部病害、枝干病害、一些植物的立枯病菌、黃萎病菌、炭疽病菌等[5]。
解淀粉芽孢桿菌(B.amyloliquefaciens)與枯草芽孢桿菌(B.subt i l is)是兩類重要的生防細菌,親緣性很高[6],許多表型特征非常相似,僅通過形態、培養特征及其生理生化很難區分,只有通過進一步基因序列比較才能將兩者區分開來[7]。解淀粉芽孢桿菌是一種好氧的革蘭氏陽性桿狀細菌;有大于菌體的次末端芽孢;芽孢卵圓型,孢囊膨大;最適生長溫度為28~30℃,最適生長pH為6.5~7.0。它具有還原硝酸鹽;水解淀粉;可利用D-葡萄糖,L-阿拉伯糖,甘露醇,D-木糖作為碳源;接觸酶陽性;氧化酶陰性等生理生化性質[8]。
B.amyloliquefaciensHAB-9菌株是從海南省儋州市兩院檳榔土中分離篩選得到,室內研究表明,其對檳榔炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)等17株植物病原真菌均具有拮抗活性。本文對它進行16S rDNA鑒定,并對其生化特征測定及抑菌譜進行研究,為實現該生防細菌的抑菌機理提供參考依據。
1.1.1 供試細菌、真菌
供試細菌:HAB-9,從檳榔樹根際土壤中分離保存。
供試真菌:所有菌株均由海南大學植物保護學院分子植物病理學實驗室提供,并經單孢分離純化后備用,見表1。

表1 供試植物病原真菌
1.1.2 培養基
LB固體培養基:酵母粉5 g,胰蛋白胨10 g,氯化鈉10 g,瓊脂16 g,蒸餾水定容至1 000mL,pH7,121℃蒸氣滅菌20min。
PDA固體培養基:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂粉16 g,蒸餾水定容至1 000mL,121℃蒸氣滅菌20min。
M.R、V-P測定培養基:蛋白胨5 g,葡萄糖5 g,氯化鈉5 g,蒸餾水定容至1 000mL,pH 7~7.2,每管分裝4~5 mL,然后在115℃蒸氣滅菌30min。
解淀粉培養基:在肉汁胨中加0.2%可溶性淀粉,蒸餾水定容至1 000mL,分裝三角瓶,121℃蒸氣滅菌20min,倒平板備用。
1.1.3 主要儀器
滅菌鍋(HVE-50),電子天平(OHA),顯微鏡(OLYMPUS),恒溫搖床 (Innova4230),移液槍(eppendor f),制冰機 (SANYO),恒溫水浴鍋(Polscience), HH-B11恒溫培養箱,PCR儀(eppendor f),分光光度計(penk),凝膠成像系統(北京六一),電泳儀(北京君意),微波爐(格蘭仕)等。
1.2.1 生防細菌的分子生物學鑒定
從劃線培養的平板上挑取HAB-9單菌落接種到100mLLB液體培養基中,28℃,200 r/min振蕩培養 過 夜 。 27F: 5’ -AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’;1492R:5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’引物進行PCR擴增,引物由深圳華大基因股份有限公司合成。反應體系:25μL體系中含有10×PCRbuf fer 2.5 μL,dNTPs 2.0 μL,27F 1.0 μL,1492R 1.0 μL,菌液1.0μL,Trans Taq酶 0.2μL,ddH2O 17.3 μL。反應條件:94℃ 5 min,94℃ 1 min,50℃ 30 s,72℃ 2min,30個循環;72℃ 10min[9];PCR產物,經1%瓊脂糖凝膠電泳膠回收后,連接到pMDTM18-TVector載體,轉化到感受態細胞DH5α。篩選陽性克隆送上海生工基因股份有限公司進行測序。
1.2.2 HAB-9菌株的生化特征測定
進行M.R測定、V-P測定、淀粉水解、氧化酶測定、接觸酶測定等[10],并對其進行革蘭氏染色[11]。
1.2.3 HAB-9菌株對植物病原真菌的拮抗作用
采用平板對峙培養法進行生防菌對多種病原真菌的拮抗作用測定。在PDA培養基中心接種直徑4.0mm的病原真菌的菌餅,在距中心25.00mm的成正方形的4個點分別接種待測菌株,各處理4個重復,置于28℃黑暗培養,待對照組病原真菌長滿整皿后,觀察處理組有無抑菌圈及抑菌圈的大小,分別測定處理組及對照組的菌落直徑,計算抑菌率。抑制率=

1.2.4 數據分析
所有試驗均重復4次,數據采用Excel 2016、SPSS19.0和SAS9.2進行統計分析。
2.1.1 PCR產物回收
PCR產物經過1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,獲得約為1 500 bp大小的片段PCR電泳產物及回收(圖1)。

圖1 HAB-9菌株PCR擴增產物電泳圖
2.1.2 轉化子的菌落PCR檢測
隨機挑取5個白色菌落培養菌液為模板進行PCR擴增,PCR產物經1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。所挑選的轉化子均擴增得到1 500 bp左右的條帶,為陽性克隆(圖2)。
2.1.3 序列分析
挑選陽性克隆,送往深圳華大基因公司測序,并對測序結果進行分析。經NCBI的Blast搜索16SrDNA進行比對,并通過DNAstar軟件構建系統進化樹(圖3)。結果顯示HAB-9為解淀粉芽孢桿菌,與其遺傳距離最近的登錄號為AB813716.1。

圖2 HAB-9菌株ITS結果PCR
2.2.1 革蘭氏染色
由圖4可知,HAB-9菌株革蘭氏染色為深紫色,呈陽性。
2.2.2 M.R測定及V-P測定
由圖5可知,M.R測定,HAB-9菌株呈陰性;V-P測定,HAB-9菌株呈陽性。
2.2.3 氧化酶及接觸酶測定
HAB-9菌株氧化酶測定均呈陰性,接觸酶測定呈陽性。
2.2.4 淀粉水解
由圖6可知,解淀粉測定,HAB-9中間均形成明顯的透明圈,有解淀粉功能。
采用平板對峙法培養后,經后期統計處理,結果如下:HAB-9菌株對17種植物病原真菌的抑菌作用見圖7,通過計算HAB-9菌株對各真菌的平均抑制率。進行比較(表2),表明HAB-9菌株對17種病原真菌的抑菌率存在差異,主要對炭疽病菌有很好的抑菌效果。

圖3 HAB-9菌株16srDNA比對及進化樹
對解淀粉芽孢桿菌HAB-9菌株進行了16S rDNA鑒定、生化特征測定及對17種病原真菌的拮抗作用的研究。通過序列分析,HAB-9菌株與解淀粉芽孢 桿 菌 (B.amyloliquefaciens)(GenBank NO.GQ169782.1)的相似度為99%,初步推斷為解淀粉芽孢桿菌;經革蘭氏染色、M.R測定、V-P測定、淀粉水解、氧化酶測定、接觸酶測定,都符合解淀粉芽孢桿菌的特性[10],可以認定為解淀粉芽孢桿菌。

圖4 革蘭氏染色

圖5 M.R測定和V-P測定

圖6 解淀粉測定
芽孢桿菌對植物病原真菌的拮抗作用很多人已經做過,常用的方法有抑菌圈法、對峙培養法、搖瓶菌絲生長抑制法等[8]。不同的方法存在著優缺點,本實驗中采取了平板對峙培養法測定了HAB-9對17株植物病原真菌的拮抗作用。實驗結果表明HAB-9對17種不同植物病原真菌均有不同程度的拮抗作用,發現HAB-9對檳榔炭疽病(C.gloeosporioides)有較好的拮抗作用,其抑菌率為70.59%;效果最差的為來自海南保亭橡膠樹棒孢霉落葉病菌C.cassiicola),抑菌率為50.22%。

表2 HAB-9菌株對17種病原真菌抑菌率統計結果(%)
根據實驗結果來看,解淀粉芽孢桿菌HAB-9在實驗中對炭疽病菌及其他植物病原菌有抑制作用,抑制率都超過了50.00%,對不同種炭疽病菌抑制程度不一樣,特別是對檳榔炭疽效果最好。解淀粉芽孢桿菌可以開發為生防菌,研究成生物農藥,但是要將一種生防菌開發成一種商品就要考慮到生產成本問題,還有開發成商品之后在田間的使用效果等。據有關文獻記載,雖然芽孢桿菌的研究已經取得了很大的進步,但仍存在著一些問題。解淀粉芽孢桿菌屬于芽孢桿菌屬,將其開發成生物農藥一樣要面臨著這些問題,諸如:(1)生產成本:生防菌與化學農藥相比分泌量比較低,生產周期比較長,這些因素都相應地增加了生產成本。(2)應用問題:將生物殺菌劑投入田間使用,生防菌的性能可能會受到田間微生物、溫度、pH值等因素影響而發生變化作用,從而影響抑菌性能;生防菌與土壤本身存在的微生物的排斥;另外田間存在的農藥不適宜生防菌的繁殖[12]。
然而,當今世界隨著分子研究技術和科學技術的提高,解淀粉芽孢桿菌的基因功能更多的被了解,諸如上面所提到的一些問題勢必也能一一解決,解淀粉芽孢桿菌開發成生物農藥會被廣泛地應用。將更多生防菌開發成生物農藥也是歷史發展的必然趨勢。用不同的生防菌聯用,以增強其生防效果[13],從而充分發揮生防菌的優勢,為農業生產提供保障,造福人類。

圖7 HAB-9菌株對17種病原菌抑菌作用