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蠟樣芽胞桿菌在不同標(biāo)本中的毒力基因分布特征

2019-09-19 11:26:20張慧娟張恩民賀金榮魏建春
關(guān)鍵詞:差異

張慧娟,張恩民,賀金榮,李 偉,魏建春

蠟樣芽胞桿菌(簡(jiǎn)稱蠟樣桿菌)在自然界廣泛分布,常存在于土壤、灰塵和昆蟲中,植物和許多生熟食品中也常見,臨床上該菌被認(rèn)為是一種機(jī)會(huì)致病菌常引起食源性疾病,也被認(rèn)為是一種污染菌引發(fā)外傷性眼內(nèi)炎、骨科創(chuàng)面感染以及在腫瘤等免疫低下人群中引起院內(nèi)感染等腸道外感染疾病[1]。

研究表明,無(wú)論是腸道內(nèi)還是腸道外感染,發(fā)病均與該菌分泌的毒素導(dǎo)致組織破壞或胞外酶活性產(chǎn)物有關(guān),編碼這些毒素的毒力基因主要包括溶血性BL基因(hblC、hblD、hblA、hblB)、非溶血性基因(nheA、nheB、nheC)、腸毒素FM基因和T基因(entFM、bceT)、細(xì)胞毒素K基因(cytK)和嘔吐毒素相關(guān)基因(ces)[2]。但并不是所有蠟樣桿菌都含有全部毒力基因,而是存在菌株間的差異,不同的毒力基因分布與疾病的嚴(yán)重程度呈相關(guān)性[3]。我國(guó)部分地區(qū)已在食品的常規(guī)監(jiān)測(cè)中開展了蠟樣桿菌的污染與毒力基因的檢測(cè)工作,本研究中采集了我國(guó)12個(gè)省的不同分離來(lái)源的標(biāo)本進(jìn)行了毒力基因的檢測(cè),以期深入了解臨床相關(guān)蠟樣桿菌的遺傳分布特征,為相關(guān)疾病的診斷處置提供科學(xué)的參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1菌株 菌株包括分離自中國(guó)河北、海南、云南、內(nèi)蒙、四川、陜西、福建等12個(gè)省的蠟樣桿菌330株和購(gòu)買的模式菌株3株(ATCC10876、ATCC13061和CMCC63301),分離來(lái)源分為環(huán)境監(jiān)測(cè)標(biāo)本(常規(guī)食品微生物監(jiān)測(cè)及土壤)和疾病相關(guān)標(biāo)本(食物中毒食品及腸道外感染)2大類,具體包括米粉(96株)、奶粉(125株)、土壤(92株)、米飯(8株)、涼皮(5株)、眼內(nèi)炎(2株)或腫瘤患者(2株)等6種標(biāo)本,所有菌株均由本室保存。

1.2 毒力基因檢測(cè)

1.2.1合成引物 針對(duì)上述的11個(gè)蠟樣桿菌可能含有的毒力基因,參考文獻(xiàn)檢索引物序列[4-5],每對(duì)引物經(jīng)NCBI Blast比對(duì)驗(yàn)證,確為相應(yīng)毒力基因片段,引物合成由北京天一輝遠(yuǎn)生物科技有限公司完成,引物序列及擴(kuò)增片段長(zhǎng)度見表1。

1.2.2PCR擴(kuò)增 常規(guī)煮沸法制備菌株DNA模板,普通酶鏈聚合反應(yīng)(PCR)方法擴(kuò)增所有毒力基因片段,同時(shí)設(shè)立陽(yáng)性和陰性對(duì)照。PCR反應(yīng)體系為25 μL,包括2×EasyTaqTMPCR SuperMix(購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司)12.5 μL,上下游引物各1 μL(濃度10 μM),DNA模板1 μL(濃度為100 ng/μL左右), 加無(wú)菌超純水補(bǔ)足至25 μL。PCR反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性1 min, 55 ℃退火1 min, 72℃延伸1 min,共30循環(huán); 72 ℃最后延伸5 min,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

表1 本研究檢測(cè)毒力基因所用引物
Tab.1 Primers for virulence genes ofB.cereus

基因引物引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度/bphblAHA-FTTACCTGGTAGAATCGTA-CAAGATC164HA-RCCTGTATTAATCGCTTCTACCAT-TGhblBHB-FAAGCAATGGAATACAATGGG2 685HB-RAATATGTCCCAGTACACCCGhblCHC-FCCTATCAATACTCTCGCAA695HC-RTTTCCTTTGTTATACGCTGChblDHD-FACCGGTAACACTATTCATGC830HD-RGAGTCCATATGCTTAGATGCnheANA-FGTTAGGATCACAATCACCGC756NA-RACGAATGTAATTTGAGTCGCnheBNB-FGTGCAGCAGCTGTAGGCGGT328NB-RATGTTTTTCCAGCTATCTTTCG-CAATnheCNC-FTGGATTCCAAGATGTAATG684NC-RATTACGACTTCTGCTTGTGCcesNrps-FGACAAGAGAAATTTCTACGAG-CAAGTACAAT635Nrps-RGCAGCCTTCCAATTACTCCTTCT-GCCACAGTbceTBceT-FGACTACATTCACGATTACG-CAGAA304BceT-RCTATGCTGACGAGCTACATCCATAentFMentFM-FGTTCGTTCAGGTGCTGGTAC486entFM-RAGCTGGGCCTGTACGTACTTcytKcytK-FCGACGTCACAAGTTGTAACA565cytK-RCGTGTGTAAATACCCAGTT

1.3結(jié)果分析 采用SPSS21.0軟件,檢驗(yàn)水準(zhǔn)為α=0.05統(tǒng)計(jì)菌株檢測(cè)陽(yáng)性毒力基因的數(shù)量,單因素方差分析不同標(biāo)本毒力基因數(shù)的差異;計(jì)算菌株不同毒力基因的攜帶率,行×列資料卡方檢驗(yàn)分析不同標(biāo)本毒力基因攜帶率的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

2 結(jié) 果

2.1菌株毒力基因攜帶情況 333株蠟樣桿菌11種毒力基因的檢測(cè)結(jié)果顯示,菌株所含毒力基因數(shù)量最少0個(gè)(30株,占9.01%),最多10個(gè)(41株,占12.31%),含4個(gè)毒力基因的菌株數(shù)量最多,占19.22%,其次是5個(gè)(16.82%)和9個(gè)(16.22%),菌株平均攜帶毒力基因數(shù)5.97個(gè)。90.99%(303/333)的菌株檢出至少含有1個(gè)毒力基因,毒力基因在3個(gè)以上的菌株占到88.29%(225/333),含有5個(gè)毒力基因以上的菌株占67.57%(294/333),除嘔吐毒素基因外,全部10個(gè)毒力基因均檢出的菌株占12.31%(41/333)(圖1)。

圖1 菌株攜帶毒力基因個(gè)數(shù)Fig.1 Distribution of gene numbers of studied strains

2.2不同類型標(biāo)本毒力基因數(shù)量比較 常規(guī)食品監(jiān)測(cè)的米粉和奶粉中毒力基因個(gè)數(shù)分別為5.78和5.71個(gè),而在病例相關(guān)采集標(biāo)本的米飯、涼皮和患者中基因個(gè)數(shù)分別達(dá)到了7.13,8.2和8.75個(gè),均高于平均值,方差分析顯示,6種樣品的毒力基因攜帶數(shù)量之間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著差異(F=1.917,P>0.05),但兩兩比較顯示,患者與奶粉的基因個(gè)數(shù)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異有顯著性(F=5.482,P<0.05),涼皮與奶粉間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著性(F=4.479,P<0.05),其他類型樣品兩兩間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(表2)。

2.3不同類型標(biāo)本毒力基因攜帶率比較 毒力基因中非溶血性基因攜帶率最高,同時(shí)含有3種非溶血性基因(nheA、nheB、nheC)的菌株占61.86%,至少含有一種此基因的菌株則達(dá)89.19%;其余基因攜帶率從高到低依次為entFM基因(79.88%)、bceT基因(49.85%)、溶血性BL基因(48.35%)、ctyK基因(47.75%)和ces基因(1.50%)。其中,溶血性基因中hblB攜帶率較低(38.14%),其他3種(hblA、hblC和hblD)攜帶率較高。

表2 不同樣本類型蠟樣桿菌毒力基因攜帶情況
Tab.2 Distribution of virulence gene numbers ofB.cereusin different specimens

樣品類型樣品數(shù)毒力基因平均數(shù)米粉965.78奶粉1255.71土壤926.22米飯87.13涼皮58.2患者48.75合計(jì)3305.97

不同類型標(biāo)本毒力基因的攜帶率之間有差異,將樣本數(shù)較低(涼皮、眼內(nèi)炎和腫瘤患者)的標(biāo)本除外,其余標(biāo)本的各基因攜帶率比較顯示,米飯、米粉、奶粉和土壤的溶血性基因攜帶率有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著性(χ2=15.071,P<0.01),米粉和奶粉的攜帶率較低,土壤攜帶較高;而非溶血性基因則在土壤中攜帶較低,其它標(biāo)本中較高(χ2=9.603,P<0.05);entFM基因也在土壤中較低,其它標(biāo)本中較高(χ2=21.634,P<0.01);cytK、bceT和ces基因在不同標(biāo)本中的攜帶率均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著性(表3)。

將樣本數(shù)較少的標(biāo)本合并,比較疾病相關(guān)與環(huán)境監(jiān)測(cè)兩類標(biāo)本的毒力基因攜帶情況,表4顯示溶血性基因在疾病標(biāo)本中攜帶較高,有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(χ2=8.23,P<0.01),其余基因在兩類標(biāo)本中的攜帶率無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

3 討 論

蠟樣桿菌作為一種重要的食源性疾病病原菌,在食品中的污染狀況和毒力基因分布近年來(lái)被廣泛關(guān)注。研究數(shù)據(jù)顯示,食品中的蠟樣檢出率多在10%以上,嬰幼兒食品和奶粉中在10%~30%,熟制米面制品中在20%~30%左右,在快餐盒飯、鐵路食品及市場(chǎng)攤點(diǎn)中污染更重,有的可達(dá)50%[6-10],腐乳類食品和大米中的蠟樣檢出率可高達(dá)80%[11-12]。同時(shí),醫(yī)院內(nèi)感染中,在開放性創(chuàng)傷的患者伴免疫力低下人群中蠟樣桿菌的分離率較高,眼內(nèi)炎也較多見,外傷所致的細(xì)菌性眼內(nèi)炎中蠟樣芽胞桿菌感染率僅次于金黃色葡萄球菌,位居第2,并且進(jìn)展迅速,急驟惡化,可造成視網(wǎng)膜毀滅性損害[13],是醫(yī)院感染中不可忽視的一種重要病原菌。

表3 各毒力基因在不同類型標(biāo)本中的分布
Tab.3 Distribution of virulence genes ofB.cereusin different specimens

基因總攜帶率(n=333)不同類型標(biāo)本的基因攜帶率(%)涼皮(n=5)米飯(n=8)米粉(n=96)奶粉(n=125)土壤(n=92)眼內(nèi)炎(n=2)腫瘤患者(n=2)其他(n=3)hblC48.35(161)80(4)62.5(5)38.54(37)38.4(48)67.39(62)100(2)100(2)33.33(1)hblD46.85(156)80(4)75(6)38.54(37)38.4(48)60.87(56)100(2)100(2)33.33(1)hblA45.65(152)80(4)62.5(5)38.54(37)36(45)60.87(56)100(2)100(2)33.33(1)hblB38.14(127)80(4)37.5(3)32.29(31)31.2(39)50(46)100(2)50(1)33.33(1)同時(shí)含4個(gè)hbl37.24(124)80(4)37.5(3)32.29(31)29.6(37)48.91(45)100(2)50(1)33.33(1)含任一hbl48.35(161)80(4)75(6)38.54(37)36.8(46)68.48(63)100(2)100(2)33.33(1)nheA84.38(281)100(5)100(8)83.33(80)87.2(109)80.43(74)50(1)100(2)66.67(2)nheB72.37(241)80(4)87.5(7)78.13(75)81.6(102)52.17(48)100(2)100(2)33.33(1)nheC82.28(274)100(5)100(8)86.46(83)86.4(108)69.57(64)100(2)100(2)66.67(2)同時(shí)含3個(gè)nhe61.86(206)80(4)87.5(7)67.71(65)68(85)44.57(41)50(1)100(2)33.33(1)含任一nhe89.19(297)100(5)100(8)90.62(87)93.6(117)80.43(74)100(2)100(2)66.67(2)ctyK47.75(159)60(3)50(4)48.96(47)36.8(46)60.87(56)50(1)50(1)33.33(1)ces1.50(5)00(0)1.04(1)3.2(4)0(0)0(0)0(0)0.00 entFM79.88(266)100(5)87.5(7)87.5(84)87.2(109)59.78(55)100(2)100(2)66.67(2)bceT49.85(166)60(3)50(4)44.79(43)44.8(56)59.78(55)50(1)100(2)66.67(2)

注:n表示樣本總數(shù),括號(hào)內(nèi)數(shù)字表示相應(yīng)基因擴(kuò)增陽(yáng)性數(shù)。

表4 疾病相關(guān)標(biāo)本與環(huán)境監(jiān)測(cè)標(biāo)本中毒力基因攜帶差異
Tab.4 Different carrying rate between clinical and enviromental monitoring specimens

基因類型疾病相關(guān)標(biāo)本環(huán)境監(jiān)測(cè)標(biāo)本陽(yáng)性數(shù)陽(yáng)性率(%)陽(yáng)性數(shù)陽(yáng)性率(%)χ2值P值hbl1482.3514646.658.230.00nhe1710027888.821.110.14ctyK952.9414947.60.180.18ces0051.60.240.77entFM1694.1224879.231.400.09bceT1058.8215449.20.600.15

蠟樣桿菌攜帶的毒力基因與致病性密切相關(guān),食品中蠟樣桿菌毒力基因的調(diào)查顯示非溶血性基因和腸毒素FM基因的攜帶率均達(dá)90%左右,少數(shù)報(bào)道顯示腸毒素FM基因和T基因的攜帶率較低,約為20%~30%;溶血性基因和細(xì)胞毒素K基因的攜帶率不到50%,尤其是hblC和hblD的攜帶率有20%[6-7];嘔吐毒素基因的檢出率最低,多在5%以下,但大米中含量較高,可達(dá)13.8%[12]。

本研究中菌株來(lái)源除了常規(guī)食品監(jiān)測(cè)樣本外,還包含了土壤分離菌株,食物中毒、眼內(nèi)炎、腫瘤患者等疾病相關(guān)標(biāo)本分離菌株,重點(diǎn)分析了已知的蠟樣桿菌11個(gè)毒力基因的分布特征,尤其是在疾病相關(guān)標(biāo)本中的特點(diǎn),可為探索毒力基因的致病性提供參考。研究顯示,約90%的蠟樣菌株攜帶至少3個(gè)毒力基因,且約10%的菌株攜帶除嘔吐毒素基因外的所有毒力基因,菌株攜帶的平均毒力基因數(shù)目為5.97個(gè),疾病相關(guān)標(biāo)本所攜帶的毒力基因數(shù)目高于環(huán)境監(jiān)測(cè)標(biāo)本。各個(gè)基因的分布特點(diǎn)顯示,與大多數(shù)報(bào)道一致[1,6-7],非溶血性基因和腸毒素FM基因在菌株中的攜帶率均較高,分別為89.19%和79.88%,溶血性基因和細(xì)胞毒素cytK和腸毒素T基因的攜帶率均在50%左右,嘔吐毒素?cái)y帶率最低1.50%。各毒力基因在米飯、米粉、奶粉和土壤這4類標(biāo)本中的攜帶率比較顯示,溶血性基因、非溶血性基因和腸毒素FM基因在這些標(biāo)本中的分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著差異,溶血性基因在土壤中的攜帶率較高,而后兩者則較低。其他毒力基因在這些標(biāo)本中的攜帶無(wú)差異。同時(shí),溶血性基因在疾病相關(guān)標(biāo)本中的攜帶率相比環(huán)境監(jiān)測(cè)標(biāo)本較高,而其余基因攜帶率則在兩類標(biāo)本中無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。由此可見,毒力基因的數(shù)目和溶血性基因?qū)ο灅訔U菌的致病性具有一定的臨床意義。研究表明,溶血素HBL通過(guò)溶血亞基L2,溶血亞基L1和結(jié)合亞基B蛋白共同作用形成HBL成孔毒素或腸毒素。這3個(gè)HBL蛋白分別由hblC,hblD和hblA編碼,從一個(gè)操縱子共同轉(zhuǎn)錄,之后發(fā)現(xiàn)了B′蛋白,由hblB編碼,該蛋白與B蛋白有73%的同源性,位于起始的158個(gè)氨基酸上,且并不是所有含有hbl操縱子的菌株都含有hblB[1],本研究顯示較低的攜帶率(38.14%)也驗(yàn)證了這一結(jié)果。

利益沖突:無(wú)

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