腹瀉仔豬與健康仔豬糞便菌群多樣性的比較

汪 群，閆 鶴

（華南理工大學食品科學與工程學院，廣東廣州 510641）

腹瀉是仔豬最常發的疾病之一，由于其高發病率與高死亡率，對養豬業造成了巨大的經濟損失[1]。引發仔豬腹瀉的病原有多種，其中大腸桿菌，特別是產腸毒素性大腸桿菌（ETEC），是仔豬腹瀉的重要病原之一[2]。另外，腸道微生物失衡也是導致仔豬腹瀉的一個重要因素[3]。腹瀉發生時，病原微生物的定植急劇增加，仔豬腸道菌群結構遭到破壞，導致腸道微生態失衡[4]。分析腹瀉仔豬與健康仔豬的腸道微生物差異，有助于早期診斷和預防腹瀉。

哺乳仔豬腸道環境和免疫系統還不穩定和成熟，對病原微生物特別敏感，因此很容易受到感染而發生腹瀉。目前對仔豬腸道菌群的研究主要集中在對不同年齡的縱向比較或斷奶前后的飲食變化[5-7]，而對腹瀉與健康仔豬腸道菌群的差異的報道較少。Hermann-Bank 等[3]研究表明，與健康仔豬相比，新生腹瀉仔豬腸道放線菌門和厚壁菌門的相對豐度減少，而腸球菌和大腸桿菌的相對豐度增加。

隨著測序技術的發展，采用16S rRNA 高通量測序的方法研究腸道菌群已成為熱點。本研究通過對16 頭腹瀉和健康哺乳仔豬的糞便樣本進行16S rRNA 測序，比較腹瀉與健康哺乳仔豬的糞便菌群的結構差異，探究與仔豬腹瀉相關的微生物病原，為腹瀉仔豬的治療提供依據和預防策略。

1 材料與方法

1.1 樣品采集 從廣東某規模化養殖場中采集15 日齡健康和腹瀉仔豬糞便樣品各8 份。腹瀉仔豬表現為水樣腹瀉，糞稀，呈灰黃色，利用滅菌醫用棉簽蘸取肛門處糞便樣品。……