藏豬EGLN1基因exon 4及部分內(nèi)含子變異研究

李卓航，寸博文，文禹粱，趙生國(guó)，蔡 原

（甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院，甘肅蘭州730070）

藏豬（Sus scrofa）等青藏高原土著動(dòng)物形成了一種可以研究人類與動(dòng)物適應(yīng)低氧的“群體優(yōu)勢(shì)”[1]，最終表現(xiàn)在動(dòng)物組織結(jié)構(gòu)特征和基因差異表達(dá)等方面[2-3]。對(duì)甘孜、迪慶、合作及西藏藏豬促紅細(xì)胞生成素（EPO）基因的研究表明，EPO 具有獨(dú)特的單核苷酸及氨基酸變異[4]；在基因組水平上篩選出了藏豬更多低氧適應(yīng)相關(guān)基因和SNPs（單核苷酸多態(tài)性）[5]。有研究表明，脯氨酰羥化酶蛋白（EGLN1）基因與藏族人血液中血紅蛋白濃度關(guān)系密切[2]，但針對(duì)豬的低氧適應(yīng)相關(guān)研究較少。EGLN1 基因又被稱為PHD2，是一個(gè)關(guān)鍵的氧傳感基因[6]，也是最早發(fā)現(xiàn)與低氧有關(guān)的基因。近年來(lái)研究表明，脯氨酸羥化酶（PHD）是脯氨酸羥化酶家族的一個(gè)成員，其在缺氧誘導(dǎo)因子的羥基化調(diào)解中起著重要作用，被認(rèn)為是細(xì)胞的“氧感受器”[7-8]。本文對(duì)藏豬EGLN1 基因exon 4 及部分核苷酸序列進(jìn)行測(cè)序分析，以期為探索和揭示藏豬低氧適應(yīng)的分子學(xué)機(jī)制提供參考，也對(duì)挖掘藏豬優(yōu)良種質(zhì)資源、維系青藏高原生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定具有理論意義。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 本研究分別從不同海拔地區(qū)采集了4 個(gè)藏豬群體（西藏藏豬、合作藏豬、甘孜藏豬和迪慶藏豬）、八眉豬、煙臺(tái)黑豬及2 個(gè)引入種豬（長(zhǎng)白豬和大白豬）共35 頭豬的組織樣品（表1）。

表1 樣品信息

1.2 實(shí)驗(yàn)方法 采用常規(guī)酚- 氯仿抽提法提取基因組DNA。根據(jù)杜洛克豬EGLN1 基因全序列（登錄號(hào)NW_001885473）設(shè)計(jì)引物（表2），由上海生工生物工程有限公司合成?！?br>