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湯陰北艾內(nèi)生真菌的分離鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析

2019-06-24 08:49:36劉淼李文劉元張守泉文春南王寶倉劉明爽麻兵繼
浙江農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年6期

劉淼,李文,劉元,張守泉,文春南,王寶倉,劉明爽,麻兵繼*

(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 中藥材系,河南 鄭州 450002; 2.河南湯陰縣醫(yī)藥行業(yè)管理辦公室,河南 湯陰 456150)

艾草(ArtemisiaargyiH. Lév. & Vaniot)為菊科蒿屬多年生草本或略成半灌木狀植物,具有“回陽,通十二經(jīng),理氣血,逐濕寒,止血安胎”等功效[1]。艾草按產(chǎn)地生境,分為北艾、祁艾、蘄艾等。北艾分布于今河南湯陰縣內(nèi),《本草綱目》記載“宋時以湯陰復(fù)道者為佳,……近代惟湯陰者謂之北艾……”[2]。湯陰北艾在宋、明、清時期作為貢品進貢宮廷,具有極高的藥用和保健價值,素有“仙艾”的美稱[3]。現(xiàn)代檢測表明,湯陰北艾中桉油精含量達到0.191%。隨著北艾及其制品消費量的不斷增加,如何提高湯陰北艾的品質(zhì)和產(chǎn)量,已成為制約北艾產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵因素。

現(xiàn)代研究表明,藥材植株內(nèi)部的微環(huán)境,尤其是內(nèi)生真菌對藥材的品質(zhì)具有重要影響[4]。內(nèi)生真菌是指存在于健康植物的各種組織、器官內(nèi)部而不使植株表現(xiàn)任何病害癥狀的一類真菌[5]。內(nèi)生真菌能夠直接或者間接影響藥材主要藥效成分的合成[6],因此,內(nèi)生真菌成為眾多學(xué)科交叉研究的熱點,也是研究道地藥材品質(zhì)形成的新的切入點。本試驗利用5種真菌培養(yǎng)基對湯陰北艾內(nèi)生真菌進行分離、純化,利用5.8S-ITS區(qū)序列分析技術(shù)對菌株進行分子學(xué)鑒定,以期初步揭示湯陰北艾內(nèi)生真菌的種類及種群分布特點,為下一階段湯陰北艾內(nèi)生真菌與其品質(zhì)的相關(guān)性研究奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 植物材料

北艾植物樣本于2018年5月采自河南省湯陰縣扁鵲廟,由安陽九頭仙艾有限公司提供。將采集的健康湯陰北艾全株植物樣本放入自封袋保存,24 h內(nèi)處理。

1.1.2 儀器與試劑

SW-CJ-2D型(名牌之星)雙人凈化工作臺,上海化科實驗器材有限公司;LDZF-50KB立式壓力蒸汽滅菌器,上海申安醫(yī)療器械廠;QHZ-98 A全溫振蕩搖床,太倉市華美生化儀器廠;GXZ型(多段編程)智能光照培養(yǎng)箱,寧波江南儀器廠;湘儀H1650-W離心機,湖南湘儀實驗室儀器開發(fā)有限公司;基因擴增儀,北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司;電泳儀(JY300C通用電源,JY-SPCT水平電泳槽),北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;2500R型全自動數(shù)碼凝膠圖像分析系統(tǒng),上海天能科技有限公司。

真菌通用引物ITS1和ITS4,華大基因公司定制。PremixTaq酶、DNA marker(分子量標記)、真菌基因組DNA提取試劑盒,均購自北京索萊寶科技有限公司。

1.1.3 培養(yǎng)基

馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA):馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂18 g,加蒸餾水至1 L。

麥芽浸膏培養(yǎng)基(MEA):麥芽浸膏30 g,大豆蛋白胨3 g,瓊脂15 g,加蒸餾水配至1 L。

孟加拉紅培養(yǎng)基(RBA):蛋白胨5 g,葡萄糖10 g,磷酸二氫鉀1 g,硫酸鎂0.5 g,瓊脂18 g,孟加拉紅0.03 g,氯霉素0.1 g,蒸餾水1 L。

察氏培養(yǎng)基(CDA):硝酸鈉3 g,磷酸氫二鉀1 g,硫酸鎂0.5 g,氯化鉀0.5 g,硫酸亞鐵0.01 g,蔗糖30 g,瓊脂18 g,蒸餾水1 L。

高氏1號培養(yǎng)基(GSA):可溶性淀粉 200 g,硝酸鉀10 g,磷酸氫二鉀0.5 g,硫酸鎂0.5 g,NaCl 0.5 g,硫酸亞鐵 0.1 g,瓊脂 18 g,蒸餾水1 L。

1.2 湯陰北艾內(nèi)生真菌的分離

1.2.1 樣品表面消毒

剪取健康的艾草莖、葉,用無菌水清洗干凈莖、葉表面,用濾紙吸取表面水分,然后放入無菌操作臺,紫外光照射10 min,每隔5 min翻動一下莖、葉的接觸面,然后用無菌水沖洗表面,再依次用75%(體積分數(shù))乙醇浸泡1~2 min,3%(質(zhì)量分數(shù))次氯酸鈉浸泡2~3 min,75%(體積分數(shù))乙醇清洗30 s,最后用無菌水沖洗5次[7]。

1.2.2 內(nèi)生真菌的分離純化

將表面消毒的樣品用濾紙吸干表面的水分。分別取最后一次沖洗過的無菌水200 μL涂布于5種培養(yǎng)基(PDA、MEA、CDA、RBA、GSA)平板上(設(shè)置3個重復(fù))作為對照,以觀察是否滅菌徹底。用滅過菌的手術(shù)剪將莖剪成3 mm左右的條段,將葉剪成3 mm×3 mm的小塊,然后采用平板十字法接種的方式,將莖、葉組織接種到滅菌后的培養(yǎng)基平板上(每種培養(yǎng)基重復(fù)6次)。將平板放入28 ℃的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每隔48 h觀察一次,將具有明顯菌落特征的真菌用接種針挑出,轉(zhuǎn)移到新的PDA培養(yǎng)基上,不斷分離、純化,直至得到單一的菌落[8]。

1.3 5.8S rDNA-ITS區(qū)序列分析

1.3.1 內(nèi)生真菌基因組DNA提取

采用試劑盒,按照說明書上的步驟提取內(nèi)生真菌基因,得到高質(zhì)量的DNA。

1.3.2 5.8S rDNA-ITS區(qū)基因片段的擴增與序列測定

用于5.8S rDNA-ITS區(qū)基因片段PCR擴增的引物為ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGAATGC-3′)。擴增體系為25 μL:PremixTaq12.5 μL,ITS1 2 μL, ITS4 2 μL,DNA 2 μL,ddH2O 6.5 μL。PCR擴增程序:95 ℃預(yù)變性4 min;95 ℃變性30 s,54 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸15 s,34個循環(huán);72 ℃終延伸5 min;12 ℃保溫10 min。將擴增后的DNA用1%(質(zhì)量分數(shù))瓊脂糖凝膠進行電泳20 min,在凝膠成像儀中觀察目的基因條帶。若觀察到明顯的基因條帶,則將PCR產(chǎn)物送往華大基因測序公司進行基因序列檢測。

1.3.3 內(nèi)生真菌的系統(tǒng)進化分析

將測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中的基因序列進行Blast比對,選出一致性最高且大于97%的序列,然后將測序結(jié)果導(dǎo)入到MEGA 7.0軟件中,用鄰接法對所有的內(nèi)生真菌構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

2 結(jié)果與分析

2.1 艾草表面的殺菌效果

在對湯陰北艾進行表面消毒時,對設(shè)置的12個對照平板進行觀察,發(fā)現(xiàn)均無菌落產(chǎn)生,表明艾草表面殺菌消毒徹底。

2.2 艾草內(nèi)生真菌的分離鑒定

將經(jīng)過PCR擴增的5.8 SrDNA-ITS區(qū)域的測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中的基因序列進行比對,結(jié)果表明,共從葉中分離得到3屬(鏈格孢屬Alternaria、耙齒菌屬Irpex、球毛殼屬Chaetomium)6種(鏈格孢菌Alternariasp.、極細鏈格孢霉Alternariatenuissima、球毛殼菌Chaetomiumglobosum、鏈格孢屬鏈格孢菌Alternariaalternata、白菜黑斑病菌Alternariabrassicae、白囊耙齒菌Irpexlacteu)內(nèi)生真菌,從莖中分離得到1屬(鏈格孢屬Alternaria)2種(極細鏈格孢霉Alternariatenuissima、鏈格孢屬鏈格孢菌Alternariaalternata)內(nèi)生真菌(表1)。鏈格孢屬菌為湯陰北艾的優(yōu)勢內(nèi)生真菌。

2.3 艾草內(nèi)生真菌系統(tǒng)發(fā)育分析

將所得菌株采用MEGA 7.0軟件,以鄰接(N-J)法建立系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1)。由親緣關(guān)系的遠近可將菌株分為3個種群:種群A(鏈格孢屬Alternaria)、種群B(耙齒菌屬Irpex)和種群C(球毛殼屬Chaetomium)。根據(jù)親緣關(guān)系的遠近,種群A又可細分為2個種群(A1和A2):種群A1包含鏈格孢屬鏈格孢菌Alternariaalternata、鏈格孢菌Alternariasp.、白菜黑斑病菌Alternariabrassicae和極細鏈格孢菌Alternariatenuissima;種群A2均為極細鏈格孢菌Alternariatenuissima。種群B和C均無下級分枝。

圖1 以鄰近法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

3 小結(jié)與討論

通過試驗,從湯陰北艾的葉、莖中共分離得到13株內(nèi)生真菌,分屬于3屬(鏈格孢屬Alternaria、耙齒菌屬Irpex、球毛殼屬Chaetomium)6種(鏈格孢菌Alternariasp.、極細鏈格孢霉Alternariatenuissima、球毛殼菌Chaetomiumglobosum、鏈格孢屬鏈格孢菌Alternariaalternata、白菜黑斑病菌Alternariabrassicae、白囊耙齒菌Irpexlacteu),葉中的菌群豐富度要大于莖中。

張冰洋[9]報道在河北省石家莊市的艾草中分離得到Fusariumsp、Penicilliumrapier、Penicilliumcitrinum、Fusariumoxysporum、Cladosporiumsp.等5種內(nèi)生真菌;楊倩[10]從蘄艾中分離得到一株黑孢霉屬球黑孢霉菌(Nigrosporaoryzae)。同前述結(jié)果相比,雖然本試驗中湯陰北艾內(nèi)生真菌的群落結(jié)構(gòu)較為單一,種群豐富度不高,但其具有獨特的菌群結(jié)構(gòu),鏈格孢屬(Alternariasp.)真菌為湯陰北艾內(nèi)生真菌菌群中的優(yōu)勢菌屬。或許正是由于湯陰北艾獨特的菌群結(jié)構(gòu),才造就了湯陰北艾的優(yōu)良品質(zhì)。本研究結(jié)果為下一階段闡明內(nèi)生真菌與湯陰北艾品質(zhì)的相互關(guān)系奠定了一定的基礎(chǔ)。

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