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寧鄉豬線粒體DNA全基因組研究

2019-06-11 11:01:22許棟曾勇波曾青華楊一帆馬海明
國外畜牧學·豬與禽 2019年2期
關鍵詞:區域研究

許棟 曾勇波 曾青華 楊一帆 馬海明

摘? 要:本研究通過聚合酶鏈式反應法測定了寧鄉豬全線粒體基因組序列(GenBank收錄號:KF472178),結果表明,線粒體DNA的總長度為16 690 bp,其組成為34.70%A、25.81%T、26.18%C、13.30%G,均為富A+T (60.52%)。它包含了典型的線粒體DNA結構,包括2個核糖體RNA基因、13個蛋白質編碼基因、22個轉移RNA基因和1個非編碼控制區域(D-loop區域)。這些基因的排列方式與長白豬相同。其中除了ND2、ND3、ND4L和ND5的起始密碼子是ATA,ND6是ATT,其他蛋白質的起始密碼子均為ATG。寧鄉豬線粒體全基因組序列為進一步研究其種質特性遺傳機制奠定了基礎。

關鍵詞:豬;線粒體DNA;聚合酶鏈式反應

中圖分類號:S813.1 文獻標志碼:A 文章編號:1001-0769(2019)02-0026-03

寧鄉豬是我國著名的四大地方品種之一,原產于湖南省寧鄉縣的流沙河及草沖一帶,原名為流沙河豬或草沖豬。寧鄉豬的形成歷史悠久,寧鄉豬的特征是“絲頸葫蘆肚,耳薄嘴筒齊,稀毛現薄皮,魚尾后腳直,奶子一斬齊,四腳要撒蹄”、“烏云蓋雪銀頸圈”。其體型中等,體質疏松細致,體軀呈圓筒狀,毛色為黑白花,四肢、肋腹及頸下部為白色,頭和臀部呈黑色。它與杜洛克豬等其他外來品種相比,具有抗逆性強和肉質優良等特點。本研究首次測定了寧鄉豬的線粒體DNA全基因組序列,旨在為其種質特性研究積累基礎資料,并為進一步研究奠定堅實基礎。

1? 材料與方法

1.1 樣品采集

寧鄉豬采自湖南省寧鄉大龍畜牧科技有限公司,剪少量耳組織-20 ℃保存。

1.2 基因組DNA提取及序列分析軟件

基因組DNA提取按常規酚-氯仿法進行,用24對引物進行……

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