生物信息專業R語言課程教學的探索和研究

摘 要：生物信息學是自然科學領域中前沿的、重要的交叉學科之一，各高校十分重視生物信息專業的教學。R語言作為常用數據處理軟件，有開源免費、操作簡單、功能全面、易擴展等優點，也越來越受到領域內學者的關注和認可。本人結合實際教學經驗，對R語言課程的教學現狀進行分析，分析R語言軟件在生物信息專業教學中的優勢，探索適合于生物信息學專業特點的R語言課程的教學方法。

關鍵詞：生物信息學；R語言；生物醫學大數據

中圖分類號：G642 文獻標識碼：A 文章編號：2096-4706（2018）11-0108-03

Exploration and Research of R Language Teaching for Bioinformatics

YAN Wenying

（School of Biology Basic Medical Sciences，Soochow University，Suzhou 215123，China）

Abstract：Bioinformatics is one of the frontier and important interdisciplinary disciplines in the field of natural science. Many universities attach great importance to the teaching of bioinformatics. R language is one of the commonly used data processing software with the advantages of open source，simple operation，comprehensive function and easy expansion，so it is more and more concerned and approved by the scholars in the field. Combining with actual teaching experience，This paper analyzed the present situation of the teaching of R language course，explained the advantages of R language software in the teaching of bioinformatics，and explored the teaching method of R language course which is suitable for the bioinformatics.

Keywords：bioinformatics；R language；biomedical big data

0 引 言

生物信息學（bioinformatics）是一門由生命科學、計算機科學、數學、物理學和化學等學科交叉而形成的前沿學科，研究內容涵蓋了大規模的基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組等多個組學層次的各自及整合性的研究，應用領域也覆蓋了生物、醫學、藥學、農學、環境檢測等多個領域。生物信息學已經成為生命科學中重要的領域之一，同時也是生物化學、細胞生物學、基礎醫學等相關學科發展的強大推動力。生物信息學具有很強的專業性和實踐性。

近年來，隨著深度測序數據的大量涌現，如何闡明和理解生物大數據所包含的生物學意義，是生物信息學面臨的挑戰，也是生物信息學專業培養人才所必須具備的能力。R語言是生物信息學領域處理生物醫學大數據的關鍵技術之一，在分析和處理數據方面功能尤為強大，對于生物信息學專業的學生有著重要的應用價值。R語言課程是在生物信息學專業的本科或研究生階段開設，對該課程的掌握有助于學生的畢業設計和科研工作的開展及工作所用知識的積累。……