黃秀芳 原向偉 劉瓊茹 梁津杰 方曉華 蔡育波 楊文麗 黃 輝 陳艷虹 陳仙蘭張 鑫,3 林碧華
1.廣東省江門市中心醫(yī)院病理科,廣東江門 529030;2.廣東省江門市中心醫(yī)院脊柱骨科,廣東江門 529030;3.廣東醫(yī)科大學廣東省醫(yī)學分子診斷重點實驗室,廣東東莞 523808;4.廣東醫(yī)科大學生物化學與分子生物學教研室,廣東東莞 523808
胃癌(gastric carcinoma)是常見的消化道惡性腫瘤,其中胃腺癌最為常見,可占85%以上[1-2]。世界新發(fā)胃癌的患者,一半以上位于我國[3],由于早期癥狀不典型,普查不及時,我國早期胃癌的診斷率不足10%,5年生存率較低[4-5],可見我國胃癌防治的嚴峻,深入研究胃癌的發(fā)生機制,尋找更為有效的診斷標記物及潛在的治療靶點意義重大。曲妥珠單抗(Trastuzumab)在人類表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2, HER-2)陽性胃癌分子靶向治療過程中的療效已明確,熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)技術是檢測HER-2/neu擴增的金標準,也是重要的胃癌伴隨診斷項目[6]。雖然HER-2/neu擴增可指導患者用藥,但HER-2/neu擴增的胃癌患者中,其臨床病理特征及預后仍有爭論。本文利用癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)的數據和我院胃癌患者數據進行比較,探索HER-2/neu擴增與胃癌臨床病理特征及預后的相關性。
參考文獻[7-8],在R語言軟件平臺(v3.2)上通過TCGAbiolinks程序的GDCquery函數下載癌癥基因組圖譜中胃腺癌的基因組拷貝數信息(由Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0芯片過濾得到)及對應樣品的臨床信息;利用GDCprepare_clinic函數輸出整理各患者的病理臨床信息。數據庫的更新下載日期為2018年5月31日,基礎信息較為完整的有效患者數為441例。
參考文獻[9-11],在GenePattern公共服務器平臺(https://genepattern.broadinstitute.org/),利用 GISTIC 2.0軟件分析各組腫瘤樣品的全基因組拷貝信息,參考基因組為人類19版基因組(human genome 19,hg19),探針標記的物理位點信息(Markers file)和CNV參照信息(CNV file)均整理自SNP Array 6.0的第 35版本信息(http://www.affymetrix.com/);關鍵的運行參數均為默認,并分析HER-2/neu基因(ERBB2)的拷貝數變異情況。
選擇2008年1月~2014年12月,在我院進行手術切除的胃癌標本404例,術前或活檢前均未接受放、化療及免疫治療,所有標本均經病理學明確診斷為胃腺癌。三組數據集的一般臨床病理信息比較見表1。
HER-2/neu基因檢測試劑盒購自廣州達安基因股份有限公司(國械注冊20153402099),操作步驟及判讀標準參考說明書。根據病理醫(yī)師選定的檢測區(qū)域在蠟塊上做標記,按4.0μm石蠟切片,65℃烤片1h;二甲苯室溫脫蠟,逐級酒精水化,超純水浸泡3min,沸水煮片20min;蛋白酶K反應液覆蓋組織,37℃消化5min,過2×SSC緩沖液,逐級酒精脫水;探針雜交液覆蓋組織,加蓋蓋玻片,橡皮膠水封邊,85℃變性5min,37℃避光雜交過夜;孵育結束后,過2×SSC緩沖液,過0.1% NP-40/2×SSC緩沖液,70%乙醇脫水3min,滴加DAPI染液,加蓋蓋玻片,熒光顯微鏡觀察計數,并參考文獻[12]進行判讀。
計數資料用頻數表示,用Excel 2010及GraphPad Prism 5.0軟件處理數據,各組間頻數數據(2×2頻數表)統(tǒng)計使用χ2檢驗(Chi-squared test)或Fisher’s精確檢驗(Fisher’sexact test),生存分析使用Kaplan-Meier分析、Log-rank檢驗,檢驗水平α=0.05。
比較TCGA數據庫與我院患者一般臨床病理信息,可知兩群患者在年齡(χ2=30.082,P< 0.001)、T分期(χ2=46.662,P<0.001)和N分期(χ2=27.073,P<0.001)的分布中有差異,在性別、病理分級、M分期及臨床分期中的分布無差異。
TCGA數據庫中,HER-2/neu基因擴增65例,占全部患者的14.7%;我院HER-2基因擴增69例,占全部患者的17.1%,兩組數據分布無統(tǒng)計學差異(χ2=0.865,P=0.352)。
TCGA數據庫和我院樣品中,男性HER-2/neu擴增率高于女性,差異均具顯著性(χ2=5.165,P=0.023及χ2=4.127,P=0.042);低、中病理分級的 HER-2/neu
擴增情況明顯高于高病理級別,差異均具顯著性(χ2=11.314,P<0.001及χ2=7.121,P=0.008)。此外,不同年齡、T分期、N分期、M分期及臨床分期的胃癌HER2陽性率均無統(tǒng)計學差異,見表2。在性別、年齡、病理分期及TNM分期中,HER-2/neu擴增分布在TCGA數據庫與我院樣品間差異無統(tǒng)計學意義。

表1 TCGA及江門市中心醫(yī)院胃癌患者的基本信息

表2 TCGA及江門市中心醫(yī)院胃癌患者的基本信息
TCGA數據庫和我院胃癌患者生存曲線的對比,見圖1,其中HER-2/neu擴增患者的中位生存時間是26.4個月和38.8個月,HER-2/neu非擴增患者的中位生存時間是29.4個月和39.1個月,兩群患者的生存預后差異無顯著性(P=0.170和P=0.602)。

圖1 TCGA胃癌患者生存預后情況
HER-2/neu的編碼基因(又稱 ERBB2),位于人染色體17q21,編碼185kD的I型跨膜酪氨酸激酶,其基因擴增存在于乳腺癌、胃癌、卵巢癌、子宮內膜癌、結直腸癌和肺癌等惡性腫瘤[13-14]。HER-2/neu在胃癌及胃食管結合部癌的陽性率為4.4%~53.4%,均值為17.9%[15]; TCGA數據庫中,HER-2/neu的陽性率為14.7%,我院樣品HER-2/neu的陽性率為17.1%,兩組數據差異無顯著性,均符合文獻報道[15-16],表明國內外胃癌中HER-2/neu的擴增情況較為一致。
HER-2/neu的擴增和過表達,可通過磷脂酰肌醇 3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase, PI3K)/蛋 白 激 酶 B(protein kinase B, PKB,又 稱 Akt)及絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases, MAPK)途徑影響腫瘤細胞的增殖、凋亡、粘附、分化及浸潤等[17]。乳腺癌中HER-2/neu的擴增明確與差的病理臨床特征相關[13],但在胃癌未見統(tǒng)一的結果。本研究顯示,在TCGA數據庫和我院樣品中,HER-2/neu的擴增與患者的年齡、T、N、M分期及臨床分期均不相關,但男性患者HER-2/neu擴增率高于女性;低病理級別胃癌HER-2/neu擴增率顯著高于高級別的胃癌,表明HER-2/neu擴增與男性及胃癌高分化程度相關,符合文獻報道[18],提示男性、分化較好的胃癌是曲妥珠單抗治療的主要人群。
HER-2/neu擴增是胃癌重要的預后因素,HER-2/neu擴增患者的5年生存率較非擴增低,是胃癌患者預后的獨立檢測指標[19];也有文獻報道[20],HER-2/neu的擴增與患者總生存時間及無復發(fā)生存時間均無關系。我們發(fā)現(xiàn)HER-2/neu的擴增情況不能區(qū)分患者的總生存時間,表明在綜合臨床分期、病理分級和靶向HER-2藥物使用情況下,HER-2/neu的擴增不能作為判斷患者預后的關鍵因素。是否在特定臨床分期、病理分級及治療手段下,HER-2/neu的擴增能作為胃癌患者預后判斷指標,這需要我們進一步的研究。