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桂花OfCCD1基因啟動子克隆與表達特性

2018-08-22 01:54:08劉玉成王藝光付建新胡紹慶趙宏波
浙江農林大學學報 2018年4期
關鍵詞:分析

劉玉成,王藝光,張 超,董 彬,付建新,胡紹慶,趙宏波

(1.浙江農林大學 風景園林與建筑學院,浙江 杭州 311300;2.浙江理工大學 建筑工程學院,浙江 杭州310018)

類胡蘿卜素是廣泛分布于自然界的一類色素,迄今已發現了近800種[1],主要存在于植物的葉、花、果實和根等器官中,在吸引昆蟲、鳥類傳播花粉和種子中發揮作用[2]。類胡蘿卜素可作為多種生物活性物質的前體,經過氧合酶或非酶裂解作用可以形成阿樸類胡蘿卜素[3],后者及其衍生物可生成β-紫羅蘭酮(β-ionone)等香氣物質及脫落酸(abscisic acid,ABA)等植物生長調節劑[4]。作為類胡蘿卜素裂解氧合酶(carotenoid cleavage oxygenases,CCO)中的重要成員,類胡蘿卜素裂解雙加氧酶1(carotenoid cleavage dixoygenase 1,CCD1)在不同的植物中所裂解的底物、作用位點不盡相同。研究發現[5],CCD1在C9~C10(C9′~C10′)位時剪切番茄紅素、胡蘿卜素、玉米黃質或脫輔基類胡蘿卜素等,形成β-紫羅蘭酮, β-環檸檬醛(β-cyclocitral), 香葉基丙酮(geranylacetone)和假紫羅蘭酮(pseudoionone)等芳香類物質;在番茄紅素 C5~C6(C5′~C6′)位裂解時則形成 6-甲基-5-庚烯-2-酮[6], 認為 CCD1 對基于類胡蘿卜素代謝途徑的香氣物質合成發揮著重要作用。桂花Osmanthus fragrans在中國栽培歷史悠久,集綠化、美化和香化為一體,花香和花色是其重要觀賞性狀。類胡蘿卜素裂解雙加氧酶1(OfCCD1)[7]降解桂花中的著色物質——α-胡蘿卜素和β-胡蘿卜素[8],合成主要香氣物質α-紫羅酮和β-紫羅酮[9]。基因啟動子控制著基因在特定的組織[10]、特定的發育階段[11]以及一定的環境條件下表達[12];分離相關基因啟動子,分析其序列及其作用元件,并研究其功能,可明確該基因的調控因子及其作用機制。本研究利用染色體步移技術克隆了OfCCD1啟動子,通過啟動子序列分析、載體構建和瞬時表達分析,初步明確了其功能,為揭示OfCCD1基因調控花色花香代謝機制奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 植物材料

供試材料為6~8年生地栽丹桂品種 ‘堰虹桂’ ‘Yanhong Gui’,栽植于浙江農林大學桂花資源圃。

1.2 主要試劑

Taq聚合酶、限制酶(DraⅠ,EcoRⅤ,PvuⅡ,StuⅠ),質粒載體PMD18-T,大腸埃希菌Escherichia coliDH5α,膠回收試劑盒,DNA片段純化試劑盒和無縫連接試劑盒均購自Takara公司(大連)。

1.3 方法

1.3.1 DNA提取 參照十六烷基三甲基溴化銨法(CTAB)提取 ‘堰虹桂’基因組DNA[13]。

1.3.2 引物設計與合成 根據 ‘堰虹桂’轉錄組數據庫中的CCD1序列(GenBank登錄號MG138152)[14]和 BALDERMANN 等發表的OfCCD1(GenBank登錄號 AB526197.1)序列[9], 用 Primer Primer 5.0設計下游特異性引物1(GSP1),特異性引物2(GSP2)和特異性引物4(GSP4);利用上述2段序列的重復序列設計特異性引物3(GSP3);利用接頭引物1(AP1)與GSP1,接頭引物2(AP2)與GSP2經2輪聚合酶鏈式反應(PCR)獲得的啟動子片段設計特異性引物5(GSP5)。利用pBI121質粒上的β-葡萄糖苷酸酶(β-Glucosidase,GUS)基因序列設計上游引物GUS-F和下游引物GUS-R。引物及接頭均由上海生工合成(表1)。

1.3.3 DNA文庫的構建、擴增 ①DNA文庫的構建。分別用DraⅠ,EcoRV,PvuⅡ,StuI 4種限制性內切酶對提取到的DNA進行酶切。酶切體系為基因組DNA 25.0 μL(100 mg·L-1),限制內切酶8.0 μL, 10×限制酶 buffer 10.0 μL, 滅菌水 57.0 μL, 總體積 100.0 μL,37 ℃過夜。 取 5.0 μl酶切產物用質量分數0.6%瓊脂糖進行檢測。按照DNA純化試劑盒的說明書對酶切產物進行純化后加接頭。分別取4組酶切純化的DNA各4.8 μL,染色體步移接頭GWA 1.9 μL,10×連接緩沖液0.8 μL,T4 DNA連接酶0.5 μL,16.0℃過夜;70.0℃水浴5 min,加入32.0 μL去離子水。② 聚合酶鏈式反應(PCR)擴增。取AP1, 引物 GSP1/GSP3, 模板各 1.0 μL, 預混合Taq酶 10.0 μL, 去離子水補至 20.0 μL進行第 1輪PCR。擴增程序為94.0℃ 5 min;94.0℃ 25 s,72.0℃ 3 min,7循環;94.0℃ 25 s,65.0℃ 3 min,32循環;67.0℃ 7 min。取第1輪產物1.0 μL并稀釋50倍作為第2輪PCR的模板。第2輪PCR體系為:AP2,GSP2/GSP4/GSP5,模板各1.0 μL,預混合Taq酶10.0 μL,去離子水補至20.0 μL。擴增程序為94.0℃ 5 min;94.0℃ 25 s,72.0℃ 3 min,5循環;94.0℃ 25 s,65.0℃ 3 min,20循環;67.0℃ 7 min。取GUS-F,GUS-R和pBI121質粒各1.0 μL,預混合Taq酶10.0 μL,去離子水補至20.0 μL進行GUS序列擴增。擴增程序為95.0℃5 min;95.0℃30 s,69.8℃30 s,72.0℃1 min,35循環;72.0℃10 min;4.0℃10 min。質量分數為1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。

表1 OfCCD1啟動子克隆所用引物Table 1 Primer sequences used in the cloning of OfCCD1 promoters

1.3.4 PCR產物回收、連接、轉化鑒定及序列測定與分析 切膠回收按照MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.4.0(TaKaRa,大連)的說明書進行。載體連接按照PMD18-T載體說明書(Takara,大連)進行,連接后的重組質粒導人大腸埃希菌DH5α感受態細胞中,在50 mg·L-1氨芐青霉素的固體LB培養基上進行藍白斑篩選,挑取白色單菌落菌液PCR檢測后將陽性克隆送公司測序。序列初步分析采用DNAMAN軟件進行。啟動子序列作用元件分析采用在線網站PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)進行。

1.3.5 表達載體的構建及瞬時表達分析 根據獲得的OfCCD1的啟動子序列,利用Takara(http://www.clontech.com)無縫連接引物設計軟件設計3對無縫連接引物CCD1P-S-F和CCD1P-S-R,CCD1P-L-F和CCD1P-L-R,GUS-F和GUS-R。具體操作步驟按照Takara無縫連接試劑盒的說明書進行。將重組好的表達載體利用凍融法轉入農桿菌Agrobacterium tumefaciensGV3101感受態。隨后將煙草Nicotiana tabacum葉片剪切成0.5 cm×0.5 cm的葉塊,在農桿菌菌液吸光度D(600)為0.6的侵染液中浸染10 min;無菌濾紙吸干葉片表面的菌液,將侵染的外植體移至于無菌水浸潤的濾紙上培養24 h并進行GUS染色,37℃下保溫16~24 h。V(乙酸)∶V(乙醇)=3∶1的混合液脫色后取出,對染色結果進行拍照。

2 結果與分析

2.1 啟動子克隆

以 ‘堰虹桂’DNA為模板,分別利用引物GSP1和GSP2,接頭引物AP1和AP2進行2輪PCR,在EcoR文庫擴增得到條帶;經比對和拼接得到長度為511 bp的序列(圖1A)。利用引物GSP3和GSP4,接頭引物AP1和AP2經過2輪PCR,在DraI文庫中得到約2 000 bp的條帶(圖1B)。測序后,經比對和拼接得到長度為2 747 bp的條帶,命名為OfCCD1P-L(圖2)。利用GSP3和GSP5經過2輪PCR后在PvuⅡ文庫中得到750 bp左右的條帶(圖1B),經過拼接比對得到OfCCD1上游981 bp的啟動子序列,命名為OfCCD1P-S(圖 3)。

2.2 啟動子序列分析

利用PlantCARE網站對啟動子序列進行序列分析發現,OfCCD1P-L有TATA-box和CAAT-box等基本作用元件,同時有7個響應元件,響應茉莉酸甲酯、赤霉素、水楊酸、乙烯的元件,以及熱激元件,鳥類成髓細胞性白血病病毒癌基因同源物(MYB)結合位點,并有4個響應脫落酸(ABA)的核心序列ACGT(表2)。OfCCD1P-S中含有TATA-box和CAAT-box等基本作用元件,同時有3個光響應元件,1個熱激響應元件以及1個ABA響應元件(表3),并有4個ABA響應元件(ABRE)核心序列ACGT。

圖1 OfCCD1啟動子克隆電泳圖Figure 1 PCR products of OfCCD1 promoters

表2 OfCCD1P-L中順式作用元件Table 2 Cis-acting elements in OfCCD1P-L

2.3 植物表達載體構建與瞬時表達分析

將克隆得到的啟動子和GUS片段分別與pBI121質粒進行重組(圖4),以含GUS∶∶GUS表達載體的菌株為陰性對照(ck1),以含pBI 121載體菌株為陽性對照(ck2),對構建的OfCCD1P-L∶∶GUS和OfCCD1P-S∶∶GUS表達載體進行瞬時表達分析(圖5)。從圖5可以看出,陰性對照沒有著色,陽性對照著色范圍和程度最好,OfCCD1P-L∶∶GUS表達載體和OfCCD1P-S∶∶GUS表達載體均有著色,但著色都比陽性對照要弱。

3 討論

圖2 OfCCD1P-L序列Figure 2 Sequence of OfCCD1P-L

圖3 OfCCD1P-S序列Figure 3 Sequence of OfCCD1P-S

表3 OfCCD1P-S中順式作用元件Table 3 Cis-acting elements in OfCCD1P-S

桂花OfCCD1基因有2個拷貝[14]。在啟動子克隆過程中,第1次步移并未得到足夠長的序列。目前,已報道的OfCCD1序列有2個:ZHANG等[14]發現的CCD1序列(GenBank登錄號MG138152)和 BALDERMANN發表的OfCCD1序列(GenBank登錄號AB526197.1)[9]。 本研究利用上述2個序列的重復序列設計了引物GSP3,并在GSP3 5′上游設計了GSP4,利用已獲得的部分OfCCD1啟動子序列設計了引物GSP5,分別步移從而獲得了OfCCD1P-S和OfCCD1P-L的啟動子序列。其中OfCCD1P-L長度為2 747 bp,OfCCD1P-S長度為981 bp。原因是OfCCD1啟動子區域的2個拷貝所含酶切位點不同,構建文庫時OfCCD1P-L啟動子區域被內切酶截斷的區域短,步移得到的啟動子就較長;而OfCCD1P-S啟動子區域大部分被截斷,所得的啟動子序列就較短。類似地,已報道的CCD家族其他成員的啟動子長度也有差異,如擬南芥Arabidopsis thaliana的AtCCD7[10]和AtNCED2[15],花生Arachis hypogaea的AhNCED1[16]啟動子都有 2 000 bp 左右, 而菊花Chrysanthemum morifolium的CmCCD4a-5[17]和桂花的OfCCD4[18]啟動子則分別為 1 094 bp和 1 337 bp。 上述文獻中進行啟動子克隆所用方法不盡相同,這也是造成獲得啟動子長度不一的因素。

圖4 OfCCD1的2個啟動子重組質粒圖Figure 4 Recombinant vectors of two OfCCD1

圖5 瞬時表達檢測Figure 5 Detection of transient expression

本研究所獲得的2個OfCCD1啟動子所含元件種類是具有一致性的,都含有光響應元件、熱激響應元件和ABA響應元件,其中較多的是光響應元件。在桂花中,OfCCD1的表達受光照影響[9],證實了OfCCD1啟動子中的光響應元件的存在。同一個亞家族的其他成員,如CCD4[19]和CCD2[20]的啟動子中也發現了光響應元件。這表明光響應元件在CCD家族的啟動子中可能是普遍存在的。不過功能上可能有差異,因為在藏紅花Crocus sativus中,CsCCD2的表達是受光抑制的[20]。

此外,克隆得到的2個啟動子中含有4個ACGT序列[21]。ACGT是啟動子中一個重要的順式作用元件,該序列可以響應水楊酸(salicylic acid,SA),紫外線,ABA和茉莉酸(jasmonic acid,JA)[22]的處理。有研究表明:響應ABA至少需要2個ACGT序列,且2個ACGT之間的堿基數不同,響應的激素種類也不同。MEHROTRA等[23]的研究發現:當2個ACGT序列之間的距離是5 bp時,這段序列響應SA的處理;當距離是25 bp時,該序列響應ABA處理。在堿蓬Suaeda salsa[24]和大豆Glycine max[25]中ABA處理會使CCD1的表達量升高,因此,桂花中OfCCD1的表達極有可能響應ABA的誘導,具體的響應機制還需要進一步研究。

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