黑桃轉錄組微衛星特征分析

劉麗麗 李建輝 鄭雪良 陳駿 楊海英 劉春榮

（浙江省衢州市農業科學研究院衢州324000）

黑桃是原產于我國浙西山區的一個稀有地方特色桃品種，又名烏桃，屬南方品種群硬肉桃亞群[1，2]。黑桃果實皮紫肉紅，汁液豐富，酸甜適中，口感爽脆獨特，具有濃郁的蜂蜜風味及較高的藥用和保健價值，是目前非常稀少的集食用和保健于一體的珍貴水果。因此，隨著人們營養和保健意識的增強，黑桃必將日益受到消費者的親睞，發展前景十分廣闊。

近年來，隨著分子生物學研究的不斷深入和實踐應用的快速發展，DNA分子標記技術在桃研究中的應用越趨廣泛[3，4]。微衛星（Microsatellite）又稱簡單序列重復（simple sequence repeat，SSR），是一類由幾個核苷酸（ 1～6bp）組成的串聯重復DNA序列，廣泛分布于各類真核生物和部分原核生物基因組中，由于重復基元和次數不同從而形成了等位基因之間的多態性[5～7]。相比較其他分子標記而言，微衛星標記具有較高的多態性和較好的重復性，同時還具有進化所受選擇壓力小、共顯性遺傳、易于分析等特點[8，9]，現已廣泛應用于分子生物學、遺傳學、育種學等領域[10～12]。

為此，本文利用IlluminaHiseqTM2500/MiSeqTM高通量測序平臺對黑桃轉錄組進行雙向測序，并對其微衛星序列特征進行分析，以期為后續開展黑桃種質資源創新和利用提供依據。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

2016年 9月在衢州市農業科學研究院果樹研究所試驗基地采集黑桃健康幼嫩葉片，擦拭干凈后用液氮迅速冷凍，再裝入放有足量干冰的低溫貯藏箱中送至上海翰宇生物科技有限公司利用IlluminaHiseqTM2500/MiSeqTM高通量測序平臺進行轉錄組雙向測序。……