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淺談分子生物學在食品微生物檢驗中的應用和前景

2018-01-17 06:03:42劉永嘉阜新市檢驗檢測認證中心
食品安全導刊 2018年33期
關鍵詞:方法

□ 劉永嘉 單 非 阜新市檢驗檢測認證中心

隨著時代的發展,食品安全愈加被社會大眾所關注,而與食品安全密切相關的食品檢驗就顯得至關重要。分子生物學顧名思義,從分子水平研究生命本質,以微觀視野分析生命現象。其中PCR技術在食品微生物檢驗領域具有不可取代的積極作用。

1 PCR技術的時代背景與意義

食品微生物檢驗的技術手段日益更新,常規檢驗方法不斷優化(如各種顯色培養基、生化鑒定試劑條等)[1],酶聯免疫法逐漸成熟[2],分子生物學手段也沒有缺席,理所當然地在食品檢驗領域成為熱點。PCR是20世紀80年代中期開始發展的特定核酸體外擴增技術,至今PCR已經日趨成熟。可以說,在食品微生物檢驗領域PCR技術已經取得了顯著的成績,同時也存在著一些問題,使得這項技術沒有被更普遍地使用,但這并不影響食品檢驗者對它的熱情。因為對微生物本質核酸的探索,讓食品微生物檢驗進入了另外一個層次,這也必將大大地推動食品微生物檢驗事業的進步。

2 傳統PCR

2.1 傳統PCR的原理

PCR的工作原理就是以目標核酸分子為模板,設計與模板核酸相匹配的單鏈核酸片段作為引物,在核酸聚合酶的作用下,按照半保留復制原則合成新的核酸。

2.2 傳統PCR技術在食品微生物檢驗中的特點

用傳統PCR法檢測食品中金黃色葡萄球菌[3]、食品中沙門氏菌[4]等都取得了成功。樣品懸液制備完成后,首先要進行核酸的提取,然后進行選擇性擴增(PCR),最后進行凝膠電泳并觀察記錄。該方法對無菌環境和無菌操作沒有太高的要求,可以對多個樣品的目標菌同時進行檢測,從而完成大批量的檢測任務,具有很好的特異性、敏感性強,并且比常規方法更簡單。

2.3 傳統PCR技術應用于食品微生物檢驗時存在的問題

在食品微生物檢驗過程中,傳統PCR法仍然存在假結果的可能。這是因為,一方面在樣品中可能存在干擾因素或者抑制因素,以及聚合酶鏈反應效率差異很大,需要根據不同的因素設計優化反應條件,影響因素和反應條件的不同都會使得目標核酸的擴增不理想;另一個方面,在進行凝膠電泳準備工作時,人員操作的準確性、時效性對于結果有著顯著的影響,增加了結果的不確定度。

3 熒光定量PCR

3.1 熒光定量PCR的原理

熒光定量PCR就是在反應體系中加入熒光因子監測熒光信號的變化過程,最后利用專業軟件對目標核酸模板進行定量分析。

3.2 食品微生物檢驗中熒光定量PCR與傳統PCR的比較

熒光定量PCR技術是在傳統PCR方法的基礎上發展出來的檢驗技術,在金黃色葡萄球菌[5]、芽孢桿菌[6]、大腸桿菌[7]等的食品微生物檢驗中都取得了成熟的經驗。與傳統PCR比較,該方法在結果讀取分析上進行了改進,更簡單、更快速、靈敏度更強。彌補了傳統PCR 定性檢測的一些不足,全過程采用閉管操作,用光譜技術代替凝膠電泳來呈現結果,減少了人員操作帶來不利影響的機會,降低了擴增產物污染的可能性,有效地避免了假陽性結果的出現,同時對熒光信號累積過程進行監測分析,可以實現對樣本中目標菌的定量檢測[8]。但依然沒有解決傳統PCR在擴增過程中,放大干擾因素或者存在抑制因素的問題。

4 環介導恒溫擴增技術

4.1 環介導恒溫擴增技術的原理

環介導恒溫擴增技術根據靶基因的6個區域設計4條引物,核酸鏈在某一恒溫條件下達成解鏈和退火的動態平衡狀態,因此可以在一個溫度下完成核酸的擴增。

4.2 食品微生物檢驗中環介導恒溫擴增法與熒光定量PCR法的比較

環介導恒溫擴增是2000年由Notomi 等[9]發明的一種新式的恒溫核酸擴增技術,目前已經在阪崎腸桿菌[10]、副溶血性弧菌[11]、金黃色葡萄球菌[12]等的食品微生物檢測中取得不錯的效果。熒光定量PCR法與環介導恒溫擴增法都可以比較準確地檢出目標菌,但相對于環介導恒溫擴增法,熒光定量PCR法需要質量更高的核酸模板,需要更長的檢測時間,需要更精密的儀器設備,相反環介導恒溫擴增法用時短、成本低,環介導恒溫擴增法更適合現場的快速監督抽檢[13]。

5 討論

PCR技術是分子生物學的重要手段,引入了光譜技術后,發展出熒光定量PCR方法,在結果收集分析階段,以熒光信號為標的,有較好的特異性、敏感度。熒光定量PCR方法全程閉管操作,減少了與外界接觸的機會,降低了實驗室污染的可能性,這在操作程序上顯得更優化、更科學。但相比常規檢驗方法,仍然存在儀器設備昂貴等問題。環介導恒溫擴增另辟蹊徑不同于常規PCR需要多個溫度完成核酸的擴增,而是在恒溫下達到核酸擴增的目的,用時更短、成本更低,同時依然有很好的特異性和敏感度。那么,將環介導恒溫擴增法與熒光定量所用到的光譜技術結合起來,用環介導恒溫擴增法進行核酸復制,在反應體系中加入熒光基團,然后監測熒光信號,進行分析得出結果[14]。這樣就可以整合熒光定量PCR方法的優點和環介導恒溫擴增法的長處,得到更加普遍使用的食品微生物檢驗分子生物學技術方法。

6 結語

熒光環介導恒溫擴增法仍然還有很多地方需要完善,未來有很大的發展空間,是未來食品微生物檢驗應用分子生物學方法研究發展的方向,也勢必會成為食品微生物檢驗領域至關重要的技術手段,為食品安全保駕護航。

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