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RRAGD-EGFP融合蛋白在MDA-MB-436細胞中的表達定位

2017-10-24 00:34:48張崢嶸鄭幽阮班展王嫚娜梁劍青李世崇黃紅艷閆敏陳昭烈劉真真孫強
生物技術通訊 2017年5期
關鍵詞:融合

張崢嶸,鄭幽,阮班展,王嫚娜,梁劍青,李世崇,黃紅艷,閆敏,陳昭烈,劉真真,孫強

1.鄭州大學附屬腫瘤醫院 乳腺科,河南 鄭州 450008;2.軍事醫學科學院 生物工程研究所,北京 100071;3.首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院 腫瘤內科,腫瘤治療性疫苗北京市重點實驗室,北京 100038

RRAGD-EGFP融合蛋白在MDA-MB-436細胞中的表達定位

張崢嶸1,2,鄭幽2,阮班展2,王嫚娜2,梁劍青2,李世崇2,黃紅艷3,閆敏1,陳昭烈2,劉真真1,孫強2

1.鄭州大學附屬腫瘤醫院 乳腺科,河南 鄭州 450008;2.軍事醫學科學院 生物工程研究所,北京 100071;3.首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院 腫瘤內科,腫瘤治療性疫苗北京市重點實驗室,北京 100038

目的:構建RRAGD-EGFP融合基因表達載體pQCXIP-RRAGD-EGFP,并檢測RRAGD-EGFP融合蛋白在MDA-MB-436細胞中的表達定位。方法:提取HEK293細胞總RNA,逆轉錄得到cDNA并擴增RRAGD基因,克隆入逆轉錄載體pQCXIP-EGFP-N1,病毒包裝后感染人乳腺癌細胞系MDA-MB-436,活細胞觀察其在細胞內的表達定位。結果:構建獲得逆轉錄病毒載體pQCXIP-RRAGD-EGFP,融合蛋白RRAGD-EGFP定位于胞漿囊泡和細胞核。結論:RRAGD-EGFP融合蛋白在MDA-MB-436細胞中表達定位于胞漿囊泡,與其參與溶酶體調節功能一致,為后續分析RRAGD在cell-in-cell中的作用奠定了基礎。

Ras相關GTP結合蛋白D(RRAGD);基因克隆;cell-in-cell

Ras相關GTP結合蛋白D(Ras-related GTP binding protein D,RRAGD)由400個氨基酸殘基組成,相對分子質量為45 588。RRAGD基因位于染色體6q15,編碼區長1200 bp[1]。

RRAGD是GTR/RAG GTP結合蛋白家族的一員,哺乳動物體內的該家族成員還包括RRAGA、RRAGB、RRAGC[2-3]。這4種蛋白在結構上均有能與GTP/GDP結合的Loop環和異二聚化結構域,從而決定了其在功能上具有小G蛋白活性和異二聚化的能力。因此,它們作為一個分子開關參與生物過程[4]。另外,它們兩兩結合,形成了RRAG A/B-C/D異二聚體(其中RRAGA和RRAGB、RRAGC與RRAGD是同源類似物),又稱Rag復合體(Rag complex)[3,5-8]。該復合體可與溶酶體上的Ragulator結合并被氨基酸激活,促進mTORC1(mTOR complex 1)從胞漿轉移到溶酶體膜表面,并被溶酶體膜上重要的小G蛋白Rheb(Ras ho?molog enriched in brain)激活[9-11]。

為了在活細胞中研究RRAGD的定位分布,我們擬構建RRAGD與綠色熒光蛋白的融合表達載體。為此,我們提取了HEK293細胞中的RNA,逆轉錄得到cDNA后擴增RRAGD基因,連入逆轉錄表達載體pQCXIP-EGFP-N1得到pQCXIPRRAGD-EGFP,進一步在MDA-MB-436細胞中檢查了融合蛋白的亞細胞定位。

1 材料和方法

1.1 材料

MDA-MB-436細胞系來自美國ATCC細胞庫,293FT細胞和HEK293細胞為本實驗室保存(均采用Macgene公司的DMEM培養基培養);大腸桿菌Trans10和反轉錄試劑盒購自北京全式金生物技術有限公司;載體pQCXIP-EGFP-N1由本實驗保存;瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質粒快速提取試劑盒和質粒無內毒素提取試劑盒均購自天根公司;TRIzol購自Ambion公司;T載體購自Pro?mega公司;Q5高保真DNA聚合酶,限制性內切酶BglⅡ、AgeⅠ、XhoⅠ,T4DNA 連接酶購自NEB 公司;LipofectAMINE 2000、嘌呤霉素均購自Invitro?gen公司;玻璃底30 mm培養皿購自NEST公司。

1.2 HEK293總RNA的提取和反轉錄PCR

收獲2×107HEK293細胞,加入1 mL TRIzol,吹打數次后吸入離心管,室溫靜止5 min使其充分裂解;加入0.2 mL氯仿,振蕩混勻后室溫靜置10 min,4℃、12 000 r/min離心15 min;取上清至另一離心管中,加入等量的異丙醇,將管中液體輕輕混勻,室溫靜置10 min,4℃、12 000 r/min離心10 min,棄上清;加入1 mL 75%乙醇,輕輕懸浮沉淀,4℃、7500 r/min離心 5 min,棄上清;晾干,加入 20 μL DEPC 水溶解(65℃,促溶 10~15 min);定量RNA。取1 μg總RNA進行反轉錄(反轉錄體系:1 μg RNA,1 μL Primer,10 μL Re?action Mix,1 μL Enzyme Mix,1 μL Remover,DHPC水補齊至20 μL),將上述體系混勻,42℃、30 min反轉錄,85℃、5 min使反轉錄酶失活。

1.3 RRAGD基因擴增和RRAGD-EGFP融合基因表達載體構建

以得到的cDNA為模板擴增RRAGD基因,引物 為 F1(5'-CGCTCGAGATGAGCCAGGTGCTGGG GAAGC-3')和 R1(5'-CGACCGGTCGCAGCAGCA CTCTAGGGGTCCCAT-3')。PCR 擴 增 條 件 :95℃10 s,62℃ 15 s,72℃ 45 s,30個循環。PCR使用Q5高保真聚合酶。膠回收擴增產物,用Taq酶加A后連入pGEM-T載體,經XhoⅠ/AgeⅠ酶切鑒定正確后測序,測序正確后回收目的片段,連入pQCXIP-EGFP-N1載體的XhoⅠ/AgeⅠ位點,得到逆轉錄表達載體pQCXIP-RRAGD-EGFP(圖1)。

1.4 病毒包裝、感染

293FT細胞按 1×106/孔接種于6孔板,37℃、5%CO2條件下培養過夜。將目的逆轉錄病毒載體與包裝質粒Gag/Pol、VSVG-R用脂質體Lipo?fectAMINE 2000共轉染293FT細胞,6 h后換液,于24、48、72 h收取上清,用4.5 μm濾器過濾。將MDA-MB-436細胞按2×105/孔的密度接種于6孔板,每孔加入1 mL DMEM培養基、1 mL病毒上清和1.5 μL Polybrene,48 h后用嘌呤霉素(1 μg/mL)篩選4~5 d,獲得穩定目的細胞株。

圖1 pQCXIP-RRAGD-EGFP表達載體的構建示意圖

1.5 活細胞觀察RRAGD-EGFP融合蛋白在MDAMB-436細胞中的分布

分別取目的細胞與未轉染的普通MDA-MB-436細胞2×105個,種于30 mm玻璃底培養皿中,37℃、5%CO2條件下培養過夜,12 h后在寬場活細胞熒光顯微鏡下,在FITC和明場下對RRAGDEGFP陽性細胞拍攝照片。

2 結果

2.1 pQCXIP-RRAGD-EGFP表達載體的構建

用引物F1和R1擴增所得產物約為1200 bp,與預期大小相符,提示擴增成功(圖2A)。將擴增所得片段連入T載體,用XhoⅠ/AgeⅠ酶切鑒定,電泳顯示片段大小正常(圖2B),同時測序顯示序列無突變(序列未示)。膠回收目的片段,連入逆轉錄病毒載體pQCXIP-EGFP-N1,轉化后挑2個克隆(C1、C2),分別用XhoⅠ/AgeⅠ、BglⅡ/AgeⅠ雙酶切鑒定,DNA電泳片段和模式與預期相符(圖2C),測序顯示插入序列正確無誤(序列未示),證明pQCXIP-RRAGD-EGFP表達載體構建成功。

圖2 RRAGD基因的PCR擴增和表達載體酶切鑒定

2.2 RRAGD-EGFP融合基因的表達定位分析

已知RRAGD蛋白主要分布于細胞的胞漿、胞核和溶酶體,可能依賴于與其相關的核苷酸結合狀態而進出胞核。與此一致,我們發現MDAMB-436細胞中的RRAGD-EGFP蛋白表達分布在胞漿和胞核中,同時在胞漿囊泡中有特異性分布(圖3)。研究表明,在entosis(細胞侵入性死亡)的后期,mTORC1所調節的液泡分裂參與內部死亡細胞的代謝[12],而RRAGD作為募集mTORC1的關鍵分子,其在cell-in-cell結構中的表達分布仍未見報道,因此我們利用活細胞工作站觀察RRAGD-EGFP在cell-in-cell結構中的表達分布變化。結果顯示當內部細胞進入死亡狀態時,外部細胞的RRAGD-EGFP會聚集在內部細胞周圍,有明顯的聚集效應;而內部細胞處于活的狀態時,無此聚集效應(圖3)。提示RRAGD可能參與了cell-in-cell結構中內部細胞的死亡及代謝過程。

圖3 Cell-in-cell結構中外部細胞的RRAGD-EGFP融合蛋白定位

3 討論

通過建立表達RRAGD-EGFP融合蛋白的細胞系,為我們在活細胞水平研究RRAGD的表達及功能提供了便利:一方面,EGFP是無毒的,對細胞的生存狀態沒有影響,因此便于在熒光顯微鏡下長時間進行活細胞觀察,明確其表達分布的變化;另一方面,可以省去復雜的免疫熒光染色,同時簡化Western印跡實驗的抗體選擇。

RRAGD在多種組織,如皮膚、心臟、脊髓、睪丸和視網膜等中均有表達。RRAGD可以參與多種信號通路,尤其是其異二聚體復合物調節mTORC1活性的功能,具有很重要的生理意義[7]。我們前期研究發現RRADG在乳腺癌細胞系的不同單克隆細胞株中表達差異很大,同時與乳腺癌細胞的cell-in-cell形成率具有一定的相關性,因此,通過構建表達RRAGD-EGFP融合蛋白的細胞系,為探討RRAGD對cell-in-cell形成能力的作用及機制研究提供了合適的研究模型。

此外,在cell-in-cell結構中,內部細胞是被外部細胞所形成的液泡包裹的,部分液泡的命運與吞噬小體類似——液泡在外部細胞內經歷一定的事件后達到成熟,其成熟末期的標志即液泡的分解,液泡分裂后其內部營養和遺傳物質進入外部細胞并被利用[12]。在我們的實驗中發現,內部細胞處于死亡狀態時,外部細胞的RRAGD-EGFP有明顯的聚集效應,這一過程是否是通過募集mTORC1參與調節液泡的成熟,進而促進內部細胞的死亡還有待研究。同時,RRAGD及其形成的異二聚體復合物的活化是否能決定cell-in-cell結構中內部細胞的命運,也值得深入探索。

[1]Mungall A J,Palmer S A,Sims S K,et al.The DNA sequence and analysis of human chromosome 6[J].Nature,2003,425(6960):805-811.

[2]Kim E,Goraksha-Hicks P,Li L,et al.Regulation of TORC1 by Rag GTPases in nutrient response[J].Nat Cell Biol,2008,10(8):935-945.

[3]Sancak Y,Peterson T R,Shaul Y D,et al.The Rag GTPases bind raptor and mediate amino acid signal?ing to mTORC1[J].Science,2008,320(5882):1496-1501.

[4]Sekiguchi T,Todaka Y,Wang Y,et al.A novel hu?man nucleolar protein,Nop132,binds to the G pro?teins,RRAG A/C/D[J].JBiolChem,2004,279(9):8343-8350.

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[6]Schürmann A,Brauers A,Massmann S,et al.Cloning of a novel family of mammalian GTP-binding proteins(RagA,RagBs,RagB1)with remote similarity to the Ras-related GTPases[J].JBiolChem,1996,270(48):28982-28988.

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Expression and Subcellular Localization of RRAGD-EGFP Fusion Protein in MDA-MB-436 Cells

ZHANG Zheng-Rong1,2,ZHENG You2,RUAN Ban-Zhan2,WANG Man-Na2,LIANG Jian-Qing2,LI Shi-Chong2,HUANG Hong-Yan3,YAN Min1,CHEN Zhao-Lie2,LIU Zhen-Zhen1*,SUN Qiang2*
1.Department of Breast,Cancer Hospital,Zhengzhou University,Zhengzhou 450008;2.Beijing Institute of Biotech?nology,Beijing 100071;3.Beijing Key Laboratory of Oncology and Oncology Vaccine,Beijing Shijitan Hospital,Capital University of Medical Sciences,Beijing 100038;China

Objective:To construct the retroviral expression vector for RRAGD-EGFP fusion protein,and exam?ine its subcellular localization in MDA-MB-436 cells.Methods:Total RNA was extracted from HEK293 cells and reverse transcribed into cDNA.RRAGD(Ras-related GTP binding protein D)gene was amplified by PCR and cloned into the retroviral expression vector pQCXIP-EGFP-N1 to construct pQCXIP-RRAGD-EGFP,followed by retrovirus was made and infected MDA-MB-436,a cell line of breast cancer.Afterwards,time lapse imaging was performed.Results:The retroviral expression vector for RRAGD-EGFP fusion protein was successfully constructed.RRAGD-EGFP fusion protein was found in cytoplasmic vesicles and nucleus.Conclusion:Localization of RRAGDEGFP fusion protein in cytoplasmic vesicles is consistent with its role in lysosomal biogenesis,which has laid foun?dation for the further study on the role of RRAGD in cell-in-cell.

Ras-related GTP binding protein D(RRAGD);gene cloning;cell-in-cell

Q78

A

1009-0002(2017)05-0639-04

10.3969/j.issn.1009-

*Co-corresponding authors,LIU Zhen-Zhen,E-mail:Liuzhenzhen73@163.com;SUN Qiang,E-mail:sunq@bmi.ac.cn

2017-04-05

國家自然科學基金(81572799,31671432);國家重點研發計劃(2016YFC1303303);北京市自然科學基金(7162091)

張崢嶸(1991- ),男,碩士研究生,(E-mail)18703605958@163.com;鄭幽(1989- ),女,助理研究員;二者為共同第一作者

劉真真,(E-mail)Liuzhenzhen73@163.com;孫強,(E-mail)sunq@bmi.ac.cn

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