16S rDNA克隆文庫方法分析太歲樣品中細菌的多樣性

王朝江

(河北省農(nóng)林科學(xué)院 遺傳生理研究所，河北 石家莊 050051)

16S rDNA克隆文庫方法分析太歲樣品中細菌的多樣性

王朝江

(河北省農(nóng)林科學(xué)院 遺傳生理研究所，河北 石家莊 050051)

通過構(gòu)建16S rDNA克隆文庫的方法，分析太歲樣品中細菌的群落結(jié)構(gòu)及多樣性。太歲樣品中的細菌歸屬于4個門9個目，優(yōu)勢類群依次是芽胞桿菌目(Bacillales，33.01%)、柄桿菌目(Caulobacterales，32.04%)和伯克霍爾德氏菌目(Burkholderiales，12.62%)；優(yōu)勢屬為短波單胞菌屬(Brevundimonas，30.10%)、葡萄球菌屬(Staphylococcus，29.13%)和食酸菌屬(Acidovorax，7.77%)。并且其中的5個目中含有未培養(yǎng)的細菌，紅桿菌目(Rhodobacterales)、伯克霍爾德氏菌目和紅環(huán)菌目(Rhodocyclales)的11個克隆子的細菌16S rDNA序列同源性低于97%。研究表明太歲樣品中細菌多樣性較豐富，且蘊藏著許多未知的微生物資源。

16S rDNA；克隆文庫；太歲；細菌多樣性

“太歲”又稱“肉靈芝”，《本草綱目》中描述為“肉芝狀如肉，乃生物也，白者如截肪，黃者如紫金，皆光明洞徹如堅冰也”。太歲生活于土壤中，生命力極強，有研究稱太歲在抑菌、調(diào)節(jié)免疫、惡性腫瘤等疑難雜癥的治療方面具有明顯效果，因此受到社會各界的廣泛關(guān)注。太歲特有的彈性、韌性和粘性，極易使人直覺上判定是一種生物體，但到目前為止生物學(xué)界卻一直難以給出歸屬，比較流行的觀點認為是“大型黏菌復(fù)合體”，但仍有人持太歲為非生命體的觀點。戴璐[1]研究了渭河太歲衍生體中黏菌和真菌多樣性，分離出2種黏菌和18種真菌；王欣[2]研究了上述同一樣本中細菌多樣性，獲得35株細菌和1株黏細菌，優(yōu)勢菌群為β-變形菌綱伯克氏菌目(Burkholderiales)的細菌；林澗等[3]也開展了類似的工作；……