不同處理方法對肺炎鏈球菌基因組提取的影響

黃 洋， 李 康， 楊 越， 陳 馳， 梁 麗， 葉 強， 陳翠萍

(中國食品藥品檢定研究院 衛生部生物技術產品檢定方法及其標準化重點實驗室，北京 100050)

不同處理方法對肺炎鏈球菌基因組提取的影響

黃 洋， 李 康， 楊 越， 陳 馳， 梁 麗， 葉 強*， 陳翠萍

(中國食品藥品檢定研究院 衛生部生物技術產品檢定方法及其標準化重點實驗室，北京 100050)

為了獲得簡便、高效的提取肺炎鏈球菌基因組DNA方法，分別采用不同處理方法(溶菌酶法和脫氧膽酸鈉(DOC)法)、不同處理時間對8株不同血清型的肺炎鏈球菌進行破壁，同時菌株采用不同培養時間進行基因組的提取，提取基因組后利用紫外分光光度計測定樣品中DNA 的濃度和純度以及瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA 的質量。結果表明，菌株培養12～16 h、質量分數1%DOC處理2 h能提取出高質量的肺炎鏈球菌基因組DNA。該方法提取的肺炎鏈球菌基因組DNA具有質量高、完整性好的優點，為肺炎鏈球菌全基因組序列的測定提供了前提條件。

肺炎鏈球菌；基因組提取；不同破壁方法；不同培養時間

肺炎鏈球菌(Streptococcuspneumoniae)又稱肺炎雙球菌或肺炎球菌，是一種革蘭陽性雙球菌，有莢膜結構，莢膜是肺炎鏈球菌的主要毒力因子[1-2]。根據莢膜多糖結構和成分的不同，肺炎鏈球菌目前可分成46個血清群和93個不同的血清型[2-3]。多數微生物物種的基因是一個動態實體，基因的水平轉移會導致基因的變化，從而影響細菌的毒力和細菌相關疾病的病原學行為[4]。在以高通量測序為研究手段研究肺炎鏈球菌全基因組序列和比較基因組學分析時，提取高質量的基因組DNA 成為最基礎的工作。……