浙江省柯薩奇病毒A16 VP1基因特征分析及B細胞抗原表位預測*

徐莉，崔大偉，戴玉柱，王磊，楊先知，謝國良，鄭書發，孫長貴，成軍，陳瑜

(1．浙江大學醫學院附屬第一醫院檢驗科，杭州 310003；2．浙江省臨床體外診斷技術研究重點實驗室，杭州 310003；3．中國人民解放軍第一一七醫院檢驗科，杭州 310013)

·研究生園地·

浙江省柯薩奇病毒A16VP1基因特征分析及B細胞抗原表位預測*

徐莉1,2,3，崔大偉1,2，戴玉柱3，王磊1,2,3，楊先知1,2，謝國良1,2，鄭書發1,2，孫長貴3，成軍3，陳瑜1,2

(1．浙江大學醫學院附屬第一醫院檢驗科，杭州 310003；2．浙江省臨床體外診斷技術研究重點實驗室，杭州 310003；3．中國人民解放軍第一一七醫院檢驗科，杭州 310013)

目的 了解浙江省柯薩奇病毒A16(CA16)VP1基因特征及其變遷規律并預測VP1蛋白上B細胞抗原表位。方法 在GenBank檢索并下載35個浙江省CA16流行株及69個已知基因型CA16參考株的VP1基因序列，使用MEGA 6.0軟件進行比對分析和構建種系進化樹，確定浙江省CA16流行株的基因型，并分析VP1核苷酸和氨基酸同源性及氨基酸變異；運用DNA Star中的Protean模塊預測VP1上可能的線性B淋巴細胞抗原表位。結果 浙江省CA16病毒基因型為B1基因型(34株)和A基因型(1株)。B1型中以B1b亞型(24株)占絕對優勢，其次為B1a亞型(10株)。浙江省CA16流行株VP1核苷酸和氨基酸同源性分別為75.5%～100%和89.5%～100%；VP1區氨基酸序列高度保守，但也存在部分變異。VP1中可能的B細胞抗原表位(氨基酸肽段)有13個，分別為10-20、30-38、57-62、73-79、98-106、118-123、159-168、173-177、184-189、240-246、265-273、274-284和289-295。結論 浙江省CA16流行株存在A、B1 2個基因型，B1b和B1a為主要基因型，其VP1區氨基酸變異程度較低，VP1中13個預測的B細胞抗原表位可為CA16疫苗的研制提供科學依據。

柯薩奇病毒A16；VP1；基因特征；氨基酸變異；B細胞抗原表位

柯……