測序法篩選慢性阻塞性肺疾病尼古丁受體CHRNB4基因外顯子單核苷酸多態性

趙祝香 彭 芳 何 樺 李裕軍 曾 軍 趙子文

(1廣州醫科大學附屬市一人民醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510180；2廣州醫科大學附屬第三醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510150；3廣州市荔灣區第二人民醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510160)

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·論著·

測序法篩選慢性阻塞性肺疾病尼古丁受體CHRNB4基因外顯子單核苷酸多態性

趙祝香1*彭 芳2何 樺1李裕軍1曾 軍1趙子文1

(1廣州醫科大學附屬市一人民醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510180；2廣州醫科大學附屬第三醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510150；3廣州市荔灣區第二人民醫院呼吸內科, 廣東 廣州 510160)

目的:尋找中國南方漢族人群尼古丁受體(CHRNB4)基因功能區與慢性阻塞性肺疾病(COPD)疾病相關的單核苷酸多態性位點(SNP)。方法:在廣州地區抽取按照慢性阻塞性肺疾病全球創議(GOLD)診斷標準(擴張后FEV1/FVC<70%)確診的漢族COPD患者120例，按年齡(±3歲)與病例頻數匹配原則選取非COPD對照者120例,病例組來自廣州醫科大學附屬市一人民醫院住院及門診患者，對照組來自門診志愿者。抽取受試者外周血提取基因組DNA，利用Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/)查尋 CHRNB4 的全基因組序列，以Oligo6引物設計軟件設計包括全外顯子序列在內的測序引物5對，焦磷酸法 DNA測序，Bio Edit分析軟件對測序序列進行比對及基因分型分析。結果:通過第一代測序，快速篩選出中國漢族人群CHRNB4外顯子區3個SNP，分別為 rs56218866、rs6743072、rs1948。其中rs56218866可引起氨基酸位點改變。結論：通過第一代測序，可以簡單、快速篩選出中國南方漢族人群與尼古丁受體CHRNB4外顯子功能區和COPD易感性相關的SNP位點。

尼古丁受體；篩選；單核苷酸多態性

慢性阻塞性肺疾病(簡稱慢阻肺，COPD)在全世界范圍內是一種發病率和死亡率較高的重要疾病，我國40歲以上人群慢阻肺患病率高達8.2%[1]。家系研究表明，慢阻肺和肺功能損害存在明顯家族聚集傾向。近年來，國內外對慢阻肺的遺傳易感基因進行了許多探索性的研究，但結果不盡一致。迄今為止，唯一公認、也是最早認識的慢阻肺遺傳危險因素是嚴重α1-抗胰蛋白酶缺乏[2-5]，但只有1%～2%的慢阻肺患者存在α1-抗胰蛋白酶缺乏。研究發現高加索人群尼古丁受體CHRNB4與吸煙成癮性及肺癌易感性相關[6-7]，但是，此前有關對于尼古丁受體CHRNB4 單核苷酸多態性位點(SNP)多態性位點研究多來源于……