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乙型肝炎病毒X區基因變異與原發性肝癌的關系研究

2016-03-28 05:06:10楊偉李增彩倪秀瑩王濤
肝臟 2016年1期
關鍵詞:原發性肝癌

楊偉 李增彩 倪秀瑩 王濤

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乙型肝炎病毒X區基因變異與原發性肝癌的關系研究

楊偉 李增彩 倪秀瑩 王濤

【摘要】目的 初步研究乙型肝炎病毒(HBV)X區基因變異與原發性肝癌的關系。方法 收集39例HBV感染患者的肝(癌)石蠟組織標本,其中慢性乙型肝炎(CHB)14例、肝細胞癌(HCC)25例。采用聚合酶鏈式反應(PCR)方法擴增組織中HBVX區基因,并對PCR產物進行DNA測序,分析常見變異位點的變異情況。結果 1. HCC組與CHB組相比,在X區發生插入/缺失變異,聯合變異的位點及例數增多,并且A1762 T與G1764 A常發生雙突變。2. HBVX區變異頻率較高位點依次是C1655 T/G、A1605 C/G、A1762 T、G1764 A、A1772B、A1645 C、C1687 A、G1776 T。結論 HBVX區存在點突變、插入/缺失變異及聯合變異,可能在HCC的發生和發展過程中起重要作用。

【關鍵詞】原發性肝癌;HBVX基因;變異

肝細胞癌(HCC)是最常見的惡性腫瘤之一,乙型肝炎病毒(HBV)的慢性感染是其最重要因素。研究資料證明HBVX區病毒變異與HCC發生和發展有關。本研究對慢性HBV感染者,其中慢性乙型肝炎(CHB)14例、HCC25例,共39例石蠟組織標本的HBVX區基因變異情況進行檢測,以初步探討HBVX區基因變異與HCC的關系。

資料和方法

一、標本來源及分組

收集39例慢性HBV感染者肝(癌)組織標本,其中CHB組肝組織14例、HCC組肝癌組織25例。

二、主要儀器和試劑

PCR擴增儀:雙螺旋牌PTC-51 DNA溫度循環器(軍事醫學科學院放射醫學所總后勤部衛生部監制),PCR擴增試劑盒購自上海生工生物工程技術有限公司,DL2000 DNAMarker購自日本Ta KaRa公司。

三、石蠟組織中HBVDNA提取

采用傳統的酚-氯仿提取法,提取后置-20℃冰箱保存。除了石蠟組織樣品外,每次提取過程都以1份雙蒸水樣品,作為全程的污染監控。所有離心過程都在室溫下進行。

四、引物的設計合成及PCR反應體系

從Pub Med GenBank上下載兩條我國常見的B和C基因型的基因序列(ayr基因型,序列號為X04615和NC-003977),通過查閱文獻資料和應用VectorNTISuite8.0軟件對基因序列多態性進行分析,找出X區保守區序列,利用Primer 5.0軟件設計出針對HBVX基因序列特異的引物,并在blast上比對,最終篩選出如下引物序列。上游引物:5'-TGTGCACTTCGCTTCACCTCT-3',下游引物:5'-AGACCAATTTATGCCTACAGC-3',并委托上海生工生物工程技術服務有限公司合成。目的基因位于nt1578-1800,PCR擴增產物大小為223 bp。PCR反應體系:在50μL反應體系中,加入2×PCRMaster緩沖液25μL(內含10 MMTris -HCl、PH8.4的50 MMKCl、1.6 MMMgCl2)、上游引物1.0μL、下游引物1.0μL、模板1.0μL。反應條件:95℃預變性5 min,在94℃變性60 s、51℃退火60 s、72℃延伸60 s,進行35個循環,72℃終延伸10 min。最后在-20℃冰箱保存。

五、產物測序及序列分析

PCR擴增產物純化后直接測序,為保證測序結果的可靠性,測序采用正反雙向測序。測序結果應用BioEdit7.0、Clustal W軟件與標準序列進行比較,同時在http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi上進行比對,測序工作由上海生工生物工程技術服務有限公司完成。

六、統計學方法

采用χ2檢驗。

結 果

一、X區基因擴增情況

PCR擴增產物經2.0%瓊脂糖凝膠電泳觀察(圖1),結果顯示HCC組20例(20/25)與CHB組5例(5/14),共25例擴增出與設計的目的基因長度一致的特異性片段,兩組目的基因擴增陽性率差異無統計學意義(P>0.05)。

二、HCC組和CHB組HBVX區基因點突變情況(見表1)。

表1 25例標本HBVX區基因變異情況

對擴增25例標本進行測序,共發現71個位點發生點突變,前8位變異最多的位點及突變例數依次為:C1655 T/G(25例)、A1605 C/G(20例)、A1762 T(18例)、G1764 A(14例)、A1772B(12例)、A1645 C(10例)、C1687 A(10例)、G1776 T(10例)。25例均存在C1655 T/G變異,20例合并A1605 C/G變異,18例合并BCP區熱點雙突變A1762 T/G1764 A。HCC組在突變位點和例數方面均較CHB組多,且常發生A1762 T與G1764 A雙突變。

三、HCC組和CHB組HBVX區基因插入/缺失變異的情況

HCC組發現有18例(18/25)存在插入/缺失變異情況,分別為nt1641-1644缺失1個C、nt1633-1636間缺失GG、nt1647-1648間插入1個A、nt1676-1677間插入1個T、nt1678-1681間缺失AA、nt1731-1735間缺失1個C、nt1739-1742間缺失1個A;CHB組僅有2例(2/14)發現缺失變異,分別為nt1680缺失A、nt1622-1625缺失1個A。HCC組發生插入/缺失變異的例數及變異位點明顯多于CHB組。

四、HCC組和CHB組聯合變異的情況

聯合變異存在從四聯到十聯不同程度的變化情況(見表2)。

表2 常見變異位點在12例標本中聯合變異的情況

討 論

肝癌是最常見惡性腫瘤之一,HBV病毒的慢性感染是肝癌的最重要因素。研究資料證明HBVX區病毒基因變異與HCC發生和發展有關,但各項研究尚無統一的觀點和結果。我們所擴增的基因序列位于HBVX區的nt1587-1800區段,該區段包含多個HBVDNA復制的關鍵調節元件:BCP(ntl742-1849)、CURS(nt1643-1742)、NRE(ntl457-1628)和EnhⅡ(ntl627-1774)[1]。

在成功測序的25例標本(HCC組20例、CHB組5例)中,均存在C1655 T/G變異,另外有20例發生A1605 C/G變異,推測這兩個位點變異可能在HBV感染的早期便會發生,而與HCC的發生和發展無密切關系。變異例數前8位位點依次為:C1655 T/G、A1605 C/G、A1762 T、G1764 A、A1772B、A1645 C、C1687 A、G1776 T。BCP區基因變異A1762 T、G1764 A通常以雙突變的形式存在,是目前的研究熱點。大量研究證明,該雙突變不僅與肝臟炎癥壞死和纖維化有關,還與HCC密切相關。一些學者發現A1762 T/G1764 A雙突變在HCC組與非HCC組有明顯差異[2,3];也有學者持不同意見,認為BCP區雙突變在HBV慢性感染者中與肝纖維化的進展有關,而不是與HCC有關,我們的研究較支持后一觀點。

既往研究發現nt1772鄰邊位點常發生插入/缺失變異[4,5]。本研究25例HCC組發現有9例存在插入/缺失變異情況,而14例CHB組僅有3例發現缺失變異。大量的研究資料顯示缺失變異常發生于羧基端如nt1763-1770、ntl770-1777、ntl753-1772、nt1750-1770等部位的缺失,這些突變能夠降低HBV的復制水平,與HBs Ag陽性、HBeAg陰性的無癥狀攜帶現象密切相關[6]。X區的插入/缺失變異可能與疾病的進展有關,Seoung-Ae Lee等發現缺失/插入變異在肝硬化、HCC比CHB、乙型肝炎病毒攜帶者明顯增高,且均伴隨BCP雙突變[7]。X區發生插入/缺失變異后將產生移碼變異,使HBs Ag發生改變,喪失對細胞增殖抑制作用,導致肝細胞過度增生發生癌變。

HBVX區基因不但可以在自己區域內發生聯合變異,還可以與其他開放讀碼框內的位點發生聯合變異,本研究中表2也證實了這點。25例標本中的熱點變異位點存在從四聯到十聯不同程度的聯合變異,HCC組在突變例數及聯合變異的位點數目方面均較CHB組多,在所有發生聯合變異的標本中有7例合并BCP區熱點雙突變A1762 T/G1764 A。一項Meta分析顯示BCP區雙突變在HCC患者較非HCC患者明顯增高,若聯合EnhII/BCP其他變異位點如C1653 T、T1753 V,則這種差異更加顯著,而且是肝癌發生的早期事件;而C1653 T、T1753 V可能是肝癌發生的晚期事件[8]。HBV相關性肝癌的發生和發展是一個極其復雜的過程,既往研究比較局限于單一位點變異的作用,近年來大家更注重多基因位點、多區域片段聯合變異所造成的影響,這也許能更全面地研究和發現HBV基因變異在HCC中的作用。

參 考 文 獻

1 朱榮.慢性乙型肝炎組織病理學指標及病毒X基因變異與患者預后的相關性研究.上海:復旦大學,2006.

2 Shi M,Zhang Y,Zhang J,et al. Hepatitis Bvirus genotypes,precore Mutations and basal core pro Moter Mutations in HBV-infected Chinese patients with persistently normal alanire a minotransferase and low seru MHBVDNAlevels. Braz JInfect Dis,2012,16:52-56.

3 Asim M,Malik A,Sarma MP,et al. Hepatitis Bvirus BCP,Precore/ core,Xgene Mutations/genotypes and the risk of hepatocellular carcino ma in India.JMed Virol,2010,82:1115-1125.

4 Moriyama K. Reduced antigen production by hepatitis Bvirus harbouring nucleotide deletions in the overlapping Xgene and precore-core pro Moter.JGen Virol,1997,78:1479-1486.

5 Cui XJ,Cho YK,Song HJ,et al. Molecular characteristics and functional analysis of full-length hepatitis Bvirus quasispecies fro Ma patient with chronic hepatitis Bvirus infection.Virus Res,2010,150:43-48.

6 謝佳新,殷建華,何永超,等.乙型肝炎病毒基因變異及其臨床意義.中華疾病控制雜志,2009,13:358-361.

7 Lee SA,Mun HS,Kim H,et al. Naturally occurring hepatitis Bvirus Xdeletions and insertions a Mong Korean chronic patients.JMed Virol,2011,83:65-70.

8 Liu S,Zhang H,Gu C,et al. Associations between hepatitis Bvirus Mutations and the risk of hepatocellular carcino ma:a meta-analysis. JNatl Cancer Inst,2009,101:1066-1082.

(本文編輯:易玲)

收稿日期:(2015-05-13)

作者單位:261021 山東省濰坊市第八九醫院傳染科

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