民豬NUMB基因克隆與組織表達分析

劉　娣，王鑫鑫，別　墅，張冬杰，汪　亮，李　苓，曹　越（.東北農業大學動物科學技術學院，哈爾濱　50030；.黑龍江省農業科學院畜牧研究所，哈爾濱　50086）

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民豬NUMB基因克隆與組織表達分析

劉娣1,2，王鑫鑫1，別墅1，張冬杰2，汪亮2，李苓1，曹越1
（1.東北農業大學動物科學技術學院，哈爾濱150030；2.黑龍江省農業科學院畜牧研究所，哈爾濱150086）

摘要：研究采用RT-PCR技術結合克隆測序方法，克隆出全長2 004 bp NUMB基因序列，其中包括1 782 bp開放讀碼框，該基因編碼592個氨基酸。利用生物信息學分析軟件對該基因氨基酸序列預測與分析發現：NUMB蛋白二級結構中，轉角占很大比例，且蛋白親水性較強，結構功能域分析發現該蛋白多肽鏈存在一個N端磷酸酪氨酸結構域（PTB），位于第37~162氨基酸之間。基于不同物種NUMB蛋白序列所構建分子進化樹表明，豬與牛、駱駝親緣關系最近，而與斑馬魚最遠。在mRNA水平上，NUMB基因肺中表達量最高，大腸中表達量最低。

關鍵詞：民豬；NUMB基因；反轉錄PCR；克隆；生物信息學

劉娣,王鑫鑫,別墅,等.民豬NUMB基因克隆與組織表達分析[J].東北農業大學學報, 2016, 47(1): 51-57.

Liu Di, Wang Xinxin, Bie Shu, et al. Cloning and tissue expression analysis of Min pig NUMB gene[J]. Journal of Northeast Agricultural University, 2016, 47(1): 51-57. (in Chinese with English abstract)

細胞命運決定因子NUMB是一種膜相關蛋白，在進化上相對保守。最先在果蠅神經系統中被發現[1]，隨后在多個哺乳動物體內發現該基因存在，并稱為mNUMB基因[2]。該基因一般具有兩個保守結構，一個是磷酸酪氨酸結構（PTB），一個是羧基端結構（PRR），這兩個結構可分別與LDAP?NY、α銜接蛋白和E3泛素激酶等多種蛋白相互作用，行使不同生物學功能[3]。其在細胞不對稱分裂、內吞、生長、粘附、遷移等過程中發揮作用，并通過Notch和P53等信號途徑決定細胞命運[4-6]。……