比較串聯(lián)重復序列在玉米及高粱染色體上的差異

趙志新,李浩

（商洛學院生物醫(yī)藥與食品工程學院，陜西商洛726000）

比較串聯(lián)重復序列在玉米及高粱染色體上的差異

趙志新,李浩

（商洛學院生物醫(yī)藥與食品工程學院，陜西商洛726000）

串聯(lián)重復序列廣泛分布于真核生物，特別是植物中，為了比較其在禾本科植物染色體中的分布及差異，使用Phobos軟件分析了玉米和高粱全基因組數(shù)據。結果顯示，重復序列主要為短序列重復(＜＝6 bp)，其中尤以二核苷酸和三核苷酸重復序列密度最高。玉米和高粱的二核苷酸重復單元都以AT重復為主，而其三核苷酸重復單元不盡相同；玉米主要以CCG極其互補序列CGG重復居多，而高粱以ATT極其互補序列AAT重復為主。并且玉米及高粱串聯(lián)重復序列主要分布于染色體兩端。對于理解串聯(lián)重復序列在玉米及高粱染色體上的分布做了初步分析，研究揭示串聯(lián)重復序列主要特征及分布位置，對重復序列在禾本科植物基因組中的研究具有借鑒作用。

串聯(lián)重復序列；染色體；玉米；高粱

以各自的核心序列（重復單元）首尾相連多次重復稱之為串聯(lián)重復序列（Tandem repeats,TRs）。TRs廣泛存在于真核生物和部分原核生物基因中，植物基因組的重復序列一般占80%左右，它們在基因組中表現(xiàn)出種屬、堿基組成等特異性，同時在基因組中的存在亦有很大差異[1]。研究表明，重復序列在維持染色體的空間結構、基因表達以及遺傳重組中都具有重要作用[2]。這些重復序列的類型和各重復拷貝類別在同一物種不同染色體間以及基因的編碼區(qū)和非編碼區(qū)也有種屬和堿基組成的差異。……