果蠅Tap蛋白結構與功能的生物信息學分析*

劉洪超，胡 澍△，涂心明

(河南科技大學醫學院：1.生物醫學實驗教學中心/神經遺傳實驗室；2.人體解剖與組織胚胎學教研室，河南洛陽 471003)

果蠅Tap蛋白結構與功能的生物信息學分析*

劉洪超1，胡 澍1△，涂心明2

(河南科技大學醫學院：1.生物醫學實驗教學中心/神經遺傳實驗室；2.人體解剖與組織胚胎學教研室，河南洛陽 471003)

目的 利用生物信息學方法分析果蠅Tap蛋白的結構和功能。方法 基于NCBI數據庫中果蠅Tap蛋白的氨基酸序列，從蛋白質理化性質、跨膜區、信號肽、亞細胞定位、結構域、三維結構及物種間同源蛋白進化關系等方面進行分析。結果Tap蛋白為不穩定親水性蛋白，無跨膜區和信號肽，在細胞核中發揮生物學效應，具有堿性螺旋-環-螺旋(bHLH)結構域。Tap蛋白與來源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致，Tap蛋白與人類和嚙齒動物的編碼產物高度同源，在系統發生樹中距離最近。結論 果蠅Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型結構，可能在果蠅胚胎發育早期的神經發生、分化等過程中發揮作用。

Tap蛋白；螺旋-環-螺旋構型；分子結構；計算生物學；果蠅，黑腹

堿性螺旋-環-螺旋(basic helix-loop-helix，bHLH)蛋白家族廣泛分布于生物界，存在較高的保守性。大部分bHLH蛋白以同源二聚體或異源二聚體發揮轉錄因子作用，主要調節各種干細胞向終末細胞的分化，在骨骼肌、胰腺發育、血液發生、果蠅神經干細胞分化以及脊椎動物脊髓、端腦皮層的發育過程中發揮著重要作用[1-4]。果蠅Tap基因，也稱為biparous，分別由兩個研究小組針對mec-3和delilah的bHLH結構域通過低保真度雜交篩選和PCR篩選而鑒定出來，并被定位于3號染色體左臂(17359682-17361811)[5-6]?！?br>