中國(guó)北方漢族人群VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用與神經(jīng)管缺陷的關(guān)系

石鷗燕，蔡春泉，黎小沛，孫 偉，沈永明

(1.天津醫(yī)科大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院， 天津 300070； 天津市兒童醫(yī)院 2.外科； 3.檢驗(yàn)科， 天津 300074)

中國(guó)北方漢族人群VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用與神經(jīng)管缺陷的關(guān)系

石鷗燕1，蔡春泉2*，黎小沛1，孫 偉1，沈永明3

(1.天津醫(yī)科大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院， 天津 300070； 天津市兒童醫(yī)院 2.外科； 3.檢驗(yàn)科， 天津 300074)

目的探討VANGL1、FZD3和FZD6基因單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn)間的交互作用對(duì)中國(guó)北方漢族人群神經(jīng)管缺陷(NTDs)患病風(fēng)險(xiǎn)的影響。方法選取VANGL1基因2個(gè)SNPs(rs4 839 469和rs34 059 106)，F(xiàn)ZD3基因2個(gè)SNPs(rs2 241 802和rs28 639 533)以及FZD6基因3個(gè)SNPs(rs827 528、rs3 808 553和rs12 549 394)，采用PCR擴(kuò)增和測(cè)序的方法對(duì)135例NTDs患者和135例正常對(duì)照者進(jìn)行基因分型，使用多因子降維法軟件(MDR)分析基因-基因交互作用。結(jié)果VANGL1基因rs4 839 469位點(diǎn)基因型分布在病例組與對(duì)照組之間有差異 (Plt;0.05)，F(xiàn)ZD6基因rs3 808 553位點(diǎn)基因型分布在病例組與對(duì)照組之間有差異 (Plt;0.05)；MDR分析結(jié)果顯示VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用存在于兩位點(diǎn)模型(rs4 839 469-rs3 808 553)(OR=3.18，95% CI:1.85～5.44；χ2=18.39，Plt;0.0001)，3位點(diǎn)模型(rs4 839 469-rs2 241 802-rs3 808 553)(OR=4.17，95% CI:2.43～7.14；χ2=28.5，Plt;0.0001)以及4位點(diǎn)模型(rs4 839 469-rs2 241 802-rs827 528-rs3 808 553)(OR=7.34，95% CI:3.98～13.54；χ2=45.3，Plt;0.0001)。結(jié)論VANGL1、FZD3和FZD6基因存在交互作用，并可能增加NTDs的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。

VANGL1；FZD3；FZD6；基因-基因交互作用；神經(jīng)管缺陷

神經(jīng)管缺陷(neural tube defects, NTDs)是一類(lèi)常見(jiàn)的出生缺陷，是由于胚胎發(fā)育過(guò)程中神經(jīng)管閉合不全所引起，臨床上主要表現(xiàn)為無(wú)腦畸形、腦膜/腦膨出、脊柱裂、脊髓脊膜膨出等[1]。研究證實(shí)NTDs是多因素相關(guān)疾病，是遺傳和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果。最近國(guó)內(nèi)外研究證實(shí)了VANGL1基因與NTDs存在高度相關(guān)性[2-4]，中國(guó)北方漢族人群VNAGL1基因存在Ala116Pro變異，變異后其所處的α螺旋結(jié)構(gòu)片段明顯縮短[5]。FZD3和FZD6基因在最近的研究中也發(fā)現(xiàn)與NTDs相關(guān)聯(lián)[6-7]。那么同是PCP信號(hào)通路中的核心基因，VANGL1在NTDs發(fā)病過(guò)程中的作用是否與FZD3/6相關(guān)聯(lián)？……