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中國撒拉族常染色體STR基因座遺傳多態性研究

2014-04-29 00:00:00姚宏兵陶曉嵐林沛婷李立新馬麗英
醫學信息 2014年33期

摘要:本文利用常染色體的15個STR基因座,對西北特有少數民族撒拉族進行基因掃描,獲得15個STR位點的A基因頻率、雜合度、個體識別能力、非父排除率、累計非父排除率、耦合率和多態信息含量等遺傳信息,顯示15個STR位點具有中度或高度多態性,結論:所選擇的15個STR位點具有中等或較高的個體識別力和多態性信息量,可用于群體遺傳學和法醫學研究。

關鍵詞:西北特有少數民族;STR基因座;遺傳多態性

撒拉族是三個位于中國西北部的特有少數民族,其語言屬阿爾泰語系突厥語族西匈奴語支的烏古斯語組,主要聚居在今天甘青結合部的青海循化、化隆二縣以及甘肅省積石山縣大河家一帶。據2000年第五次全國人口普查資料,全國的撒拉族人口為104503人。

短串聯重復序列(short tandem repeat,STR)屬微衛星DNA序列,重復單位為2~7 bp。STR基因座在人類基因組中含量豐富,分布廣泛,據估計三核苷酸和四核苷酸重復序列的STR基因座約有20萬個,平均每隔15~20 kb就有一個。它不僅是繪制基因組物理圖譜和遺傳連鎖分析的理想標記,也是群體遺傳學和法醫遺傳學高信息基因座的豐富來源。在法醫同一認定、親緣關系鑒定、人口遺傳結構和疾病相關性研究等方面發揮重要作用[1]。

1資料與方法

1.1一般資料 撒拉族多名無關個體FTA血卡樣本全部來自日常案檢積累。

1.2方法 采用美國AB公司AmpFSTR○R華夏TMPCR直接擴增試劑盒,在AB 9700型擴增儀上對15個STR基因座進行復合擴增。PCR擴增體系為10?滋l,PCR產物經AB 3500XL毛細管電泳,用GeneMapper○RID-X 1.0.1版進行電泳數據分析。應用PowerStats軟件計算,得到15個STR基因座的基因頻率、觀察雜合度(Ho)、個體識別能力(DP)、非父排除率(PE)、耦合率(Pm)和多態信息含量(PIC)[2]。

2結果與討論

西北特有撒拉族人群無關個體15個STR基因座等位基因及其頻率分布見表1。各基因座的群體遺傳學參數見表2。撒拉族人群中,個體識別力0.50~0.84,D8S1179最低,多態性信息含量0.50~0.80,非父排除率0.08~1.00。說明這15個STR在撒拉族群體中具有較高多態性,可以用于該地區法醫學親子鑒定和個體識別。

參考文獻:

[1]陶曉嵐,姚宏兵,郝思靜.甘肅東鄉族人群15個STR基因座遺傳多態性[J]法醫學雜志,2014,V30(2):135-136

[2]伍新堯.高級法醫學[M]鄭州大學出版社,2002:289-292.

編輯/許言

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