徐舒遠(yuǎn),陳和平,黨瑞華,藍(lán)賢勇,陳 宏,雷初朝*
(1.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,陜西楊凌712100;2.河南新縣畜牧局疫病預(yù)防控制中心,河南新縣465550)
在哺乳動(dòng)物中,Y 染色體約占單倍體基因組的2%,位于Y 染色體短臂末端的一個(gè)小區(qū)域叫擬常染色體區(qū)(PAR),剩下的為Y 染色體雄性特異區(qū)(MSY),即非重組區(qū),分布在Y 染色體區(qū)的短臂和長臂上。PAR 約占Y 染色體DNA 含量的5%,MSY 則占Y 染色體中DNA 含量的95%[1-2]。這兩個(gè)Y 染色體區(qū)域具有完全不同的特性,在減數(shù)分裂時(shí),PAR 區(qū)和X 染色體可以配對(duì),而MSY 區(qū)和X染色體則不配對(duì)。由于MSY 區(qū)在減數(shù)分裂時(shí)不重組,因此在長期的進(jìn)化過程中,一些Y 染色體基因逐漸失去其功能而變成假基因,另一些Y 染色體區(qū)域存在極其豐富的重復(fù)序列,而保留下來的Y 染色體基因在維持動(dòng)物雄性特性、精子發(fā)生和發(fā)育方面具有十分重要的作用,從而使得Y 染色體上的基因十分特異[3]。
Y 染色體分子遺傳標(biāo)記一般是指Y 染色體上非重組區(qū)(MSY)的標(biāo)記。研究Y 染色體非重組區(qū)標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn):第一,Y 染色體非重組區(qū)遵循父系遺傳(父子相傳),不與X 染色體重組,其突變率比mtDNA 低,是進(jìn)化事件的忠實(shí)記錄者。第二,Y 染色體為單倍體,其有效群體大小不及常染色體位點(diǎn),較易產(chǎn)生動(dòng)物特異的單倍型[1,4]。許多研究已經(jīng)證明,一旦找到足夠數(shù)量的家畜Y-SNPs和Y-STRs標(biāo)記,對(duì)于研究家畜遺傳多樣性及起源進(jìn)化具有非常重要的價(jià)值[5-9];而Y 染色體基因的拷貝數(shù)變異(CNV)對(duì)于維持基因家族的存在、功能,雄性動(dòng)物的精子發(fā)生與發(fā)育、代謝以及一些疾病的發(fā)生等有著重要的意義[10-11]。……