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鵝細小病毒PCR-DHPLC檢測方法的建立

2014-01-21 01:17:06饒桂波邵洪澤胡桂學吳健敏
家畜生態學報 2014年5期
關鍵詞:檢測方法

饒桂波,邵洪澤,胡桂學*,吳健敏

(1.廣西獸醫研究所,廣西南寧530001;2.吉林省獸醫科學研究所,吉林長春130062;3.吉林農業大學,吉林長春130118)

目前診斷鵝細小病毒(GPV)的主要方法有瓊脂擴散試驗、免疫熒光抗體試驗、黃牛精子抑制試驗、ELISA 和PCR 等[1-4]。近年來將變性高效液相色譜法(DHPLC)與PCR 方法結合用于微生物的檢測,使PCR 方法的敏感度提高了100倍,大大提高了樣品的檢出率[5-6]。為了解決鵝群中因GPV 排毒量低而難以檢出的問題,本研究擬建立一種敏感性更高的GPV PCR-DHPLC 檢測方法,用于鵝群中GPV 的檢測,為臨床GPV 感染的檢測,提供一種特異、敏感、快速、高通量的檢測手段。

1 材料與方法

1.1 毒株

GPV JLDA 株,由吉林省畜牧獸醫科學研究院贈送;GPV JLTP株,由本實驗室分離保存。

1.2 試劑

Taq DNA Polymerase、dNTPs、100 bp DNA Ladder、T4DNA 連接試劑盒、pMD18-T 載體等,購自寶生物工程有限公司(大連)。

1.3 引物設計

根據GenBank中VP3 的基因序列,用Primer Premier 5.0軟件設計引物,序列如下:P1:5'-ATA AGCGCC TTTCACAGC-3',P2:5'-AACGCAGGATCAGACGAA-3',由寶生物工程有限公司(大連)合成。

1.4 PCR 體系建立

采用50μL 反應體系,在0.5 mL 反應管中依次加Buffer 5μL、2.5mmol/L dNTPs 2μL、滅菌二餾水35μL、2U/μL Taq酶1μL、20pmol/μL上游引物、下游引物各1μL、模板5μL。混勻后稍離心,通過梯度PCR 確定反應條件。

1.5 DHPLC條件選擇

根據變性高效液相色譜儀Aglient 1100 色譜柱:PS.DVB&C18DNASep色譜柱(4.6mm ×50 mm,粒度3mm)。利用儀器軟件,根據目的基因序列的大小,堿基比率等預測柱溫。在柱溫確定后,摸索流動液體配比及流速,確定最佳條件。

1.6 PCR-DHPLC特異性分析

提取鵝副粘病毒、鴨瘟病毒及正常番鴨胚尿囊液的核酸進行PCR,按照1.4 的體系條件對PCR產物,進行PCR-DHPLC檢測,鑒定其特異性。

1.7 PCR-DHPLC敏感性分析

將GPV JLTP株病毒接種番鴨胚,提取尿囊液中的病毒核酸作為模板,利用上述引物擴增目的片段,擴增產物連接到pMD18-T 載體上克隆。……

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