石斑魚屬魚類線粒體基因組序列特征及系統發育信息評估

黃小林， 呂國敏， 劉付永忠， 李 濤， 蔡云川， 馬志洲， 黃 忠

(1. 中國水產科學研究院南海水產研究所 農業部南海漁業資源環境重點野外科學觀測試驗站，廣州 510300；2. 廣東省水產技術推廣總站,廣州 510222)

石斑魚是石斑魚屬(Epinephelus)魚類的統稱，在分類學上隸屬于鱸形目(Perciformes)、鱸亞目(Percoidei)、鮨科(Serranidae)、石斑魚亞科(Epinephelinae)。石斑魚的種類較多，全世界已記錄有100多種，其中，中國有40多種。石斑魚廣泛分布于熱帶至溫帶海域，是珊瑚礁中的重要捕食者，在海洋生態中占據著重要地位。該屬魚類多為名貴的食用魚，部分已成為重要的養殖對象，具有巨大的市場潛力。近年來，由于人類活動的影響：掠奪性開發、過度捕撈、海洋環境的污染和破壞、養殖群體的近親繁殖、外來種侵入等，魚類資源日益衰退[1-3]，而石斑魚個體發育中存在先雌后雄的性轉變過程，雄性親魚均高齡化(一般6齡以上)[4]，致使其自然資源的減少更加嚴重，部分種類已被世界自然保護聯盟(The World Conservation Union，簡稱IUCN)收錄到《瀕危物種紅皮書》(IUCN Red List )中，赤點石斑魚(Epinephelusakaara)等被列為瀕危物種[5]。

動物線粒體DNA是核外的遺傳物質，具有母系遺傳、序列簡單、進化速率快等特點，在進化遺傳學研究中得到廣泛應用。線粒體全基因組序列與單個基因標記相比，前者所包含的信息量更大，能反映出物種在基因組水平的遺傳特征，如基因的組成、排布等[6-9]。目前，在GenBank中已登錄有6種石斑魚線粒體基因組序列。本文在6條石斑魚線粒體基因組研究的基礎上，全面分析石斑魚線粒體基因組的基本結構特征和變異位點，檢測蛋白質編碼基因在進化過程中受到的選擇壓力，評估不同基因在石斑魚系統發育分析中的適用性?！?br>