人類核糖體蛋白加工假基因與其同源基因的序列信息差異

摘要：引入信息參數—非均勻指數和緊鄰堿基關聯，對核糖體蛋白加工假基因與對應核糖體蛋白基因編碼序列之間進行了對比分析，發現絕大多數（約占89%）假基因的非均勻性明顯弱于對應功能基因編碼序列，絕大多數（約占88%）假基因的緊鄰堿基關聯強于對應基因編碼序列。

關鍵詞：加工假基因 功能基因 非均勻指數 堿基關聯

中圖分類號：Q61 文獻標識碼：A文章編號：1674-098X（2013）01（b）-00-02

假基因是功能基因的缺陷拷貝，其序列與功能基因序列相似性較高。假基因的來源[1]有兩個方面：一是基因組DNA復制或不均等交換過程中基因序列發生突變（如點突變、插入或缺失），導致復制后的基因在轉錄和翻譯時出現異常，從而使其喪失正常功能而成為重復假基因；二是基因轉錄物mRNA反轉錄后以cDNA的方式重新整合到基因組，由于插入位點不合適或序列發生突變而失去正常功能，成為加工假基因。

密碼子使用是編碼序列與非編碼序列的基本差異。三聯體密碼子的重復是核酸序列編碼區域的最主要的特征，由于編碼區密碼子的三個位點上的堿基使用不均勻，編碼區在堿基使用方面體現出顯著的不均勻性。假基因是由編碼蛋白質的功能基因演變而來的非編碼序列，因此假基因和對應基因的堿基使用非均勻性可能有明顯差異。遺傳信息大部分都是儲藏在細胞內的DNA（或RNA）分子中。信息主要存在于DNA序列的堿基關聯之中。一般來講，假基因是喪失了正常功能的序列，這種功能缺失會使其堿基關聯減弱？……