擬南芥和大白菜LUG蛋白家族的生物信息學(xué)分析

馬宗琪，王鳳德，邱念偉

擬南芥和大白菜LUG蛋白家族的生物信息學(xué)分析

馬宗琪1，王鳳德2，*邱念偉1

１.師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，山東，曲阜 273165； 2.山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所，山東，濟南 250100）

LUG蛋白屬于WD40超家族基因，具有7個重復(fù)的WD40結(jié)構(gòu)域，參與花器官的發(fā)育。本項研究系統(tǒng)鑒定了7個擬南芥和5個大白菜的LUG基因，并對這些基因編碼的蛋白質(zhì)序列進行了序列保守性和系統(tǒng)進化分析。結(jié)果表明，除了AtLUG6含有5個重復(fù)的WD40結(jié)構(gòu)域之外，其余所有的LUG蛋白都具有7個重復(fù)的WD40結(jié)構(gòu)域。在進化上，LUG蛋白家族可分為兩個不同的亞家族，并且這種特征在擬南芥和大白菜分離之前就已經(jīng)形成。

擬南芥()；大白菜()；生物信息學(xué)分析；LUG蛋白；WD40結(jié)構(gòu)

關(guān)于花器官發(fā)育的一個重要模型是ABC模型，其基本理論是將花分為萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊4輪，這4輪花器官分別由A、B、C三類基因調(diào)控，其中A類基因調(diào)控萼片的發(fā)育，A和B類基因共同作用調(diào)控花瓣的發(fā)育，B和C類基因共同決定雄蕊的發(fā)育，C類基因決定雌蕊的發(fā)育[1]。在擬南芥中，A類基因以()、()為代表，B類基因以()和()為代表，C類基因以()為代表。其中C類基因決定內(nèi)兩輪，即雄蕊和雌蕊的發(fā)育，只在內(nèi)兩輪中表達。LEUNIG (LUG)是在擬南芥中發(fā)現(xiàn)的調(diào)節(jié)基因表達的轉(zhuǎn)錄抑制因子，參與擬南芥的花發(fā)育過程[2]。在()和()突變體中，基因異位地在花的外兩輪表達，導(dǎo)致萼片轉(zhuǎn)化成心皮，花冠轉(zhuǎn)化成雄蕊，說明基因的功能是在花的外兩輪中抑制基因的表達[3-4]。此外，也參與調(diào)節(jié)其它與無關(guān)的發(fā)育過程, 例如突變體還表現(xiàn)出柱頭裂開、心皮和胚珠發(fā)育不正常、雌性和雄性育性降低，花和葉子狹窄等性狀[5-7]。……