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宮頸癌組織中HPV16型E6/E7序列突變分析*

2012-06-06 13:24:34張志珊莊建良李愛祿蔣燕成
中國人獸共患病學報 2012年6期

張志珊,莊建良,李愛祿,蔣燕成

宮頸癌與人類乳頭狀瘤病毒(HPV)的感染密切相關。HPV屬于性傳播疾病病原體,目前已鑒定出100多種基因亞型,其中至少有40個類型的HPV可以感染生殖部位,根據其致癌能力的大小分為高危型、中間型和低危型兩種,高危型包括HPV16、18、31、33、35、39、43、51、52、56、58、59、68、73、82等型,高危型HPV持續感染是激發宮頸上皮惡性轉化的最重要危險因素,是宮頸癌及癌前病變發生發展的必要條件[1]。

HPV的基因約長8kb,主要由早期基因(E區)、晚期基因(L區)和長控制區(LCR)組成,E區有6個開放讀框(ORF),編碼6個早期蛋白,即El-E7。其中E6、E7基因在細胞癌變中起重要作用。在持續感染高危型HPV病毒后,病毒基因組會整合到宿主染色體中,E6和E7基因的表達調控也受到干擾。E6、E7基因特定位點的突變會使病毒更易誘導細胞產生癌變,增大再次感染或從宿主免疫系統逃逸的機會。本文對本自泉州地區的宮頸癌組織中HPV16型的E6、E7基因的序列進行分析,探索HPV16型E6、E7基因突變情況及其與宮頸癌發生的相關性,這對于宮頸癌的防治及指導疫苗設計具有重要的意義。

1 材料與方法

1.1 標本來源及DNA的提取 35例宮頸癌組織來自2009年1月-2010年12月本院婦產科宮頸癌術后樣本(經病理檢查確診),這35例標本在前期實驗中,通過對HPV亞型進行分型檢測后,確定為HPV16型感染。全基因組DNA的提取采用QIAGEN公司的DNA mini kit。

1.2 PCR引物的設計與合成 根據GenBank公布的 HPV16序列(EU918764),應用 Premier 5.0軟件設計兩對引物分別用于擴增E6、E7基因。引物由上海生工生物工程有限公司合成,引物如下:

1.3 PCR擴增 引物E6F/E6R用于擴增E6基因,E7F/E7R用于擴增E7基因。反應體系為:10×buffer 5μL,dNTP 4μL,上、下游引物(20μmmol/L)各1μL,Ex Taq酶2.5U,模板1μL,加H2O至50μL。循環條件:95℃預變性5min,95℃30s,55℃30s,72℃30s,35個循環,72℃ 延伸5min。PCR產物經瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,送上海生物工程有限公司進行測序。

1.4 序列分析 測得的序列用Sequencher軟件進行編輯、校正后,使用ClustalX和BioEdit進行基因的比對和多態性分析。

2 結 果

2.1 HPV16E6基因變異分析 35例樣本的E6基因均成功擴增并測序。將測序結果與HPV16型的野生株(德國標準株,基因號K02718)[2]進行對比分析,結果發現35例樣本中有32例存在基因突變,突變率為91.4%。共涉及到12個位點的14種不同突變模式,其中10個位點的變異為錯義突變,另外2個位點為無義突變(A131C和T241G)。突變頻率最高的是178位點,35例樣本中有26例由原來的T突變為G,1例突變為A,結果均導致氨基酸的轉換D25E(77.1%)。其它位點突變導致的氨基酸轉 換 有 E113D,L83V,L28V,S138C,T21S,R144T,S142T,Q20P,T21I,R10G。突變頻率的分布見表1,E6氨基酸序列比對見圖1。

表1 HPV16E6基因變異分析Tab.1 Sequence variation of HPV 16E6in cervical cancer tissue

圖1 HPV16E6蛋白氨基酸序列比對Fig.1 Alignment of amino acid sequences of HPV 16E6

2.2 HPV16E7基因變異分析 35例樣本中,成功測序的有28例。通過對E7基因進行比對后,共發現5個突變位點,突變位點的數量低于E6基因,突變頻率與E6基因接近(89.2%)。氨基酸比對結果顯示,有2個位點為錯義突變,3個位點為無義突變(圖2)。28例樣本中有21例發生A647G突變,導致氨基酸的轉換(N29S),是突變頻率最高的位點(75.0%)。另有1例發生L28F的氨基酸轉換。在無義突變中,突變頻率從高到低分別為T846C(75.0%)、G666A(32.1%),T843C(21.4%)。突變頻率分布見表2。

表2 HPV16E7基因變異分析Tab.2 Sequence variation of HPV 16E7in cervical cancer tissue

3 討 論

HPV感染是宮頸癌的首要病因,在全世界范圍內,最常見的感染亞型是HPV16型。不同的HPV16變異株具有不同的生物學活性和致癌潛能,其中某些位點的變異與宮頸癌的發生密切相關[3-4]。來自世界范圍的分子流行病學資料顯示,E6基因的突變增強了致癌的危險性,同時這些突變株的致癌能力具有地域性[5],Yamada等人曾報道在歐洲宮頸癌患者中,野生型E6基因(德國株)的分布頻率為34%[6],隨后Zehbe等人報道,在瑞士宮頸癌患者中野生型E6基因的分布頻率僅為6%[3],與Pillai等人報道的印度人群中9.1%的流行率接近[7]。本次研究結果顯示,35例宮頸癌患者中,有3例為野生型E6基因,僅占7.9%。在所有的E6突變位點中,報道最多的突變是T350G,不同的地域的分布頻率差別較大,從2%~93.5%不等[6,8-11]。此位點的變異導致E6蛋白L83V氨基酸轉換,使其對鱗狀上皮和腺上皮細胞生長轉化能力增強[4],與宮頸上皮內瘤樣病變Ⅰ級向Ⅲ級轉化有關[12]。而來自德國和俄羅斯的報道則認為L83V變異與侵潤性癌無關[13-14]。本次研究發現,泉州地區 HPV16E6基因L83V變異僅有3例,占7.9%,頻率最高的突變是D25E,占77.1%,其次為E113D,占11.4%。其它變異還有 L28V,S138C,T21S,R144T,S142T,Q20P,T21I,R10G。我們發現D25E變異在泉州地區宮頸癌患者中最為流行,這與以往 Wu Y[10]等人報道的65.5%,Kang[15]報道的85.2%接近。該變異在東亞人種的分布頻率高顯著高于其它地區,被認為是亞洲型尤其是東亞病毒分枝的特異性變異。此次研究還發現了一些以往沒有報道過的變異,如T21S,Q20P,T21I,R10G,其變異的頻率較低,與宮頸癌的相關性有待于進一步探討。

本研究顯示泉州地區宮頸癌患者中HPV16E7基因也存在高頻率的突變(89.2%)。與E6變異位點相比,本次研究中E7的變異位點相對較少,僅發現5個位點突變。只存在2種類型的錯義突變N29S和L28F,其余3種均為無義突變。突變頻率最高的是A647G突變(導致N29S氨基酸轉換)和T846C(無義突變),突變率均為75.0%,與 Wu Y報道的70.2%和67.1%相近[10]。在以往報道中,A647G和T846C是最常見的2種變異,但是突變的頻率差別較大。對于N29S的突變率,泰國宮頸癌患者為63.0%[16],韓國為59.5%[17],德國僅為0.9%[13]。這些資料顯示,N29S突變主要存在亞洲人群,而較少發生在歐洲人群中,提示E7變異具有明顯的地域性。研究還發現A647G和T846C這2種突變都是同時存在同一個樣本中。這個結果和熊光武[18]等人的報道一致,可能提示這是中國人群中特異的突變類型,對于研究針對中國人群的HPV疫苗提供一定的線索。

圖2 HPV16E7蛋白氨基酸序列比對Fig.2 Alignment of amino acid sequences of HPV 16E7

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