999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

豬Dlx5基因多態性及其與豬體尺和胸椎數的關系

2012-04-29 09:28:59邢晉祎戈新王建華孫力
湖北農業科學 2012年3期

邢晉祎 戈新 王建華 孫力

摘要:為探討豬遠端缺失基因5(distal-less homeobox 5,Dlx5)的多態性、群體分布特性及其與體尺和胸椎數的關系,采用PCR-RFLP方法檢測了豬Dlx5基因g.394C>T位點在6個中外豬品種中的多態性分布,并分析了該位點與豬體尺和胸椎數的關系。檢測結果表明,經HhaⅠ酶切后在6個豬品種群體均發現了CC、CT和TT 3種基因型,其中C等位基因在萊蕪黑豬中為優勢等位基因,而T等位基因在里岔黑豬、魯萊黑豬、杜洛克豬、大約克豬和長白豬中占優勢。在該多態性位點,萊蕪黑豬、里岔黑豬、魯萊黑豬、杜洛克和長白豬群體均處于哈代—溫伯格平衡(P>0.05),而大約克豬群體偏離平衡狀態(P<0.05);基因型在群體間的分布差異極顯著(P<0.01)。群體遺傳特性分析表明,有效等位基因數在1.254~1.991之間;杜洛克豬的多態信息含量為0.182,屬于低度多態,其余品種均在0.254~0.374之間,屬于中度多態。關聯分析結果表明,該多態性位點對萊蕪黑豬體長、體高、屠前活重、腹圍、胸圍、腿臀圍和胸椎數以及里岔黑豬胸椎數的影響均不顯著(P>0.05)。Dlx5基因g.394C>T位點在豬群中存在多態,基因型分布在萊蕪黑豬與其他豬種間不同,與豬體尺和胸椎數無顯著關聯。

關鍵詞:豬;遠端缺失基因5(distal-less homeobox 5,Dlx5);多態性;體尺;胸椎

中圖分類號:S828.8+9文獻標識碼: A 文章編號:0439-8114(2012)03-0552-04

Polymorphisms of Distal-less Homeobox 5 (Dlx5) Gene in Pigs and Its Association with Body Sizes and Thoracic Spine Numbers

XING Jin-yi1,GE Xin2,WANG Jian-hua2,SUN Li3

(1. College of Life Science, Linyi University, Linyi 276005, Shandong, China; 2. Institute of Animal Science of Qingdao, Qingdao 266100,Shandong,China; 3. Station of Animal Husbandry and Veterinary Medicineof Qingdao, Qingdao 266071,Shandong,China)

Abstract: This study was conducted to investigate the polymorphism, genetic distribution of distal-less homeobox 5 gene (Dlx5) in pigs and its associations with body sizes and thoracic spine numbers. The polymorphism distribution of g.394C>T loci. in Dlx5 gene of 6 breeds of pigs were detected by PCR-RFLP and the relationship between the Dlx5 genotypes and body sizes and thoracic spine numbers were analyzed. The results showed that there were three genotypes such as CC, TC and TT in the 6 pig populations found by enzyme digestion of HhaⅠ. Allele C was dominant in Laiwu black pigs, and allele T was dominant in Licha black pigs, Lulai pigs, Duroc pigs, Yorkshire pigs and Landrace pigs, respectively. A chi-square analysis showed that the genotype distribution in this polymorphism loci. in Laiwu black pigs, Licha black pigs, Lulai Black pigs, Duroc pigs and Landrace pigs populations were in Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05), whereas was not in Yorkshire pigs (P<0.05). The distribution of CC, TC and TT genotypes was significantly different (P<0.01) among six populations. Population genetics analysis showed that effective number of alleles were ranged from 1.254 to 1.991. The polymorphism information content (PIC)in Duroc pigs was 0.182 which was in low polymorphic, while it was ranged from 0.254~0.374 in other pigs which was in moderate polymorphic. The association analysis showed that the Dlx5 g.394C>T mutation was not significantly associated with body length, height at withers, live weight, abdominal circumference, chest circumference, hip circumference and numbers of thoracic spine of Laiwu black pigs and numbers of thoracic spine of Licha black pigs(P>0.05). It indicated that there the g.394C>T loci in Dlx5 gene were polymorphism in the six pig populations and the genotype distribution in Laiwu black pigs were different with other breeds. And no significant association was detected between the loci. and body sizes and thoracic spine numbers in pigs.

Key words: pig; distal-less homeobox 5 gene; polymorphism; body sizes; thoracic spine

遠端缺失基因(Distal-less homeobox,Dlx)主要調控動物遠近軸的發育。其中,脊椎動物Dlx基因編碼一種保守性較高的轉錄因子,在軟骨和骨骼的形成中可能發揮一定作用。Dlx5在骨骼發育的早期開始表達,能直接激活骨骼形成和間接激活骨骼吸收以及促進骨折愈合,是骨骼更新的重要調控子[1,2]。研究發現,豬Dlx5基因外顯子1存在一個單核苷酸多態性(SNP)(EU168272: g.394C>T),豬群中存在TT、TC和CC 3種基因型,與豬的部分胴體性狀有關[3]。但該多態位點與胸椎數及其相關性狀的關系未見報道。因此,本研究分析了該多態性位點在6個中外豬種中的多態性,并分析了其與萊蕪黑豬體尺和胸椎數以及與里岔黑豬胸椎數的關系,以期為闡明Dlx5在豬重要經濟性狀形成中的作用奠定基礎,為發掘地方豬種的基因資源及培育新品系提供理論依據。

1材料與方法

1.1試驗材料

本試驗所用的3個山東地方/培育豬種,分別為萊蕪黑豬26頭和魯萊黑豬(大約克♂×萊蕪黑豬 ♀)30頭(采自山東省萊蕪黑豬原種豬場),里岔黑豬75頭(采自山東省膠州市里岔黑豬育種中心)。3個引進豬種分別為杜洛克豬70頭、大約克豬62頭和長白豬39頭(采自山東省農業科學院畜牧研究所良種豬育種中心)。所有試驗豬飼喂同一日糧、自由采食,飼養管理、防疫措施一致。采集豬耳組織放入70%乙醇中,-20 ℃保存。

1.2試驗方法

1.2.1DNA提取豬耳組織中基因組DNA提取按常規苯酚/氯仿方法進行,0.8%瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測基因組的濃度和純度,-20 ℃保存。

1.2.2性能測定對達到365日齡的26頭萊蕪黑豬測定體長、屠前活體質量、腹圍、胸圍、腿臀圍和胸椎數,測定方法根據《種豬測定原理與方法》進行[4]。對達到100 kg左右的75頭里岔黑豬屠宰,記錄胸椎數。

1.2.3PCR擴增引物參照Cheng等[3]序列,由上海生工生物工程技術有限公司合成。引物序列為:F:5′-GCCACCGCCAGTGAATGA-3′,R:5′-TATCTGTCCCCACCCCCAC-3′。PCR反應體系:10×PCR Buffer 2.5 μL,MgCl2(25 mmol/L)2 μL,dNTPs(各2.5 mmol/L)2 μL(TaKaRa),上下游引物(25 μmol/L)各0.4 μL,rTaq DNA聚合酶(5 U/μL)0.2 μL(TaKaRa),基因組DNA(50~100 ng/μL)1 μL,滅菌超純水加至25 μL。PCR擴增程序:94 ℃ 4 min,然后94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 40 s,進行35個循環,72 ℃ 10 min。PCR產物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

1.2.4PCR-RFLP在4 μL PCR產物中加入4 U的HhaⅠ內切酶(TaKaRa),10×M Buffer 1 μL,滅菌超純水加至10 μL,37 ℃水浴消化6 h,1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,觀察和記錄酶切結果,判斷個體的基因型。

1.2.5PCR產物測序經HhaⅠ內切酶酶切后,對不同基因型個體的PCR產物用柱式膠回收試劑盒回收純化,回收后的PCR產物送上海生工生物工程技術服務公司直接測序。

1.3統計分析

統計HhaⅠ酶切后的各種基因型,用PopGen32軟件計算基因頻率、遺傳純合度(H0)、遺傳雜合度(He)、有效等位基因數(Ne),并作χ2適合性和獨立性檢驗;用軟件PIC_Calc 0.6計算多態信息含量(PIC)。根據固定效應模型,用SAS 8.2軟件GLM程序對萊蕪黑豬不同基因型個體體尺和胸椎數以及里岔黑豬胸椎數的最小二乘均值進行估計和顯著性檢驗。統計分析模型為:Yij=μ+Gi+Sj+eij,其中Yij為性狀表型值,μ為群體平均值,Gi為基因型效應,Sj為性別效應,eij為殘差效應。

2結果與分析

2.1Dlx5基因PCR擴增和HhaⅠ酶切結果

以豬耳組織DNA為模板,經PCR擴增,得到1條399 bp的特異性條帶(圖1),與根據GenBank登錄序列計算的片段大小相同。PCR產物經HhaⅠ限制性內切酶酶切后,得到3種基因型(圖1),分別為TT(399 bp),TC(399/222/177 bp),CC(222/177 bp)。

2.2不同基因型的序列差別

測序結果表明,豬Dlx5基因394位堿基C→T,通過與人、小鼠、大鼠和雞Dlx5基因比對發現,這些物種在該位點均為C,3種基因型測序結果如圖2所示。

2.3不同豬種Dlx5基因的基因型和基因頻率及群體χ2檢驗

根據HhaⅠ內切酶酶切結果,統計6個豬群的基因型和基因頻率分布見表1。從表1可知,每個群體均檢測到3種基因型,在萊蕪黑豬中C為優勢等位基因,而魯萊黑豬T為優勢等位基因,TC在這兩個豬種中均為優勢基因型;在里岔黑豬、杜洛克豬和大約克豬中T為優勢等位基因,TT為優勢基因型;在長白豬中也是T為優勢等位基因,TT和TC均為優勢基因型,其基因型頻率均為0.436。

經χ2適合性檢驗發現,除了大約克豬外,其余群體基因型分布均達到了哈代—溫伯格平衡(P>0.05)(表1)。經χ2獨立性檢驗,不同基因型在群體間的分布差異極顯著(P<0.01,χ2=61.66>χ20.01(10)=23.209)(表2)。由表2可知,萊蕪黑豬與里岔黑豬、杜洛克豬、大約克豬差異極顯著(P<0.01);里岔黑豬與魯萊黑豬、杜洛克豬和大約克豬差異極顯著(P<0.01);魯萊黑豬與杜洛克豬差異極顯著(P<0.01),與大約克豬差異顯著(P<0.05);杜洛克豬與大約克豬和長白豬差異極顯著(P<0.01);大約克豬與長白豬之間差異極顯著(P<0.01),其余豬種之間差異均不顯著(P>0.05)。

2.4Dlx5基因的遺傳特性分析

Dlx5基因在6個豬群的遺傳特性分析見表3。結果表明,所檢測各群體的雜合度(He)較大,雜合度由低到高依次為杜洛克、里岔黑豬、大約克豬、長白豬、魯萊黑豬、萊蕪黑豬。多態信息含量(PIC)分析結果表明,除杜洛克豬PIC<0.250,處于低度多態外,其余各群體PIC均在0.250~0.500之間,表明該位點在這5個豬種中均處于中度多態。

2.5Dlx5基因不同基因型與萊蕪黑豬體尺和胸椎數的關聯分析

在對萊蕪黑豬Dlx5基因g.394C>T位點多態性檢測的基礎上,對26頭萊蕪黑豬體尺和胸椎數與該位點多態性的關系進行了分析(表4)。結果顯示,3種基因型TT、TC和CC對萊蕪黑豬體尺和胸椎數影響均不顯著(P>0.05)。

2.6Dlx5基因不同基因型與里岔黑豬胸椎數的關聯分析

對75頭里岔黑豬胸椎數關聯分析結果表明(表5),TT、TC和CC 3種基因型對里岔黑豬胸椎數影響同樣未達到差異顯著的水平(P>0.05)。

3討論

3.1Dlx5基因多態性在不同豬群中的遺傳分析

研究表明Dlx5基因的失活可以使小鼠顱面骨、中軸骨和附肢骨骼異常,導致圍產期小鼠死亡[5],所以Dlx5基因對于調節哺乳動物肢體的發育起著非常重要的作用。本研究對同源盒基因Dlx5外顯子1的多態性在不同豬群中的分布進行了檢測,在所檢測的6個豬群中均發現了3種基因型,但等位基因T和C在不同豬群存在一定差異。在萊蕪黑豬中C等位基因占優勢,但在其他豬種中均是T等位基因占優勢,而Cheng等[3]在所檢測的310頭大約克豬×梅山豬的雜交F2代中卻是C等位基因占優勢。經序列分析發現在人(GenBank No:NM_005221.5)、小鼠(GenBank No:NM_198854.1,NM_010056.2)、大鼠(GenBank No:NM_012943.1)和雞(GenBank No: NM_204159.1)Dlx5基因的該位點也是C等位基因占優勢。本研究之所以與上述研究和其他動物Dlx5基因在該位點存在差異,可能與動物品種有關。

3.2Dlx5基因多態性與萊蕪黑豬體尺和胸椎數的關系

研究表明,Dlx5基因能直接調節谷氨酸脫氫酶的表達和促進GABAergic(g-aminobutyric acid ergic)神經元的分化[6],并且已經證明Dlx5在人類淋巴母細胞核和大腦組織中具有印記效應[7],但Kimura等[8]認為在小鼠腦中不存在印記效應。最近的研究表明,Dlx5基因在雜交豬的骨骼肌、脂肪、肺、胃和小腸中呈母性表達,而在心、肝、腎、子宮、卵巢、睪丸或者垂體中不存在印記效應[3]。而印記基因在調控哺乳動物胎兒生長、發育和胎盤的功能以及出生后的行為方面具有重要的功能。Dlx5基因外顯子1C→T的突變導致丙氨酸變為纈氨酸,這可能改變蛋白質的結構,而蛋白質結構的變化可能影響到骨骼的發育和生長激素的分泌[3]。

豬體長與胸椎和腰椎的數量有關,其胸腰椎骨數一般在20枚左右,一般每增加1枚椎骨數,體長可以增加1.84 cm。豬椎骨數的遺傳力為0.75,胴體長與椎骨數有強的遺傳相關[9]。本試驗中萊蕪黑豬TC基因型個體胸椎數多于TT和CC基因型個體,而里岔黑豬TT基因型胸椎數稍多于TC基因型,但均未達到差異顯著水平(P>0.05),是否TT或者TC基因型對豬的脊椎發育起著一定的作用,尚需進一步研究。此前,Cheng等[3]發現雜交豬(大白豬×梅山豬)F2代資源家系的不同基因型胴體長、骨骼百分比、平均背膘厚等性狀呈極顯著差異,而本研究不同基因型其體尺差異卻不顯著,可能與樣本含量較少有關。另外,最近研究發現BMP-2蛋白能促進Dlx5 mRNA表達水平增高[10],而屬于BMPs亞家族的GDF11基因在確立骨骼模式中起著重要作用,GDF11基因缺失的小鼠表現為胸腰脊椎數增加[11,12]。豬BMP-2、GDF11與Dlx5間的關系值得進一步探討。

致謝:在試驗過程中得到2009屆畢業生王留強和胡劉巖同學以及2008級生物技術專業賈坤航同學的幫助,在此表示感謝!

參考文獻:

[1] MASUDA Y,SASAKI A,SHIBUYA H, et al. Dlxin-1, a novel protein that binds Dlx5 and regulates its transcriptional function [J]. J Biol Chem,2001,276(7):5331-5338.

[2] SAMEE N, GEOFFROY V, MARTY C, et al.Dlx5, a positive regulator of osteoblastogenesis, is essential for osteoblast-osteoclast coupling[J]. Am J Pathol,2008,173(3):773-780.

[3] CHENG H C,ZHANG F W,JIANG C D,et al. Isolation and imprinting analysis of the porcine DLX5 gene and its association with carcass traits[J]. Anim Genet,2008,39(4):395-399.

[4] 熊遠著,鄧昌彥. 種豬測定原理與方法[M]. 北京:中國農業出版社,1999.

[5] ROBLEDO R F, RAJAN L, LI X, et al. The Dlx5 and Dlx6 homeobox genes are essential for craniofacial, axial, and appendicular skeletal development[J]. Gene Dev,2002,16(9): 1089-1101.

[6] ST?譈HMER T, ANDERSON S A, EKKER M, et al. Ectopic expression of the Dlx genes induces glutamic acid decarboxylase and Dlx expression [J]. Development,2002,129(1):245-252.

[7] OKITA C, MEGURO M, HOSHIYA H, et al. A new imprinted cluster on the human chromosome 7q21-q31, identified by human-mouse monochromosomal hybrids [J]. Genomics,2003, 81(6):556-559.

[8] KIMURA M I, KAZUKI Y, KASHIWAGI A, et al. Dlx5, the mouse homologue of the human-imprinted DLX5 gene, is biallelically expressed in the mouse brain[J]. J Hum Genet, 2004,49(5):273-277.

[9] 于靈芝. 豬myostatin 5調控區和GDF11內含子的克隆及多態性研究[D].泰安:山東農業大學,2007.

[10] 劉勝華,周政,楊輝,等. BMP-2對室管膜前下區神經肝細胞向多巴胺能神經元分化及對DLX5表達的影響[J]. 第三軍醫大學學報,2009,31(6):480-483.

[11] GAD J M, TAM P P. Axis development: the mouse becomes a dachshund [J]. Curr Biol,1999,9(20):783-786.

[12] MCPHERRON A C, LAWLER A M, LEE S J. Regulation of anterior/posterior patterning of the axial skeleton by growth /differentiation factor 11 [J]. Nat Genet,1999,22(3):260-264.

(責任編輯曾德芳)

收稿日期:2011-07-07

基金項目:山東省青島市基礎研究計劃項目(09-1-3-64-jch);臨沂大學博士啟動基金項目(BS08019)

作者簡介:邢晉祎(1968-),男,山東曹縣人,副教授,博士,主要從事動物分子遺傳研究,(電話)15864992807(電子信箱)jyxing02@gmail.com;

通訊作者,戈新(1957-),研究員,主要從事畜禽育種與技術推廣工作,(電話)15505321639(電子信箱)qdxg1993@126.com。

主站蜘蛛池模板: 精品福利一区二区免费视频| 一区二区午夜| 精品国产网| 国产老女人精品免费视频| 精品国产一区91在线| 欧美激情综合| 五月天香蕉视频国产亚| v天堂中文在线| 亚洲一区国色天香| 亚洲天堂久久新| 国产精品手机视频| 免费播放毛片| 好紧好深好大乳无码中文字幕| 日韩亚洲高清一区二区| 人妻少妇乱子伦精品无码专区毛片| 日本黄网在线观看| AV无码无在线观看免费| 人妻中文久热无码丝袜| 亚洲一区黄色| 红杏AV在线无码| 国产乱肥老妇精品视频| 国产福利在线免费观看| 丁香婷婷激情网| 五月婷婷伊人网| 四虎影视库国产精品一区| 国产精品香蕉在线| 激情乱人伦| 99视频有精品视频免费观看| 国产精品无码制服丝袜| av天堂最新版在线| 四虎免费视频网站| 亚洲精品欧美日韩在线| 亚洲午夜18| 国产乱人伦精品一区二区| 全部毛片免费看| 狠狠色丁香婷婷综合| 亚洲AⅤ无码日韩AV无码网站| 18禁高潮出水呻吟娇喘蜜芽| 最新日韩AV网址在线观看| 国产精品私拍在线爆乳| 亚洲精品中文字幕无乱码| 久久大香香蕉国产免费网站| 午夜精品福利影院| 园内精品自拍视频在线播放| 免费欧美一级| 亚洲人精品亚洲人成在线| 尤物午夜福利视频| 国产精品99一区不卡| 亚洲AⅤ综合在线欧美一区| 亚洲色图欧美一区| 久久鸭综合久久国产| 久久天天躁狠狠躁夜夜2020一| 香蕉视频国产精品人| 一级毛片免费的| 综合天天色| 99re在线免费视频| 26uuu国产精品视频| 国产区免费| 国产情精品嫩草影院88av| 欧美精品成人一区二区视频一| 色综合成人| 青草午夜精品视频在线观看| 制服丝袜一区| 欧美国产成人在线| 久久国产黑丝袜视频| 欧美福利在线观看| 日韩欧美国产精品| 在线观看欧美国产| 亚洲视频二| 99re这里只有国产中文精品国产精品 | 国产精品欧美激情| 亚洲精品第一在线观看视频| 好吊色妇女免费视频免费| 日韩国产欧美精品在线| 久久毛片基地| 亚洲人成网7777777国产| 亚洲无码四虎黄色网站| 91伊人国产| 亚洲人成网7777777国产| 国产伦片中文免费观看| www亚洲天堂| 国产jizz|