丁正中, 張 璐, 李 濤
(1.浙江師范大學化學與生命科學學院,浙江金華 321004;2.艾青中學,浙江金華 321015)
氧化還原因子-1(Ref-1)是哺乳動物細胞中重要的雙功能蛋白,在DNA損傷修復及抗氧化防御屏障中發揮著關鍵作用.Ref-1由318個氨基酸殘基構成,分子量約為37 kD,包含2個主要功能域.Ref-1的C端功能區進化高度保守,約157個氨基酸,具有核酸內切酶活性.離子輻射、活性氧(radical oxygen substrates,ROS)和烷化劑等可引起DNA損傷,造成脫嘌呤/脫嘧啶位點(apurinic/apyrimidinic sites,AP 位點).Ref-1是 AP 位點堿基切除修復(base excision repair,BER)途徑中主要的限速酶[1].如果Ref-1的這一功能缺陷,將造成AP位點累積,誘導細胞凋亡.放射治療、烷化劑及核苷酸類似物藥物(如:博萊霉素、替莫唑胺、吉西他濱等)均可顯著增強Ref-1蛋白表達,是腫瘤細胞產生獲得性耐藥,最終導致藥物失敏的重要機制[2-4].
Ref-1獨特的親水性N末端由約127個氨基酸組成,種屬差異較大,該段序列賦予Ref-1氧化還原酶活性.氧化損傷造成半胱氨酸巰基發生二硫鍵交聯、S-硝基化、谷胱甘肽化.通過還原半胱氨酸殘基,Ref-1能回復氧化損傷蛋白的功能活性.Ref-1能顯著促進許多轉錄因子的激活并提高它們的DNA結合能力,這代表了信號轉導中一種新型的氧化還原調控模式,對真核基因表達意義重大[5].氧化應激條件下,Ref-1表達增高或磷酸化活化,引起參與氧化還原調節的激活蛋白-1(AP-1)等轉錄因子活性變化,進而引起下游靶基因的活化,使一些對細胞具有保護作用的蛋白得到表達.因此,抑制Ref-1氧化還原酶活性,亦能促進腫瘤細胞凋亡、抑制腫瘤增殖.
Ref-1的高表達、活性增高及亞細胞定位改變與多種腫瘤的發生有關,并關系到腫瘤的惡性程度以及放化療的敏感性[6-8].如何抑制Ref-1的表達或活性,是目前腫瘤靶向治療的重要課題.本實驗通過原核表達純化人源Ref-1蛋白,建立了其活性檢測體系,為進一步研究Ref-1蛋白的功能、篩選Ref-1特異性抑制劑建立前期基礎.
菌株BL21(DE3)和質粒pGEX-4T-3為浙江師范大學動物生理實驗室保存.pRc/RSV-Ref-1質粒由日本名古屋大學Fukushi Kambe教授惠贈.
HindⅢ和XbaⅠ雙酶切將Ref-1編碼片段從pRC/RSV真核表達載體中釋放出來,插入pBluesciptⅡ SK(+)相應位點.pBluesciptⅡSK(+)/Ref-1質粒經SalⅠ和NotⅠ雙酶切釋放Ref-1編碼片段,插入pGEX-4T-3相應位點,完成Ref-1原核表達載體的構建.挑取單克隆進行酶切鑒定,并由北京奧科公司測序,確定基因正確插入且無突變.
重組質粒轉化感受態細菌BL21,挑克隆,在含氨芐西林(Amp)的LB培養基上搖菌過夜.將50 mL培養液擴大培養至1 000 mL LB培養液中220 r/min培養2~4 h,使 A600=0.6,降低溫度至30℃,加異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)至終濃度為0.4 mmol/L,搖菌4~6 h.收集菌液,每1 000 mL細菌用40 mL磷酸鹽緩沖液(PBS)重懸,冰上超聲直至液體不再混濁,4℃,14 000 r/min離心20 min,收集上清液.分別取誘導前后的培養液及超聲離心后的上清液和沉淀,加入2×十二烷基硫酸鈉(SDS)上樣緩沖液,煮沸后進行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),分析融合蛋白的表達情況.
加1 mL 50%谷胱甘肽瓊脂糖凝膠4B(Glutathione Sepharose 4B)溶液至超聲后的上清液中,室溫下垂直混懸器混懸結合過夜,4℃,500 r/min離心5 min后,收集珠子,預冷的1 mL磷酸鹽緩沖液洗5遍,離心后收集珠子,加1 mL 10 mmol/L還原型谷胱甘肽洗脫緩沖液,垂直混懸器輕輕混懸20 min,4 ℃,500 r/min離心5 min,吸出上清液置新管中.再重復洗滌3次,分別收集上清液.
將上清液收集入透析袋,4℃透析3次,每4 h更換透析液(PBS),聚乙二醇8000(PEG8000)濃縮至1 mL,加入終含量為10%的甘油,含0.5 mmol/L二硫蘇糖醇(DTT),-80℃保存.純化后的蛋白進行SDS-PAGE分析,考馬斯亮藍染色檢測條帶.谷胱甘肽巰基轉移酶(GST)按上述方法表達純化.
分別取10 μL純化的GST-Ref-1及GST進行SDS-PAGE分析,濕式電轉化轉膜.以兔源Ref-1抗體為一抗,辣根過氧化物酶(HRP)標記的抗兔抗體為二抗,用電化學發光(ECL)顯色試劑盒顯影曝光,鑒定表達產物.
應用凝膠阻滯法檢測GST-Ref-1氧化還原酶活性.按文獻方法提取HeLa細胞核蛋白,建立體外反應體系[9-10].北京奧科公司合成轉錄因子AP-1特異識別的雙鏈探針,正鏈序列為5'-CGCTTGATGACTCAGCCGGAA-3'.T4多聚核苷酸激酶對探針進行末端32P標記.在每組反應混合物中,核蛋白用量為40 μg,GST-Ref-1的用量是400 ng.核蛋白與GST-Ref-1體外混勻后,用終濃度為20 mmol/L的H2O24℃處理15 min后,用6%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,放射自顯影顯示AP-1蛋白與探針DNA結合條帶.

圖1 質粒酶切鑒定圖
Ref-1原核表達載體的構建流程如下:首先,用HindⅢ和XbaⅠ雙酶切將Ref-1編碼片段從測序正確的pRC/RSV真核表達載體中釋放出來,之后將Ref-1編碼片段插入pBluesciptⅡ SK(+)相應位點,經鑒定2-4泳道的克隆均為正確插入目的基因的重組質粒(見圖 1(a));接著,用SalⅠ和NotⅠ雙酶切釋放約1 kb的Ref-1編碼片段,插入pGEX-4T-3相應位點,從而完成GSTRef-1原核表達載體的構建,經鑒定8泳道的克隆為目的重組質粒(見圖1(b)).圖1中酶切出現1 kb左右的條帶,說明獲得了Ref-1編碼片段.測序結果表明,pGEX-4T-3/Ref-1質粒構建正確,讀碼框無移碼,無堿基錯配.
將pGEX-4T-3/Ref-1質粒轉入BL21(DE3)菌株,IPTG誘導表達外源基因.為了能夠檢測融合蛋白的表達效率及其可溶性,分別取誘導前后的菌體及裂菌后的上清液、沉淀,同時進行SDSPAGE,對凝膠進行考馬斯亮藍染色,分析蛋白條帶.如圖2所示,GST-Ref-1蛋白得到了有效的表達,2號孔為誘導后蛋白電泳條帶,在65 kD左右出現明顯的誘導條帶,符合理論預期.并且,GSTRef-1蛋白的表達性質基本為可溶性表達,3號孔為上清液樣品,可發現其中含有大量的GST-Ref-1融合蛋白.這些證據表明GST-Ref-1原核表達成功,并且基本為可溶性表達,極有利于下一步的純化操作及后續研究.

圖2 GST-Ref-1融合蛋白誘導表達圖
采用谷胱甘肽瓊脂糖凝膠4B珠子親和富集GST-Ref-1融合蛋白,再用10 mmol/L還原型谷胱甘肽洗脫GST-Ref-1融合蛋白,分別流洗4次,每個批次的洗脫液取10 μL做SDS-PAGE染色,如圖3所示,GST-Ref-1融合蛋白得到了有效的親和純化,并以第2次流洗的效率最高.Science lab軟件灰度掃描,得出純化蛋白的純度為92%.對純化的GST-Ref-1融合蛋白進行透析去除谷胱甘肽,PEG8000濃縮后加甘油凍存于-80℃冰箱中.

圖3 GST-Ref-1融合蛋白親和純化后產物的電泳圖
為了計算融合蛋白的誘導效率及親和純化的蛋白得率,實驗中對每次保留的蛋白都進行了BCA法蛋白定量.首先通過Science lab軟件灰度掃描分析,得出誘導后GST-Ref-1融合蛋白占菌體蛋白的比率為21.5%.再經BCA法蛋白定量,得出經親和純化濃縮后的GST-Ref-1融合蛋白占誘導后原始菌體的比率為6.8%,占超聲裂解后上清液中蛋白的比率為11.7%.
蛋白質印跡檢測驗證GST融合蛋白是否為表達序列正確的Ref-1蛋白.如圖4所示,只有GST-Ref-1條帶位置能檢測到強化學發光信號,而對照GST條帶無發光信號.表明GST-Ref-1原核表達質粒能夠正確表達Ref-1融合蛋白,具有良好的抗原性.

圖4 GST-Ref-1融合蛋白純化終產物PAGE考馬斯亮藍染色及蛋白質印跡檢測
許多轉錄因子受到Ref-1氧化還原調控,如AP-1,NFκB,CREB,ATF,NF-Y 和 p53 等,Ref-1 能直接增強轉錄因子的DNA結合能力.為了驗證GST-Ref-1融合蛋白是否具備活性,通過凝膠阻滯實驗對其氧化還原酶活性進行了檢測.結果如圖5所示:GST-Ref-1直接增強了AP-1與靶DNA的結合量,而GST蛋白本身對AP-1的DNA結合能力無影響,表明GST-Ref-1融合蛋白能增強AP-1的DNA結合能力;同時,H2O2抑制了AP-1與探針的結合,但同時加入GST-Ref-1蛋白能部分恢復AP-1的DNA結合活性.表明GST-Ref-1融合蛋白具有氧化酶活性.

圖5 凝膠阻滯法檢測GST-Ref-1融合蛋白氧化還原酶活性
本實驗采用pGEX-4T-3載體系統,通過IPTG誘導表達,獲得了GST-Ref-1融合蛋白的可溶性表達,并進行了親和純化,蛋白在菌體中未出現明顯的降解.該系統有利于GST-Ref-1融合蛋白的可溶性表達與親和純化,純化條件溫和、步驟簡單,同時能極大限度地保持融合蛋白的空間結構和免疫原性,有利于下一步實驗操作.本實驗所獲得的GST-Ref-1融合蛋白,可用于抗體制備,利用GST pull-down實驗揭示 Ref-1互作蛋白,篩選Ref-1蛋白抑制劑.
Ref-1是重要的抗氧化基因,亦是重要的腫瘤耐藥基因.Ref-1具有AP內切酶活性,可修復放射、烷化劑、氧化應激造成的DNA損傷;同時其所具有的氧化還原酶活性能調控大量轉錄因子的活性,上調 Bcl-2等抗凋亡基因的表達.Robertson等[11]首先發現,在宮頸癌、睪丸癌中Ref-1過表達可增強其對博來霉素和射線的抵抗.Fishel等[12]研究發現,Ref-1在卵巢腫瘤中高表達,如利用siRNA技術將其沉默掉,腫瘤體積明顯縮小,細胞增殖減慢,阻滯于細胞周期S期.王東研究組[13]構建了Ref-1的RNAi質粒,轉染骨肉瘤細胞系9901,發現抑制Ref-1表達能夠下調血管來源的生長因子(VEGF)表達,抑制腫瘤微血管的形成,同時提高了骨肉瘤細胞放療的敏感性.Ref-1還能誘導腫瘤細胞的多藥耐藥性.近期研究發現,Ref-1調控轉錄因子 YB-1,從而誘導多藥耐藥基因MDR1的表達[14].MDR1基因編碼跨膜蛋白 P-糖蛋白,P-糖蛋白為藥物泵,通過三磷酸腺苷(ATP)提供能量,可將藥物泵出細胞外,使其細胞毒作用減弱直至喪失,出現耐藥現象.因此,Ref-1是腫瘤治療的重要靶向分子.
研究者開發了多種藥物試圖封閉Ref-1的表達或活性[15-17].第1類為AP內切酶活性抑制劑,主要有7-硝基吲哚-2-甲酸、CRT0044876、硫蒽酮和甲氧胺;第2類為氧化還原酶活性抑制劑,如E3330和白藜蘆醇,此類抑制劑往往同時抑制活性氧通路及NFκB的活化,效應相對較廣;第3類則是能夠抑制Ref-1表達的化學物質,如大豆異黃酮.
本實驗表達的GST-Ref-1融合蛋白,經體外凝膠阻滯實驗發現具有氧化酶活性,能直接增強AP-1的DNA結合能力,并能抑制H2O2對AP-1蛋白的損傷.如何構建合適的藥物篩選體系,檢驗藥物對Ref-1 AP內切酶及氧化還原酶活性的影響,將是一個有意義的研究方向.
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