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Pax-8基因敲除小鼠心臟中NR4A1基因表達上調

2011-06-13 10:53:06黃曉燕高瞻周希梁萬前陳錫文陳通克楊德業溫州醫學院附屬第一醫院心內科溫州醫學院心血管生物和基因研究所浙江溫州35000溫州醫學院實驗動物中心浙江溫州35035
溫州醫科大學學報 2011年3期
關鍵詞:小鼠

黃曉燕,高瞻,周希,梁萬前,陳錫文,陳通克,楊德業(.溫州醫學院附屬第一醫院 心內科,溫州醫學院 心血管生物和基因研究所,浙江 溫州35000;.溫州醫學院 實驗動物中心,浙江 溫州 35035)

先天性心臟病-室間隔缺損(ventricular septum defect,VSD)是常見的心血管疾病,但我們對其致病因素及發病機制卻仍知之甚少。骨形態形成蛋白受體IA(bone morphogenetic protein receptor type 1A,又名ALK3)在心臟發育及室間隔形成中發揮重要作用[1-2]。已有心臟特異性ALK3基因敲除的小鼠模型培育成功[3]。ALK3基因敲除純合子小鼠胚胎發育皆終止于中期,并伴室間隔缺損、心內膜墊和肌小梁發育不全[4]、心肌細胞凋亡增加[5]。在ALK3基因缺失造成心臟發育異常的具體通路的實驗研究中,楊德業教授的團隊發現轉錄因子paired box gene 8(Pax-8)在ALK3基因敲除的純合子小鼠胚胎心臟中下調了7.1倍[6-8]。Pax-8參與心臟的正常發育,并與心肌細胞的凋亡有關[9],Pax-8表達下調時細胞凋亡顯著增加,細胞增殖活性下降[10]。

為了探討Pax-8基因下調后引起細胞凋亡增多的機制,基因芯片和熒光實時定量PCR技術被應用于篩選Pax-8基因敲除小鼠差異表達的下游基因。

1 材料和方法

1.1 實驗動物及分組 Pax-8基因敲除小鼠模型由德國Peter Gruss和Ahmed Mansouri教授惠贈。Pax-8基因敲除小鼠純合子(Pax-8 KO-/-)為實驗組,Pax-8基因敲除小鼠雜合子(Pax-8 KO+/-)和野生型(Pax-8 KO+/+)為對照組。純合子和雜合子小鼠由雌性Pax-8 KO+/-小鼠與雄性Pax-8 KO+/-小鼠交配所得。

1.2方法

1.2.1 Pax-8基因敲除小鼠的基因型鑒定:實驗小鼠基因型由PCR法鑒定。引物為5’-GGATGTGGAA TGTGTGCGAGG-3’、5’-GCTAAGAGAAGGTGGATGAGAG-3’,和5’-GATGCTGCCAGTCTCGTAG-3’。PCR條件:94 ℃預變性5 min,94 ℃變性15 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,經過10個循環后,再94 ℃變性15 s,57 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,經過25個循環后,72 ℃延伸5 min。每組擴增產物取5μL,用含Gold View的1.5%瓊脂糖凝膠電泳,用凝膠成像分析系統(quantity one)攝像分析。

1.2.2 芯片雜交:取Pax-8 KO-/-組與Pax-8 KO+/-組出生第1天(P0)小鼠各3只,心臟組織總RNA由TRIzol法常規提取,經紫外吸收測定和變性瓊脂糖凝膠電泳鑒定RNA質量。按上海生物芯片有限公司試劑盒說明書操作,反轉錄標記cDNA探針并純化。Cy3-dUTP標記Pax-8 KO-/-cDNA,Cy5-dUTP標記Pax-8 KO+/-cDNA,將含31802個小鼠基因的Mouse OneArrayTMWhole Genome DNA microarray芯片(購自臺灣華聯芯片)與探針雜交(按臺灣華聯芯片說明書操作)。結果采用Axon公司的Gene Pix4100掃描,Gene PixPro4.0軟件分析Cy3和Cy5兩種熒光信號的強度和比值。用管家基因進行Cy3和Cy5均衡。判斷基因差異表達的標準為:①Cy3和Cy5信號比值>2.0為表達上調,<0.5為表達下調,0.5~2.0為不存在顯著表達差異。②Cy3和Cy5信號比值其中之一必須>200或其中之一<800及Cy5/Cy3在0.1~10之間,作為判斷基因差異表達的標準。

1.2.3 半定量RT-PCR:Pax-8 KO-/-組、Pax-8 KO+/-組和Pax-8 KO+/+組各取P0小鼠3只,心臟組織總RNA由TRIzol法提取。經紫外吸收測定和變性瓊脂糖凝膠電泳鑒定RNA質量后,取2μg總RNA進行逆轉錄反應(按RevertAidTM First Strand cDNA Synthesis Kit RT試劑盒說明書操作)。每組各取0.3μg cDNA分別進行PCR擴增NR4A1和GAPDH片段。NR4A1上游引物為5’-ATGCGATTCTGCAGCTCTTCC-3’,下游引物為5’-GGGTGGTATTGTCGTAGTAGAAGG-3’,GAPDH上游引物為5’-AGGTCGGTGTGAACGGATTTG-3’,下游引物為5’-TGTAGACCATGTAGTTGAGGTCA-3’(均由上海英駿生物技術有限公司合成)。管家基因GAPDH作為內參照標化NR4A1 mRNA表達。NR4A1反應條件如下:94 ℃預變性5 min后,94 ℃變性30 s,56.4℃退火30 s,72 ℃延伸1 min。GAPDH反應條件如下: 94 ℃預變性5 min后,94 ℃變性30 s,54.6℃退火30 s,72 ℃延伸1 min。分別當24、28、32、36個循環時中止反應,取5μL PCR產物用含Gold View的1.5%瓊脂糖凝膠電泳,用凝膠成像分析系統(quantity one)攝像分析。

1.2.4 熒光實時定量RT-PCR:Pax-8 KO-/-組、Pax-8 KO+/-組和Pax-8 KO+/+組各取P0小鼠3只,如上述方法獲得cDNA后,用NR4A1實時定量RT-PCR引物(由上海英駿生物技術有限公司合成)進行熒光定量PCR檢測。NR4A1引物序列為上游:5’-TGTTG ATGTTCCCGCCTTTG-3’,下游:5’-ATGCGATTCTGCAGC TCTTCC-3’(由上海英駿生物技術有限公司合成),采用Beta-actin作為內部參照。用ABI 7500 FAST型熒光定量PCR儀檢測,實驗重復3次。通過比較ΔCt的方法進行NR4A1表達的定量分析,NR4A1的相對表達量用2-ΔCt表示。Ct為每個反應管內的熒光信號到達設定的閾值時所經歷的循環數,ΔCt為NR4A1 Ct值與內參Beta-actin Ct值之差。

1.3 統計學處理方法 采用SPSS 11.5.0統計軟件進行處理,實驗數據經過方差齊性檢驗,以±s表示,兩組間均數比較采用t檢驗,檢驗水準α=0.01。

2 結果

2.1 PCR法鑒定Pax-8基因敲除小鼠基因型 Pax-8 KO-/-表現為約370 bp的單一條帶,Pax-8 KO+/+表現為約390 bp的單一條帶,Pax-8 KO+/-表現為390 bp和370 bp雙條帶(見圖1)。

圖1 PCR法鑒定Pax-8基因敲除小鼠的基因型

2.2 Pax-8基因敲除小鼠中差異表達的基因 通過基因芯片對31802個已知基因進行分析,發現與Pax-8 KO+/-組相比,在Pax-8 KO-/-組中25個基因表達下調,另外17個基因表達上調,其中涉及細胞周期、直接參與代謝、參與細胞信號轉導及核轉錄因子的基因,部分差異表達的基因見表1。

表1 利用基因芯片獲得Pax-8 KO-/-的部分差異表達基因

2.3 半定量RT-PCR法驗證基因芯片篩查結果 針對基因芯片篩選出的上調和下調的基因的引物做PCR擴增,比較不同的擴增周期不同基因的PCR產物量。結果發現NR4A1的PCR產物在第28個PCR循環周期開始,Pax-8 KO-/-組明顯多于Pax-8 KO+/-組和Pax-8 KO+/+組。說明NR4A1基因在Pax-8 KO-/-小鼠中表達上調(見圖2)。

圖2 在P0的Pax-8 KO-/-小鼠,Pax-8 KO+/-小鼠和Pax-8 KO+/+小鼠心臟中NR4A1和GAPDH基因在不同的PCR擴增周期的產量比較

圖3 NR4A1基因定量RT-PCR結果

2.4 熒光定量RT-PCR結果 NR4A1在Pax-8 KO-/-組比Pax-8 KO+/-組和Pax-8 KO+/+組分別上調(1.53±0.08)倍和(4.80±0.35)倍(均P<0.01),而作為內部對照的Beta-actin基因水平在兩組間差異無統計學意義(P>0.05)(見圖3)。

3 討論

NR4A1,又稱為Nur77、TR3、NGFI-B等,是一種轉錄因子,屬于核受體超家族一員,從氨基端到羧基端,一共有4個結構域組成(見圖4)。由于目前沒有發現NR4A1的配體,故他們又被稱為孤兒核受體。

圖4 NR4A1簡圖

無論在以細胞增殖為主的腫瘤細胞中[11-12],還是在以細胞凋亡為主的生物過程中[13-14],都可以找到NR4A1高表達的證據,表明其在增殖和凋亡上存在雙重作用。目前研究表明,NR4A1在增殖和凋亡中的作用主要取決于細胞受到的分子信號:當細胞受到促進生長分裂的分子信號如Erk2等刺激時,NR4A1可作為轉錄因子,調節各種促進細胞增殖的基因表達[15];當細胞受到促進細胞凋亡的分子信號如JNK[16]等刺激時,NR4A1通過磷酸化,與RXR(retinoid X receptor)形成二聚體,從細胞核內轉移至線粒體,與Bcl-2蛋白結合。NR4A1能與Bcl-2的第三和第四個同源結構域-BH3、BH4之間的環結構結合,從而使BH3暴露,使Bcl-2從保護凋亡轉為促進凋亡,觸發細胞色素C釋放,激活細胞凋亡[17]。

值得注意的是,在Pax-8基因敲除小鼠心臟中,同時存在較正常高表達的NR4A1與Bcl-2-like 14(Bcl2l14)基因[18]。而后者的激活形態只含有BH3一個結構域,能夠顯著促進凋亡。

在整個室間隔形成的過程中,包括在房室心內膜墊、間隔、流出道、肌小梁和乳頭肌的發生中,細胞凋亡都扮演著關鍵角色[19-21]。在Pax-8基因敲除小鼠心臟中,可能存在由NR4A1介導的,通過Bcl2l14執行的細胞凋亡增加。使得在心臟室間隔發育過程中,細胞凋亡過度,室間隔形成緩慢甚至室間隔缺損——這是我們從本研究中得出的推測,然而需要確證這種假設還需要進行NR4A1細胞內定位,NR4A1干擾后觀察Bcl2l14表達變化等實驗。

致謝:此課題的完成得到德國Peter Gruss及Ahmed Mansouri教授的支持和幫助,尤其是惠贈實驗動物,特此表示感謝!

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