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RANTES-403G/A、MCP-1-2518A/G基因多態性與呼吸道合胞病毒毛細支氣管炎易感性的相關性

2010-06-13 10:53:02張亞麗董琳陳小芳周曉聰李錦燕李孟榮
溫州醫科大學學報 2010年2期

張亞麗,董琳,陳小芳,周曉聰,李錦燕,李孟榮

(溫州醫學院附屬育英兒童醫院 呼吸科,浙江 溫州 325027)

呼吸道合胞病毒(RSV)是嬰幼兒下呼吸道感染最常見的病原,研究顯示,RSV感染的氣道上皮細胞能產生調節激活正常T細胞表達、分泌的細胞因子(RANTES)和單核細胞趨化蛋白1(MCP-1)等趨化因子,從而引發過度的氣道炎癥反應[1-2]。RSV感染患兒鼻腔盥洗液及鼻咽分泌物RANTES水平明顯增高,且與疾病嚴重程度相關[3-4],有低氧表現的RSV毛細支氣管炎患兒鼻炎分泌物中MCP-1水平明顯升高[5],提示趨化因子可能在RSV感染發病中發揮重要作用。幾乎所有兒童2歲時均感染RSV,但僅1%~2%需住院治療,造成病情差異的原因尚不清楚,許多嚴重RSV感染患兒并不存在早產、先天性心臟病、支氣管肺發育不良等高危因素,因此,宿主的遺傳因素與RSV感染發病的關系正成為研究的焦點。既往研究已證實調控RANTES和MCP-1的基因位點存在多態性[6-7]。本研究通過病例-對照分析,探討RANTES-403G/A、MCP-1-2518A/G的單核苷酸多態性(SNPs)與RSV毛細支氣管炎易感性的相關性,篩選與疾病易感性相關的SNP位點。

1 對象和方法

1.1 對象 病例組為2006年11月-2007年3月入住溫州醫學院附屬育英兒童醫院呼吸科,診斷為RSV毛細支氣管炎患兒150例,其中男111例,女39例,年齡1~24個月,有早產、雙胎、先天性心臟病、支氣管肺發育不良、免疫缺陷等基礎疾病者除外。對照組選擇同期健康體檢的兒童120例,男92例,女28例,年齡2~24個月。兩組均無特應性疾病史及家族特應性疾病史,均為漢族,無血緣關系。

1.2 方法

1.2.1 基因組DNA提?。河肅helex-100快速提取法提取基因組DNA。

1.2.2 聚合酶鏈反應-限制性酶切片段長度多態性技術(PCR-RFLP)檢測:各位點信息、引物、產物長度、PCR反應條件及限制性內切酶見表1。PCR反應體系為20μL:Primer F(10μmol/L)1μL,Primer R(10μmol/L)1μL,dNTPMix(2 mmol/L)2μL,MgCl2(25 mmol/L)1.6μL,10×Buffer 2μL,DNA模板2μL,Taq DNA聚合酶(1U/μL)1.5μL,去離子水8.9μL。取PCR產物5μL,限制性內切酶3 U,10×Buffer 1μL,余用去離子水補齊,總體積為10μL,37 ℃水浴箱中酶切過夜。30 g/L瓊脂糖凝膠鑒定基因型(見圖1、圖2)。

表1 各位點的基本信息、引物、反應條件、產物產度及限制性內切酶

圖1 RANTES-403G/A位點PCR-RFLP電泳圖譜

圖2 MCP-1-2518G/A位點PCR-RFLP電泳圖譜

1.3 統計學處理方法 基因型與等位基因頻率Hardy-Weinburg平衡吻合程度用x2檢驗;基因型及等位基因頻率的比較用x2檢驗;用Logistic回歸模型判斷等位基因型對發病危險度的影響。

2 結果

2.1 RANTES-403G/A基因型及等位基因分布 病例組和對照組均可見GG、GA、AA 3種基因型,以GA雜合子基因型為主;經Hardy-Weinberg平衡檢驗,對照組的遺傳平衡,表明該群體來自同一孟德爾群體(x2=0.052,P>0.05);而病例組的遺傳不平衡(x2=10.894,P<0.05)。兩組基因型頻率差異有顯著性(x2=10.024,P<0.05);病例組A等位基因的頻率明顯高于對照組(x2=3.912,P<0.05)(見表2);與G等位基因攜帶者相比,A等位基因攜帶者患RSV毛細支氣管炎的風險明顯增加 (OR=1.415,95%CI:1.003~1.996,P<0.05)。2.2 MCP-1-2518A/G基因型及等位基因分布 病例組和對照組均可見GG、GA、AA 3種基因型,以GA雜合子基因型為主;經Hardy-Weinberg平衡檢驗,對照組的遺傳平衡(x2=0.468,P>0.05);而病例組的遺傳不平衡(x2=8.153,P<0.05)。兩組基因型和等位基因型頻率差異均無顯著性(見表 3)。

表2 RANTES-403G/A基因型及等位基因分布

3 討論

RANTES基因位于人染色體17q11.2-q12,該區域與哮喘等特應性疾病基因連鎖,目前,RANTES基因啟動子區研究最多的3個多態性位點分別為-403G/A、-109T/C、-28C/G。其中-403位點G/A的變異,可能對其基因轉錄造成影響,從而影響疾病的發生發展。Fryer等[8]發現白人哮喘和特應性個體-403A等位基因頻率高于正常個體,推斷-403A與哮喘易感性和特應性有關。文慣宇等[9]也報道-403A可能是特應性體質的易感因素,但未發現RANTES-403G/A位點基因多態性與RSV毛細支氣管炎的相關性。Amanatidou等[10]的研究則發現,RANTES基因-28C/G、-403G/A和Aln1.1T/C位點與RSV毛細支氣管炎的易感性均無關,但基因型同時為-28C/C、-403G/A和Aln1.1T/T的個體易患該病。本研究結果顯示溫州地區RSV毛細支氣管炎患兒和正常兒童均存在GG、GA和AA 3種基因型,兩組基因型頻率差異有顯著性,RSV毛細支氣管炎組RANTES-403A等位基因頻率高于對照組,與攜帶G等位基因個體相比,攜帶A等位基因的個體患毛細支氣管炎風險增加了1.415倍,提示RANTES-403A等位基因與RSV毛細支氣管炎易感性相關,可能是影響RSV毛細支氣管炎發病的一個重要候選基因。

MCP-1編碼基因位于人染色體17q11.2,由3個外顯子和2個內含子組成,該段基因亦與哮喘等特應性疾病基因連鎖。目前,MCP-1啟動子區研究最多的兩個多態性位點為-2518G/A和-2076A/T。Rovin等[7]報道MCP-1-2518位點基因多態性影響MCP-1的轉錄及表達水平,MCP-1-2518G等位基因能使MCP-1轉錄增多,從而使其蛋白表達水平上調。Szalai等[11]發現MCP-1-2518G等位基因可增加嬰幼兒哮喘的易感性,并與病情相關。目前國內外尚無MCP-1-2518G/A基因多態性與RSV感染發病的報道,本研究未發現MCP-1-2518G/A基因多態性與RSV毛細支氣管炎易感性之間存在關聯。

綜上所述,本研究結果提示RANTES-403A可能是影響RSV毛細支氣管炎發病的一個重要候選基因,盡管未發現MCP-1-2518G/A基因多態性與RSV毛細支氣管炎易感性之間存在關聯,但RANTES和MCP-1位于同一染色體的同一區段,兩位點所形成的單體型與RSV毛細支氣管炎易感性是否相關,有待進一步探討。另外,RANTES基因多態性只能部分解釋RSV毛細支氣管炎的易感性,本課題組其他研究發現TNF-α-308A等位基因、IL-8-251A與781C等位基因形成的AC單體型均與RSV毛細支氣管炎的易感性相關,這些易感基因相互之間是否存在聯合或協同作用,目前尚不明了,有待今后進一步研究。

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