腸道病毒71型(EV71)感染引起手足口病并可導致神經源性疾病,而免疫受損或不成熟與EV71感染的發病率和致死率升高密切相關。Ⅰ型干擾素(IFN)是抗病毒感染的第1道防線。但小鼠模型中EV71不能促進Ⅰ型干擾素產生,且加入針對IFN-α/β的中和抗體可使病毒感染癥狀惡化。該過程中的分子機制尚不清楚。研究發現,EV71通過維甲酸誘導基因I(RIG-I)抑制抗病毒免疫,在病毒感染細胞中EV71可抑制IFN-β、ISG54、ISG56及腫瘤壞死因子(TNF)的表達。在病毒編碼的結構及非結構蛋白中,3C蛋白可抑制病毒及RIG-I誘生的IFN-β,但不抑制MDA5的活性。EV71在哺乳動物細胞內表達時,3C蛋白通過CARD區結合RIG-I,阻止其招募IPS-1并抑制隨后的干擾素調節因子3(IRF3)入核。3C蛋白RNA結合區2個位點(R84Q、V154S)突變對此無影響,點突變H40D則抑制效果消失,但與3C蛋白的酶活性無關。研究結果顯示,EV71的3C蛋白通過RIG-I抑制Ⅰ型干擾素反應,這可能是EV71感染的致病機制之一。