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煮沸裂解法快速提取大鯢DNA

2010-01-11 10:54:28張志敏劉南君牛靜李學英
遵義醫科大學學報 2010年5期
關鍵詞:實驗方法

張志敏,劉南君,牛靜,李學英

(遵義醫學院細胞生物學與遺傳學教研室,貴州遵義 563003)

煮沸裂解法快速提取大鯢DNA

張志敏,劉南君,牛靜,李學英

(遵義醫學院細胞生物學與遺傳學教研室,貴州遵義 563003)

目的 建立大鯢基因組DNA快速簡便高效的提取方法。方法 借鑒煮沸裂解法制備質粒DNA方法,改進后用于提取大鯢基因組DNA。結果 本方法提取DNA純度高(A260/A28介于1.7~2.1之間),耗時短(2h),毒性小,分子大小約為23kb,適用于PCR擴增及后續分析。結論 本方法提取基因組DNA純度高、耗時短、提取所用試劑毒性小、成本低,值得在大鯢基因組DNA提取中使用,也可為其他動物的相關研究提供參考。

大鯢;DNA提取;煮沸裂解法

50年代初,DNA被證明是所有生物最主要的遺傳物質。隨著生物化學、分子生物學、遺傳學的發展,基因工程和各種生物技術創立,DNA的有關技術也得到飛速發展。DNA提取方法成了這些研究和應用中最重要的技術之一。目前已經建立了用于各種不同目的的DNA提取方法,這些方法也被用于生物學,尤其是生物工程的各個方面。但是,對于不同的動植物樣品,由于其組織成分的差異,采取的DNA提取方法不完全一致。筆者在實驗和研究中,建立了大鯢基因組DNA的提取方法,其操作簡單,操作過程毒性小,所提取的DNA純度高,省時,不需要很昂貴的儀器設備,所提取的DNA適用于分子遺傳學中PCR和其他分析。

1 材料與方法

1.1 試驗材料 以十只正常大鯢及八只彎曲病大鯢肝臟為實驗對象。大鯢從貴定娃娃魚養殖公司購買。

1.2 主要試劑與儀器 電子天平、Genex Beta微量加樣器、Thermo臺式高速離心機、紫外分光光度計、電泳儀、電泳槽、微波爐、紫外透射反射分析儀、Biorad PCR儀、海爾冰箱等。試劑:20ug/mL蛋白酶K、1mg/mL胰RNA酶、0.5M EDTA、0.5M Tris-HCL、TE溶液、1%和1.5%瓊脂糖凝膠、0.5×TBE、70%乙醇、Gold View溶液、1%SDS、10M醋酸銨溶液、生理鹽水等。

1.3 方法 取1g大鯢肝臟組織用生理鹽水洗凈,盡量控干水分,剪碎,在液氮中研磨成粉狀;加入十倍體積裂解液(10Mm Tris-HCL,100MmEDTA,0.5%SDS)混勻分裝于EP管中,做10管,每管1mL;加胰RNA酶20ul,37℃1h后加入蛋白酶K 5ul/管,50℃3h,不時混勻;將離心管于94℃沸水浴中精確放置10min;13200rpm離心5min,取上清500ul;加0.2倍體積醋酸銨及2倍體積乙醇,室溫下放置5min沉淀DNA,13200rpm離心10min,傾去上清,70%乙醇洗2次,晾干后加1mL溶解DNA。用紫外分光光度計檢測所提取DNA樣品260nm和280nm OD值,計算純度。實驗重復3次。

1.4 電泳鑒定DNA純度和完整性 1%瓊脂糖凝膠電泳,Goldview染色,90~100V,30min。檢測基因組DNA完整性。

2 結果

2.1 紫外分光光度計檢測結果 紫外分光光度計檢測純度:各樣品A260/A280值見表1(均值),結果在1.7~2.1之間,純度符合分子遺傳學實驗要求。

表1 大鯢基因組DNA紫外分光光度計檢測值(X)

2.2 電泳鑒定結果 電泳檢測結果如圖1,基因組DNA沒有降解。DNA分子量約23kb,無雜帶和拖尾現象,說明所提取DNA純度高,無降解。實驗重復3次,結果相同(如圖1),表明重復性好。

圖1 大鯢基因組DNA的直接電泳檢測圖

3 討論

DNA是最重要的遺傳物質,利用基因工程手段對動植物進行定向改造,已成為當今動植物育種學發展的一個新領域。因此,DNA的提取方法和技術是分子遺傳學中最基本的技術,也是生物工程中最常用的技術。為了得到足夠純的DNA進行基因和遺傳操作,目前國內外已有許多DNA提取方法,這些方法因研究對象和目的不同而異。苯酚/氯仿法是DNA的提取中應用較為廣泛的方法,其對新鮮樣品的提取效果比較好。本實驗用煮沸裂解法替代傳統的苯酚/氯仿抽替,對正常和彎曲病大鯢基因組DNA進行提取。所提取的DNA呈白色絮狀沉淀,電泳顯示DNA完整,無RNA污染,A260/A280均在1.7~2.1之間,實驗操作簡單、不需昂貴的儀器設備、用時短(2~3h)、所用試劑毒性小;產品純度高又適合PCR及其他分子遺傳學分析,效果理想。本實驗成功建立了大鯢基因組DNA的提取方法,為大鯢的分子遺傳學研究打下了基礎。

[1]J.薩姆布魯克,E.F.弗里奇,T.曼尼阿蒂斯.分子克隆實驗指南[M].黃培堂等譯.北京:科學出版社,2002.36-39.

[2]李長富,葛正龍,黃燮南,等.天麻DNA的快速提取[J].遵義醫學院學報,2004,27(3):226-227.

[3]李學英,王大忠,王乾興.一種改進的鲇魚基因組DNA的高效提取方法[J].遵義醫學院學報,2001,24(1):19-21.

Boiling lysis quickly separation of Giant Salamander DNA

ZHANG Zhi-min,LIU Nan-jun,NIU Jing,LI Xue-ying
(Department of Cell Biology,Zunyi Medical College,Guizhou Zunyi 563003,China)

ObjectiveTo found a quick,simple,efficient separation method of Giant Salamander genome DNA.MethodsBased on the boiling lysis method of plasmid DNA separation,improved the protocol for Giant Salamander genome DNA extraction.ResultsThe A260/A280 of DNA extracted from Giant Salamander was pure highly(between 1.7 and 2.1).It took very short time(2h)and have low toxicity of reagent.The fragment of extracted DNA was about 23kb and it was suitable for PCR and subsequent analysis.ConclusionsThis method was at high pure,short time,harmless,low cost,and fit for extracting of Giant Salamander genome DNA,and also be used to similar studying in other animals.

Giant Salamander;DNA extraction;boiling lysis

R394.33

A

1000-2715(2010)05-0424-02

2010-01-20

張志敏(1979—),女,貴州省遵義人,副教授,研究方向:分子遺傳學。

李學英(1966—),女,碩士,教授,碩士生導師。

李 勇]

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