NUF2 對(duì)泛癌的預(yù)后和免疫治療效果的預(yù)測價(jià)值

摘要：目的 探討NUF2表達(dá)水平與腫瘤預(yù)后的關(guān)系及在腫瘤微環(huán)境中的作用。方法 綜合利用人類蛋白質(zhì)圖譜（HPA）、癌癥基因組圖譜（TCGA）、基因型-組織表達(dá)計(jì)劃（GTEx）、癌細(xì)胞系百科全書（CCLE）、TIMER的數(shù)據(jù)集，采用生物信息學(xué)方法挖掘NUF2 的潛在致癌作用，包括剖析NUF2 在各種類型腫瘤組織中的表達(dá)水平、預(yù)后價(jià)值及免疫價(jià)值；采用RT-qPCR、Westernblotting、免疫組化（IHC）等實(shí)驗(yàn)檢測NUF2 在肝癌細(xì)胞系和肝癌患者癌組織及血液中的表達(dá)情況。利用基因本體論（GO）、基因組百科全書（KEGG）和基因集富集分析（GSEA）探索NUF2 及相關(guān)基因的分子機(jī)制并在肝癌中構(gòu)建了NUF2 的競爭性內(nèi)源RNA（ceRNA）網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果 與正常組織相比，NUF2 表達(dá)在27 種腫瘤中上調(diào)并與多種類型腫瘤的臨床分期相關(guān)（Plt;0.05）。在部分腫瘤中，NUF2 的表達(dá)上調(diào)與腫瘤患者的不良預(yù)后（總體生存期、疾病特異性生存期、無病生存期和無進(jìn)展生存期）相關(guān)（Plt;0.05）。NUF2表達(dá)水平與多種腫瘤的腫瘤突變負(fù)荷、微衛(wèi)星不穩(wěn)定、浸潤免疫細(xì)胞（B細(xì)胞、髓樣樹突狀細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞）、免疫細(xì)胞maker 基因（CCR7、CD163、CD19、CD4、CD79A、CD8A、CD8B、IRF5、ITGAX和MS4A4A）以及免疫檢查點(diǎn)基因（CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1和PDCD1LG2）呈正相關(guān)（Plt;0.05）。RT-qPCR等實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示NUF2在肝癌細(xì)胞系、肝癌患者癌組織和血液中表達(dá)上調(diào)（Plt;0.05），其中肝癌患者經(jīng)手術(shù)治療之后，使得血液中NUF2 表達(dá)下調(diào)（Plt;0.05）。GO和 KEGG 富集分析表明，NUF2 相關(guān)基因與染色體分離、微管運(yùn)動(dòng)以及細(xì)胞周期相關(guān)（Plt;0.05）。GSEA分析提示，在肝癌中NUF2高表達(dá)與甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝以及調(diào)控神經(jīng)活性配體受體相互作用有關(guān)（Plt;0.05）。結(jié)論 NUF2在27種腫瘤中表達(dá)上調(diào)并與部分腫瘤的臨床分期、不良預(yù)后有關(guān)。此外NUF2的表達(dá)與多種腫瘤的免疫細(xì)胞浸潤密切相關(guān)，可能作為這些癌癥免疫治療效果的潛在預(yù)測因子?！?br>