過表達帶電多泡體蛋白2B基因抑制腎透明細胞癌細胞的增殖

摘要：目的 腎透明細胞癌中帶電多泡體蛋白2B（CHMP2B）的表達水平與臨床病理特征及預后的關系，探究CHMP2B 在腎透明細胞癌發生發展中的潛在作用機制。方法 從TCGA數據庫下載并整理腎透明細胞癌的RNAseq數據并提取FPKM格式的數據，比較腫瘤樣本與癌旁樣本 CHMP2B的表達差異，根據其表達中位值分為高、低表達組，分析CHMP2B表達水平與臨床病理特征的相關性，采用Kaplan-Meier模型進行生存分析，COX風險回歸模型用于臨床預后因素分析；使用ESTIMATE 算法分析CHMP2B與免疫和基質細胞浸潤及腫瘤純度的關系；使用Limma 包對CHMP2B篩選共表達基因，并進一步行GSVA富集分析。使用ESTIMATE算法和Timer數據庫分析CHMP2B表達與免疫浸潤的相關性；使用cBioPortal數據庫分析CHMP2B的基因突變對腎透明細胞癌免疫治療的影響；從HPA數據庫獲取CHMP2B蛋白質在腎透明細胞癌組織和正常組織的免疫組化表達情況；通過收集健康與腎癌患者外周血標本評價CHMP2B作為臨床標志物的可能。通過細胞實驗驗證CHMP2B對腎癌細胞增殖與遷移的影響。結果 與癌旁組織相比較，CHMP2B在腎透明細胞癌組織中低表達，使其過表達會抑制腫瘤細胞增殖（Plt;0.01），其表達水平與年齡、性別、是否淋巴結轉移以及分期等具有相關性（Plt;0.05）。生存分析結果顯示CHMP2B低表達腎透明細胞癌患者生存預后更差（Plt;0.05），富集差異分析及共表達基因富集發現CHMP2B 在腎透明細胞癌中主要涉及病毒出芽、壞死性凋亡、內吞作用等，并涉及免疫調節過程。結論 CHMP2B在腎透明細胞癌組織中低表達，可有效影響腫瘤進展和腫瘤免疫過程，是一種有前途的預后分子標志物及治療靶點。……