基于CiteSpace 的非編碼RNA與動脈粥樣硬化關系的可視化分析

陳心茹 高 峰 喬秀梅 薛彩彩 厲彥翔

濰坊醫(yī)學院藥學院“分子藥理學與轉化研究”山東省高校重點實驗室，山東濰坊 261053

非編碼RNA（non-coding RNAs，ncRNAs）是轉錄組中不翻譯為蛋白質的RNA 分子，包括微RNA、環(huán)狀RNA 和長鏈ncRNA 等[1-3]。ncRNAs 占人類細胞轉錄產物的60%，通常被認為是細胞轉錄過程的副產物[4]。隨著研究的深入，有越來越多的ncRNAs 被證明在許多細胞生物活動中具有調節(jié)功能并參與調節(jié)多種疾病的發(fā)生、發(fā)展[5-8]。相關研究證實，環(huán)狀RNA 及長鏈ncRNA 等ncRNAs 與動脈粥樣硬化的發(fā)生及疾病進程密切相關，ncRNAs 可能成為動脈粥樣硬化潛在關鍵靶點[9-10]。本研究采用CiteSpace 軟件對ncRNAs與動脈粥樣硬化研究現(xiàn)狀與熱點這一研究領域進行系統(tǒng)歸納，以期為研究者了解ncRNAs 與動脈粥樣硬化未來發(fā)展趨勢提供科學依據(jù)以及后續(xù)深入研究提供參考和借鑒[11]。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)來源

中文文獻檢索中國知網、萬方數(shù)據(jù)知識服務平臺、維普數(shù)據(jù)庫，英文文獻檢索PubMed 和Web of Science數(shù)據(jù)庫。檢索時間：2013 年1 月至2023 年8月。中文文獻檢索式：主題=“動脈粥樣硬化” and “非編碼RNA”；英文文獻檢索式：（TS=“atherosclerosis” or TS=“arteriosclerosis” or TS=“atherogenesis”）and（TS=“non-coding RNA” or TS=“ncRNA”）。

1.2 數(shù)據(jù)篩選

納入標準：①文獻類型為期刊論文、綜述；②文獻內容完整。排除標準：①研究內容與非編碼RNA 與動脈粥樣硬化領域不相關文獻；②重復發(fā)表；③科技成果、會議、新聞、通知、報道、征稿等。

1.3 數(shù)據(jù)可視化

將篩選后的文獻以RefWorks/純文本文件格式導出，應用CiteSpace 6.2.R3 軟件對導出的文獻進行轉換，并將轉換后的數(shù)據(jù)再次分別導入CiteSpace 運行，對作者、機構、關鍵詞進行可視化分析。

2 結果

2.1 檢索結果

檢索出中文文獻317 篇、英文文獻681 篇，嚴格按照納入標準與排除標準篩選，最終納入296 篇中文文獻和640 篇英文文獻。

2.2 發(fā)文量分析

近10 年來，ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究領域的年發(fā)文量總體呈上升趨勢。見圖1。

圖1 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究中英文文獻年發(fā)文量

2.3 合作情況分析

2.3.1 作者合作關系 在中文文獻中，胡炎偉發(fā)文量最大；而在英文文獻中，發(fā)文量最多的是Taheri Mohammad和Maegdefessel Lars。見圖2。

圖2 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究作者合作關系圖譜

2.3.2 研究機構分析 中文文獻發(fā)文量最高的是南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院，英文文獻發(fā)表最高的是Central South University。見圖3。

圖3 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究機構合作關系圖譜

2.4 研究熱點以及前沿趨勢分析

2.4.1 關鍵詞圖譜共現(xiàn)分析 文獻關鍵詞均涵蓋冠心病、炎癥、細胞增殖、細胞凋亡。見圖4。

圖4 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究文獻關鍵詞共現(xiàn)圖譜

2.4.2 關鍵詞變遷時間線分析#0 血管內皮、#0 endothelial cells 時間跨度持續(xù)整個橫軸。見圖5～6

圖5 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究中文文獻關鍵詞時間線圖譜

圖6 2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究英文文獻關鍵詞時間線圖譜

3 討論

NcRNAs 是一類內源性的不具有蛋白質編碼功能的RNA 分子，最初被認為不具有生物學功能[12-13]。然而，隨著研究的深入有越來越多的ncRNAs 被證明可能與許多代謝性疾病的進展有關，特別是動脈粥樣硬化[14-16]。本研究基于CiteSpace 軟件進行分析，結果顯示，ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究領域發(fā)文量呈快速增長趨勢，推測未來仍將持續(xù)成為研究熱點。在2013—2023 年，形成多個研究團隊。重要的是，通過研究機構分析發(fā)現(xiàn)，各研究機構間缺乏交流合作，未來應加強學術交流及合作。

由關鍵詞圖譜共現(xiàn)分析可知，ncRNAs 與動脈粥樣硬化領域研究主要聚焦疾病冠心病。研究進一步發(fā)現(xiàn)，ncRNAs 與動脈粥樣硬化領域研究內容主要為ncRNAs 對炎癥/ 炎癥反應、細胞凋亡、細胞增殖等的調控作用。由此可以看到，ncRNAs 參與了以動脈粥樣硬化為病理基礎的冠心病等心血管疾病的發(fā)生、發(fā)展[17-19]。

鑒于上述ncRNAs 在動脈粥樣硬化等疾病中的重要作用，研究者們已關注到ncRNAs 的作用及調控機制研究[20-21]。這與本文關鍵詞變遷時間線分析研究結果高度一致：ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究已從早期關注疾病進而細化到ncRNAs 作用及機制研究等方向。最初研究認為ncRNAs 是無編碼功能的RNA 分子，然而隨著研究發(fā)現(xiàn)這類RNA 具有調節(jié)基因表達和蛋白質功能的特性[22-23]。此外，近年來高通量技術的快速發(fā)展揭示了越來越多新的疾病關鍵差異ncRNAs[24-25]。

本研究應用CiteSpace 軟件對2013—2023 年ncRNAs 與動脈粥樣硬化研究文獻進行可視化分析，以期為ncRNAs 研究方向提供一定的理論依據(jù)。其分析結果顯示，目前研究內容主要集中在冠心病、炎癥、細胞增殖、細胞凋亡等方面。此外，未來ncRNAs 與動脈粥樣硬化將作為熱點持續(xù)存在并得到廣泛研究。

利益沖突聲明：本文所有作者均聲明不存在利益沖突。