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春玉米根系圖像語(yǔ)義分割最佳分辨率和概率閾值研究

2023-07-11 07:48:58趙先麗李榮平王笑影謝艷兵溫日紅賈慶宇
核農(nóng)學(xué)報(bào) 2023年8期

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(中國(guó)氣象局沈陽(yáng)大氣環(huán)境研究所,遼寧 沈陽(yáng) 110166)

根系作為作物的重要組成器官,是作物與土壤之間物質(zhì)循環(huán)和能量交換的關(guān)鍵因子[1]。根系形態(tài)結(jié)構(gòu)體現(xiàn)了作物生長(zhǎng)發(fā)育的狀態(tài)和對(duì)外界環(huán)境的適應(yīng)性,可以直接反映根系的生長(zhǎng)狀態(tài),間接反映作物對(duì)水分和養(yǎng)分的吸收情況,最終決定作物產(chǎn)量[2]。因此,根系形態(tài)結(jié)構(gòu)研究有助于闡明作物地下生物量的分配和養(yǎng)分循環(huán)過(guò)程,在一定尺度可以反映氣候、土壤和生物的總體特征[3],對(duì)提高作物生產(chǎn)潛力、養(yǎng)分和水分吸收利用效率意義重大[4-7]。

微根管法可以無(wú)損和原位觀測(cè)根系的生長(zhǎng)發(fā)育、形態(tài)、物候及整個(gè)生長(zhǎng)過(guò)程,為根系形態(tài)參數(shù)、生物量、碳循環(huán)等方面的研究提供了便利[7-9]。觀測(cè)獲得根系圖像的識(shí)別包括根對(duì)象的閾值化和對(duì)象量化兩部分,主要通過(guò)不同方法手動(dòng)、半自動(dòng)或自動(dòng)提取根系的信息[10],常用的根系圖像識(shí)別軟件,如WinRhizo、SmartRoot、RootGraph、Image J 和Adobe Photoshop 及網(wǎng)絡(luò)根系分析平臺(tái)等[11-12],在識(shí)別根系時(shí)主要以人眼識(shí)別和手描輪廓為主,可精確測(cè)量根系參數(shù)但工作量較大,尤其是對(duì)根系進(jìn)行精細(xì)分級(jí)存在很大困難[11,13]。前人關(guān)于玉米(ZeamaysL.)根系的研究大多采用WinRhizo 軟件進(jìn)行分析,主要開(kāi)展了根系分布[14-19]、構(gòu)型[20-25]和形態(tài)參數(shù)[6,19,26-27]等方面的研究,但有關(guān)圖像分割和根系統(tǒng)架構(gòu)分析等研究較為薄弱[11]。

深度學(xué)習(xí)(deep learning,DL)方法已廣泛應(yīng)用于根系研究中,作為圖像分割領(lǐng)域的重要分支,深度學(xué)習(xí)語(yǔ)義分割的出現(xiàn)為高分辨率圖像分割提供了新方向[28]。……

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