基于生物信息學分析KIF14在腎透明細胞癌的表達、功能及臨床意義

張孟釗,岳陽陽,姜云中,李 延,范晉海

(西安交通大學醫學院第一附屬醫院:1.泌尿外科,2.血管外科,陜西西安 710061)

腎細胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是腎臟腫瘤中最常見的病理類型,約占腎臟腫瘤的90%,也是成人泌尿系統最常見的惡性腫瘤之一,約占成人惡性腫瘤的2.2%[1-2]。其中腎透明細胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是腎細胞癌中最常見的類型,約占腎細胞癌的70%[3]。ccRCC起病隱匿,多數患者在就診時已經處于晚期而錯過了最佳的手術時機[4]。因此早發現、早診斷、早治療仍是改善ccRCC患者預后的首選策略。

KIF14是驅動蛋白家族(kinesin family member,KIFs)發揮重要作用的一員,其主要生物學功能為通過調控有絲分裂過程中紡錘體的形成、促進染色質的凝集、染色體和胞漿的分離這一完整的細胞有絲分裂過程,促進腫瘤的發生和發展[5]。雖然目前已有很多關于KIF14在腫瘤中發揮作用的報道,也證實KIF14在多種腫瘤惡性進展中發揮重要作用,但與ccRCC的相關性尚未有報道。本課題組通過數據分析并設計相關實驗,對KIF14在ccRCC中的表達譜,生物學功能及其與免疫細胞浸潤的相關性進行了初步探究,現報道如下。

1 材料與方法

1.1 KIF14在ccRCC組織和正常組織的表達差異分析在TCGA官網(https://portal.gdc.cancer.gov/)下載TCGA-KIRC轉錄組表達數據,包含539個腫瘤組織和72個癌旁正常組織。使用R語言對轉錄組數據進行處理和可視化分析。分析KIF14在ccRCC組織和癌旁組織的表達差異。GEO官網(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下載包含ccRCC腫瘤和正常組織的轉錄組數據并使用在線分析工具(GEO2R)進行在線分析,探究KIF14在ccRCC組織和正常組織之間的差異表達性。

1.2 KIF14蛋白的表達譜……