蛋白互作研究方法在水稻中的應用及主要互作數據庫匯總

陳麗娟　劉西西　羅金金　陳明花　匡瑜　田志宏　張健

摘要：實驗設計時選擇合適的方法，有利提高科研效率。綜述了多種研究蛋白質相互作用的方法，分析了各類方法的優缺點以及在水稻中的研究應用，歸納整理了現有的大型蛋白互作數據庫。

關鍵詞：水稻；蛋白質的相互作用；互作方法；互作數據庫

中圖分類號：Q753? ? ? ? ? ? ? ? 文獻標志碼：A? ? ? ? ? ? ? ? 文章編號：2097-2172（2023）01-0082-06

doi：10.3969/j.issn.2097-2172.2023.01.019

Application of Protein Interaction Research Methods in Rice Genetic Engineering and Summary of Large Interaction Network Database

CHEN Lijuan 1， LIU Xixi 2， LUO Jinjin 2， 3， CHEN Minghua 3， KUANG Yu 3， TIAN Zhihong 1， ZHANG Jian 2， 3

（1. College of Life Science， Yangtze University， Jingzhou Hubei 434025， China; 2. China National Rice Research Institute，

Hangzhou Zhejiang 311400， China; 3. State Key Laboratory of Rice Biology， Hangzhou Zhejiang 311400， China;

4. Bureau of Agriculture and Rural Affairs of Liling， Zhuzhou Hunan 412205， China）

Abstract： Studying the interaction between proteins is very important for rice genetic improvement， disease resistance and yield increase， and improving rice quality. This paper introduces a variety of methods for studying protein-protein interaction， analyzes the advantages and disadvantages of various methods， as well as their research and application in rice. The existing large protein interaction database was summarized for reference by researchers.

Key words： Rice; Protein-protein interaction; Interaction method; Interaction database

蛋白質是各種基本功能的主要完成者，蛋白質-蛋白質相互作用（protein-protein interaction）幾乎參與所有細胞生命活動的進程，從分子層面研究細胞均離不開對互作蛋白的鑒定和功能解析。蛋白質是生命活動的承擔者，大部分蛋白質主要通過相互作用或形成蛋白復合物來行使功能。水稻作為重要的模式生物，通過檢測蛋白質之間的相互作用來探索其生長發育分子機制，以改善水稻品質。隨著蛋白組學的發展，蛋白互作技術日新月異，了解檢測各種蛋白互作技術方法的優缺點，在實驗設計時選擇合適的方法，能大大提高科研效率。

1? ?蛋白質相互作用的研究方法及其在水稻中的應用

在水稻中篩選蛋白質互作的試驗方法眾多，主要可以分為兩個大類，即活體內試驗（in vivo）和生物活體外試驗（in vitro）［1? ］。

1.1? ?活體內試驗

體內試驗能真實地反應生物體內的蛋白互作情況，所以目前開發的方法多為體內試驗，主要包括酵母雙雜交、分裂泛素系統、細菌雙雜交、雙分子熒光互補、免疫共沉淀、鄰近標記、表面等離子共振技術、噬菌體展示技術、熒光共振能量轉移技術等方法?！?br>