新冠肺炎疫情后急性病毒性呼吸道感染多病原監(jiān)測的預警研究及應用

徐剛，冉鑫，肖大瑾，熊英，龔甜

（江西省疾病預防控制中心，江西 南昌 330029）

2020 年初，新型冠狀病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19),簡稱"新冠肺炎"迅速蔓延，席卷全世界，對全球的經(jīng)濟、社會造成了巨大的沖擊。截至12 月2 日，全球確診病例超6 400 萬例，死亡破147 萬例，新冠肺炎疫情防控形式依然十分嚴峻。為了及時甄別新冠肺炎疫情，為不明原因發(fā)熱等暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預警預測提供實驗室關鍵數(shù)據(jù)，本實驗室對新冠肺炎疫情后4 月份（2020 年第18 周）至10 月份哨點醫(yī)院的流感樣病例進行了6 種引起呼吸道傳染病的重要病毒進行監(jiān)測，并對期間進行2 起暴發(fā)疫情進行實驗室檢測，了解江西省新冠肺炎疫情后急性病毒性呼吸道傳染病的病原譜，為暴發(fā)疫情預警預測和防控提供實驗室證據(jù)，現(xiàn)將研究結果報告如下。

1 材料與方法

1.1 樣本采集 每周采集江西省流感監(jiān)測哨點醫(yī)院 （南昌大學第一附屬醫(yī)院）出現(xiàn)發(fā)熱 （體溫≧38℃），伴咳嗽或咽痛等呼吸道感染的流感樣病例咽拭子樣本不少于20 份；及時采集呼吸道感染暴發(fā)疫情病例。

1.2 樣本檢測

1.2.1 病原核酸提取 使用核酸自動提取儀（QIAxtractor，Qiagen 公司）和Cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit（Cat No：54161，Qiagen 公司）對200μL 樣本進行樣本核酸提取，按試劑盒說明書進行操作。

1.2.2 病毒核酸檢測 運用本實驗室前期建立的Real-time RT-PCR 和Real-time PCR 方法[1]對樣本進行6 種引起呼吸道傳染病的重要病毒核酸快速檢測, 其中包括新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、鼻病毒、腺病毒、博卡病毒和偏肺病毒。

2 結果

2.1 多病原監(jiān)測結果 2020 年4 月份至10 月份共采集樣本670 份，5 月14 日開始檢出陽性樣本，共檢出陽性樣本91 份（13.58%），其中鼻病毒70 份（10.45%），流感病毒12 份（1.79%），腺病毒7 份(1.04%)，博卡病毒2 份(0.03%)。鼻病毒自5 月14日開始每周均檢出陽性樣本，在2020 年第27 周（6 月1 日至6 月7 日）出現(xiàn)高峰，見圖1。

圖1 流感樣病例多病原檢測結果

2.2 病毒性呼吸道傳染病暴發(fā)疫情監(jiān)測結果 共發(fā)生三起發(fā)熱呼吸道感染暴發(fā)疫情，其中2020 年5 月27 日至2020 年6 月6 日兩起發(fā)生于江西省兩地，分別采集樣本16 份和13 份，檢出鼻病毒陽性樣本分別為7 份和8 份，陽性率分別為43.75%和61.54%；2020 年8 月的一起疫情采集標本3份，均檢出腺病毒陽性。

3 討論

急性病毒性呼吸道傳染病是一種由新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠狀病毒、偏肺病毒和腸道病毒等病毒引起的，早期臨床癥狀相似,為發(fā)熱等流感樣癥狀[2-10]。

本研究對2020 年4 月至10 月份流感哨點醫(yī)院流感樣病例標本進行新冠肺炎病毒、流感病毒等18 種引起呼吸道傳染病的病原核酸快速檢測，發(fā)現(xiàn)新冠肺炎疫情后2020 年第24 周 （5 月11 日至5 月17 日）開始出現(xiàn)急性病毒性呼吸道感染病例，發(fā)病率為13.58%，病毒類型主要為鼻病毒（10.45%）、流感病毒（1.79%）和腺病毒（1.04%）。鼻病毒感染率遠高于其他病毒，鼻病毒主要引起普通感冒，本研究結果中，自2020 年第24 周（5 月11 日至5 月17 日）開始一直出現(xiàn)鼻病毒感染病例，在5 月底發(fā)生了兩起由鼻病毒感染引起的急性病毒性呼吸道感染暴發(fā)疫情，也是我省首次發(fā)現(xiàn)首次由實驗鼻病毒感染引起的暴發(fā)疫情。而腺病毒在第34 周（6 月29 日至7 月3 日）開始檢出陽性樣本，在8 月發(fā)生了一起由腺病毒感染引起的急性發(fā)熱呼吸道感染暴發(fā)疫情。急性病毒性呼吸道感染暴發(fā)疫情前半個月至一個月均監(jiān)測到相應病原開始流行，提示發(fā)熱呼吸道感染多病原監(jiān)測可以對疫情暴發(fā)起到預警預測作用。

目前，我國除流感病毒外,尚未建立腺病毒等其他呼吸道病毒的監(jiān)測系統(tǒng),其他呼吸道病毒的流行特征不清楚,不利于急性病毒性呼吸道傳染病暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預警預測。根據(jù)本研究結果，建議依托全國省市兩級流感實驗室網(wǎng)絡，進行每周一次新冠肺炎病毒、流感病毒（甲型和乙型）、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠狀病毒、偏肺病毒和腸道病毒等多病原監(jiān)測，對急性病毒性呼吸道傳染病疫情的防治、不明原因發(fā)熱等暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預警預測和減少社會恐慌具有非常重要的意義。