基因組監測促使巴西家禽沙門菌成為焦點

林子怡 譯自，2022 年6 月17 日

李紅 校

借助基因組測序技術，研究人員對集約化家禽生產對全球公共衛生的影響有了更好了解。

研究人員對巴西雞群的沙門菌（Salmonella）進行了基因組監測，以了解巴西養雞業的發展對行業內傳播的沙門菌的分布情況的影響。

1 人類、動物和環境的健康

英國-巴西聯合研究表明，雖然目前巴西沙門菌對雞肉進口國（如英國）沒有直接的健康風險，但對抗菌藥具有耐藥性。這凸顯了采取“生命共同體”理念的重要性，這一理念強調了人、動物和環境健康之間的聯系，尤其是在評估全球食品供應鏈時。

目前，巴西每年生產近1 400 萬t 雞肉，是全球最大的雞肉出口國。此前已有研究表明，進口到英國和歐盟成員國的雞肉中存在沙門菌。這些細菌是導致腹瀉病常見病因之一，它們也可能攜帶某些基因，使其對用于治療人類感染的抗生素產生耐藥性。

2 巴西家禽中沙門菌的調查

為了調查巴西家禽沙門菌感染情況及對食品安全的潛在風險，英國東英吉利大學（University of East Anglia）Quadram 研究所和巴西圣保羅大學（University of San Paulo）的研究人員對從巴西雞群中采集的沙門菌樣本進行了基因組調查（作為時間跨度為7 年的細菌常規監測的一部分）。研究人員將巴西出口到英國和其他歐洲國家的家禽產品中的沙門菌基因組與英國人和英國本土家禽的沙門菌基因組及世界各地數百個沙門菌基因組進行了序列比對。

該研究發現了數十種不同類型的沙門菌，其中海德堡株和明尼蘇達株最常見，比例為91%，而引起食物中毒的腸炎沙門菌（Salmonella Enteritidis）僅占樣本的2%。

3 可引發感染的沙門菌類型

研究團隊與英國衛生安全局合作，從15年前的樣本中研究了導致感染的沙門菌類型。大約每200 人中有1 人感染海德堡株或明尼蘇達株，其中一些人可能與國外旅行史有關。重要的是，將巴西海德堡株和明尼蘇達株的基因組與從世界各地收集和保存的其他菌株基因組進行序列比對發現，巴西沙門菌形成了一個與人類病例不同的獨特亞群。此外，研究團隊與動植物衛生署（Animal and Plant Health Agency，APHA）的合作發現，在英國雞群中暫未發現相關的巴西沙門菌菌株。

Quadram 研究所的共同負責人Alison Mather 教授說：“我們的發現表明，從巴西進口的家禽產品中的沙門菌并未給英國消費者造成重大疾病負擔。”

研究人員相信，巴西雞群中的新型沙門菌源自2006 年左右出現的一個共同祖先，可能與3 年前引進的腸炎沙門菌疫苗有關。

巴西圣保羅大學的Andrea Mickie Moreno 教授及其同事補充道：“研究結果表明，對涉及動物和人類的沙門菌等重要病原體的持續監測，對了解在特定群體中實施的預防和控制方案的效果極其重要。”

在人類干預（如疫苗開發）之后，沙門菌的主要血清型也發生了類似變化，這為其他研究人員進一步研究創造了機會。研究人員發現，海德堡沙門菌和明尼蘇達沙門菌都攜帶一組特定基因，使其對不同種類的抗生素（如磺胺類、四環素類和雙內酰胺類）產生耐藥性。這可能使這些類型的沙門菌在抗生素使用率較高的巴西家禽生產環境中具有競爭優勢。

第一作者Nabil-Fareed Alikhan 博士說：“我們在這個項目上的合作令人興奮。在大家的共同努力下，我們有了獨立的數據來判斷這些類型的沙門菌及其對整個食品生產鏈的影響。”

“巴西家禽業中腸道沙門菌和抗生素耐藥性動態以及對全球公共健康的影響”(Dynamics ofSalmonella entericaand antimicrobial resistance in the Brazilian poultry industry and global impacts on public health) 這篇文章發表在PLOS Genetics雜志上，并得到生物技術和生物科學研究委員會、圣保羅研究基金會的支持。