16SrRNA測序法檢測家兔口腔內細菌種屬及其豐度的研究

張芙蕊，陳璟恒，郭夢雅，張愛馨，李和平

（東北林業大學 野生動物與自然保護地學院，哈爾濱 150040）

動物的消化道和口腔中棲居著大量微生物，它們參與飼料的分解和轉化［1］。口腔微生物包括細菌、真菌、古細菌和病毒等全部微生物總和，具有復雜的微生物群落［2］。動物口腔微生物多樣性的研究相對腸道較少。不同動物口腔中穩定的優勢菌群不同，如倉鼠（Cricetidae）頰囊以德克斯氏菌屬（Derxia）為優勢菌群［3］，短尾猴（Macacathibetana）口腔中優勢菌群主要為鏈球菌屬（Streptococcus）和奈瑟氏菌屬（Neisseria）［4］，犬類（Canis lupus）口腔中卟啉單胞菌屬（Porphyromonas）為主要菌群［5］。口腔微生物系統是動物整體微生物系統的組成部分，其中含有致病菌群，可通過協同、頡頏和毒力因子中和作用等方式達到動態平衡或引發特定疾病，口腔微生物菌群間相互作用的穩定機制對維持動物機體健康起到至關重要的作用［6］。保守區域和高可變區域，因此16SrRNA分子是研究微生物群落最佳靶分子，可通過16S rRNA保守區序列設計通用引物進行PCR擴增，利用可變區序列進行細菌種屬鑒定分類［7］。目前，16S rRNA基因測序技術在微生物生態學領域應用廣泛［8］，是目前研究腸道和口腔菌群的重要方法之一，該方法可以直接和全面地分析細菌的基因序列，對菌種進行精確定量鑒定，是現階段研究微生物菌種豐度的主要方法之一［9-10］。

在家兔（Oryctolagus cuniculus）口腔中，細菌菌落棲居情況尚不清楚。因此，為了探究其口腔細菌群落結構，本試驗利用16S rRNA測序技術，通過分析家兔口腔微生物菌種及豐度，確定家兔口腔內細菌種類和優勢種群，旨在為家兔的口腔微生物生理作用提供基礎的科學參考。……