董奕鑫,張歡歡,王昌會,陳昊,李孝誠
抗乳腺癌候選藥物的優化模型
董奕鑫,張歡歡,王昌會,陳昊,李孝誠
(淮北師范大學 數學科學學院,安徽 淮北 235000)
根據華為杯中國研究生數學建模競賽D題所提供的ERα拮抗劑信息,綜合運用灰色關聯度分析、BP神經網絡、決策樹、回歸模型等方法和理論,借助MATLAB,SPSS,GeoGebra等軟件,構建了化合物生物活性的定量預測模型和ADMET性質分類預測模型,并在此基礎上建立抗乳腺癌候選藥物的優化模型,篩選出適合用于抗乳腺癌候選藥物的化合物.經檢驗發現,模型均具有良好的性能,可將其應用于虛擬藥物篩選流程,為計算機輔助藥物設計與藥物發現提供參考.
抗乳腺癌候選藥品;灰色關聯度分析;BP神經網絡;決策樹分類預測模型
本文研究的問題引自2021年華為杯中國研究生數學建模競賽D題[1].乳腺癌是目前世界上最常見、致死率較高的癌癥之一.乳腺癌的發展與雌激素受體密切相關,有關研究發現,雌激素受體亞型(ER)在乳腺發育過程中扮演了十分重要的角色[2].因此,ER被認為是治療乳腺癌的重要靶標,能夠拮抗ERα活性的化合物可能是治療乳腺癌的候選藥物[3].一個化合物想要成為候選藥物,不僅需要具備良好的生物活性(此處指抗乳腺癌活性),還需要在人體內具備良好的藥代動力學性質和安全性,合稱為ADMET(Absorption吸收、Distribution分布、Metabolism代謝、Excretion排泄、Toxicity毒性)性質[4-5].
目前,對于活性化合物的篩選,通常采用建立化合物活性預測模型的方法.即針對與疾病……