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盆腔惡性腫瘤患者放療后腸道菌群變化與放射性腸炎的相關(guān)性研究

2022-07-06 07:43:40朱小月江柯煒陳海嬌朱琳張婷劉鵬飛吳群英王堅殷華芳沈衛(wèi)東
關(guān)鍵詞:物種差異分析

朱小月,江柯煒,陳海嬌,朱琳,張婷,劉鵬飛,吳群英,王堅,殷華芳,沈衛(wèi)東

(1.徐州醫(yī)科大學(xué),江蘇 徐州 221000; 2.徐州醫(yī)科大學(xué)附屬江陰臨床學(xué)院,江蘇 江陰 214400)

1 資料與方法

1.1 一般資料

選取 2020 年 10月至 2021 年 6 月徐州醫(yī)科大學(xué)附屬江陰臨床學(xué)院收治的首次接受放射治療的17例ⅠB~Ⅳ期盆腔惡性腫瘤患者,其中宮頸癌13例,子宮內(nèi)膜癌4例。按照放射反應(yīng)分級標(biāo)準(zhǔn)分為3組:0級(無癥狀組)患者6例,1級(輕癥組)患者5例,≥2級(重癥組)患者6例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1) 組織病理學(xué)確診宮頸癌或子宮內(nèi)膜癌;(2) 根據(jù)《常見婦科惡性腫瘤診治指南(第 5 版)》接受規(guī)范放化治療[11]。排除標(biāo)準(zhǔn):(1) 有嚴(yán)重的心、肝、腎等功能障礙;(2) 既往有腸道疾病及代謝性疾病,如直腸腫瘤、潰瘍性結(jié)腸炎、克隆病等腸道器質(zhì)性疾病;(3) 嚴(yán)重急慢性感染性疾病;(4) 3級以上骨髓抑制。所有患者均首次接受盆腔放射治療,單次放射劑量為1.8 Gy,5次·周-1,放療總劑量40~50 Gy。本研究經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn),所有操作均征得研究對象或其親屬的知情同意。

1.2 RE診斷分級標(biāo)準(zhǔn)

按照1995年美國放射腫瘤學(xué)協(xié)作組(Radiation Therapy Oncology Group,RTOG)和歐洲癌癥治療研究組織(European Organzation for Research and Treatment of Cancer,EORTC)[12]標(biāo)準(zhǔn)進行放射反應(yīng)評級。將RE分為 0~5 級。0 級:無變化;1級:不需藥物處理的大便次數(shù)增加或習(xí)慣的改變,不需止痛藥的直腸不適;2級:需抗副交感神經(jīng)藥的腹瀉,不需衛(wèi)生紙的黏液排出或需止痛藥的直腸或腹痛;3級:需胃腸外營養(yǎng)支持的腹瀉,需衛(wèi)生紙的出血、腹脹(X線平片證實擴張腸環(huán));4級:急性或亞急性腸梗阻、穿孔、竇管,需輸血的出血和需胃腸減壓或腸管改道的腹痛或里急后重。

1.3 方法

1.3.1 樣本收集 前期臨床觀察及預(yù)實驗結(jié)果提示,在放療進程第3周及放療總劑量在20~30 Gy,患者臨床癥狀及血清學(xué)指標(biāo)動態(tài)變化處于峰值平臺期。本研究分別在放療前、放療第3周采集患者清晨空腹靜脈血及糞便各1次。留取糞便標(biāo)本2 g,使用專用保存管于-80℃冰箱保存。抽取靜脈血6 ml,以3 000 r·min-1離心10 min,取上層血清,-80 ℃保存?zhèn)錅y。

1.3.2 腸道菌群檢測 采用16S rDNA測序及生物統(tǒng)計分析,對糞便樣品的基因組DNA進行提取,對微生物 16S rDNA 的高變區(qū)進行特異性擴增,根據(jù)所擴增的區(qū)域特點構(gòu)建小片段文庫,并基于illumina NovaSeq測序平臺對文庫進行雙末端測序。使用QIIME2軟件中的DADA2方法進行拼接、去低質(zhì)量、去嵌合體和降噪,從而獲得最終的ASVs(Amplicon Sequence Variants)。隨后對得到的有效數(shù)據(jù)進行序列分析以及物種注釋,收集樣本物種構(gòu)成情況。α多樣性的評估:Chao1指數(shù)表示菌群豐度;Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)表示菌群多樣性。β多樣性的評估,采用非加權(quán)UniFrac距離NMDS(nonmetric multidimensional scaling)分析。物種差異分析及標(biāo)志物種的尋找,采用LEfSe(LDAEffect Size)分析及Metastats分析[13]。檢測分析由北京諾禾致源科技股份有限公司代理完成。

1.4 統(tǒng)計學(xué)處理

2 結(jié) 果

2.1 放療患者臨床特征與RE關(guān)系

本研究放療患者年齡、病理類型、臨床病理分期、腫塊大小、高血壓患病率等基線資料比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05),見表1。

表1 放療患者臨床特征與RE發(fā)生關(guān)系

2.2 放療前、放療第3周血清及糞便中LPS、TN α、I 1β和HMGB1表達水平比較

表2 3組患者血清及糞便炎癥因子水平比較 pg·ml-1

2.3 腸道微生物菌群特征與RE嚴(yán)重程度的關(guān)系

2.3.1 盆腔惡性腫瘤患者放療前后腸道菌群α多樣性分析 放療前3組間Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。與放療前相比,放療第3周重癥組和輕癥組Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)均較前下降,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),無癥狀組放療前后Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。經(jīng)協(xié)方差分析(以放療前數(shù)據(jù)為協(xié)變量),3組間放療第3周Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),放療第3周重癥組和輕癥組Chao1指數(shù)低于無癥狀組,重癥組Shannon指數(shù)低于無癥狀組,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。3組間放療第3周Simpson指數(shù)差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見圖1。

圖1 腸道細菌群落α多樣性指數(shù)對比柱狀圖

2.3.2 盆腔惡性腫瘤患者放療前后腸道菌群β多樣性分析 采用非加權(quán)UniFrac距離NMDS(nonmetric multidimensional scaling)分析,對3組患者腸道細菌群落結(jié)構(gòu)進行β多樣性顯著性分析,結(jié)果示組間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。放療前3組β多樣性比較存在較大差異(Stress=0.000 081,圖2A);放療第3周3組間β多樣性差異也有所變化(Stress=0.042,圖2B)。

A.放療前;B.放療第3周。Stress<0.1說明結(jié)果可靠圖2 放療前及放療第3周組間基于非加權(quán)UniFrac距離NMDS β多樣性分析

2.3.3 腸道微生物之間物種差異分析及標(biāo)志物種的尋找 尋找組間患者腸道微生物之間豐度差異較大的物種,通過LEfSe分析發(fā)現(xiàn)放療前無癥狀組Prevotellaceae科、Prevotella屬和Prevotella_copri種等豐度較高,輕癥組Mitochondria屬、Mitochondria科和Erysipelatoclostridium屬等豐度較高,重癥組Clostridium_methylpentosum_group屬和CAG_56屬等豐度較高。在經(jīng)過3周放療,研究組樣本間的微生物差別也有所改變,從LEfSe來看,相比之下重癥組豐度更高的物種有Peptostreptococcaceae科、Peptostreptococcales_Tissierellales目和Romboutsia屬等。Metastate分析從門、綱、目、科、屬、種6個等級層面進一步尋找組間差別顯著性較大的物種,在種的水平上發(fā)現(xiàn)放療第3周重癥組較輕癥組及無癥狀組均顯著上調(diào)的物種Nitrospira_japonica(P值分別為0.021、0.003)。較放療前,重癥組患者第3周糞便中bacterium_TG160種顯著上調(diào)(P=0.006),且明顯高于輕癥組(P=0.017)。另外,在放療前患者糞便中發(fā)現(xiàn)重癥組Castellaniella屬顯著高于輕癥組和無癥狀組(P值分別為0.021、0.022)。

2.4 相關(guān)性分析

表3 腸道菌群α多樣性指數(shù)與炎癥因子的相關(guān)性

3 討 論

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