AI助力“撈出”腸道菌群中耐藥菌“殺手”

在人體的“宇宙”中，居住著數百萬種微生物。它們相生相克、相互制衡，維持著人體健康的微生態平衡。

很多常見耐藥菌，如金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、大腸桿菌等都是人體共生的“原住民”。而人體中同樣存在著克制它們的微生物及其代謝產物。找到這些耐藥菌的“克星”作為藥物是當前生命科學領域的前沿問題。

如何在數以千萬億計的人體微生物“居民”中“撈出”這些耐藥菌的天然“殺手”呢？面對這一難題，中國科學院微生物研究所研究員陳義華和王軍團隊合作，利用機器學習的方法，從一萬多個腸道微生物中“海淘”出3個具有顯著活性和安全性的抗菌肽“潛力股”。相關研究3月4日發表于《自然—生物技術》。

“整個研究令人振奮！從人體腸道微生物組挖掘抗菌肽的方法十分新穎。”該刊一位審稿人評論說。

科學家認為，人體腸道中龐大的微生物“居民”中也蘊含著與耐藥病原菌共生的克星，它們的代謝產物能夠抑制耐藥菌的活性。

抗菌肽（AMPs）就是這樣一類具有抗微生物活性的小肽（序列在幾個到幾十個氨基酸殘基之間）。以往研究發現，它們經過簡單的后修飾或不經任何修飾就能直接發揮作用，達到抑制病原微生物的效果。它們能抵御多重耐藥菌，同時不易產生耐藥性的抗菌肽，被認為是可能替代傳統抗生素的下一代抗菌劑。

◎ 來源|中國科學報